2'-Deoxy-5'-O-dimethoxytrityl-4-thiouridine | 127117-78-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 2'-Deoxy-5'-O-dimethoxytrityl-4-thiouridine
• CAS: 127117-78-6
• 化学式: C₃₀H₃₀N₂O₆S
• 分子量: 546.644
• InChiKey: FIDRTARKUSQYQX-ZRRKCSAHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.21
• 重原子数：
  39.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  92.04
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5'-O-dimethoxytrityl-4-S-pivaloyloxymethyl-2'-deoxy-4-thiouridine 在 吡啶 、 氨 作用下， 生成 2'-Deoxy-5'-O-dimethoxytrityl-4-thiouridine
  参考文献：
  名称：

  含硫取代的核碱基的二核苷酸磷酸酯的合成：4-硫尿嘧啶，4-硫胸腺嘧啶和6-巯基嘌呤

  摘要：

  硫取代的核碱基的S-新戊酰氧基甲基化能够在溶液中合成含硫修饰残基的4-磷酸尿嘧啶，4-硫代胸腺嘧啶和6-巯基嘌呤的二核苷酸磷酸酯

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)77675-1

文献信息

• Synthesis of Metal-Chelating Deoxycytidine-Analogue Phosphoramidites for the Automatic Synthesis of Labelled Oligonucleotides
  作者：Cesare Giordano、Cristina Del Bianco、Sara Faini、Anna Napoli、Giovanni Sindona、Luciano Cellai

  DOI：10.1055/s-2004-829143

  日期：——

  The new deoxycytidine (dC) analogue phosphoramidites 1-3 were synthesized, which bear an ethylenediaminetetraacetic acid triethyl ester [EDTA(OEt) 3 ] attached to the exocyclic amino group through either a cyclic-C 6 , a C 2 , or a linear-C 6 tether. By this way, the chelating base dC-EDTA can be inserted, by automatic synthesis, in a site-specific manner into oligodeoxynucleotides (ODNs), in place

  合成了新的脱氧胞苷 (dC) 类似物亚磷酰胺 1-3，它带有一个乙二胺四乙酸三乙酯 [EDTA(OEt) 3 ]，通过环状-C 6 、C 2 或线性- C 6 系绳。通过这种方式，螯合碱基 dC-EDTA 可以通过自动合成以位点特异性方式插入到寡脱氧核苷酸 (ODN) 中，代替序列中的任何 dC，因此可以用于例如足迹实验。此外，还制备了具有通过环状-C 6 系链连接的二亚乙基三胺五乙酸四乙酯[DTPA(OEt) 4 ]的类似物亚磷酰胺4。验证了将 1-4 插入 ODN 的可能性。