5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-amino-3'-deoxyuridine | 215176-71-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-amino-3'-deoxyuridine
• 英文别名: DMT(-5)Ribf3N(b)-uracil-1-yl；1-[(2R,3R,4S,5S)-4-amino-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-hydroxyoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 215176-71-9
• 化学式: C₃₀H₃₁N₃O₇
• 分子量: 545.592
• InChiKey: BLVVOMXLSWRJAQ-YULOIDQLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.4
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  133
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-amino-3'-deoxyuridine 在 tris(triazolyl)phosphine oxide 作用下， 生成 Phosphoric acid mono-[(2R,3R,4R,5S)-5-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-2-(2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-4-(2,2,2-trifluoro-acetylamino)-tetrahydro-furan-3-yl] ester
  参考文献：
  名称：

  Diribonucleoside 3',5'-(3'-N-Phosphoramidates) 的水解反应：3'-Amino-3'-deoxyuridylyl-3',5'- P-O 和 P-N 键断裂的动力学和机制尿苷

  摘要：

  3'-amino-3'-deoxyuridylyl-3',5'-uridine (2a) 的水解反应是 3'-桥接氧被氮取代的 uridylyl-3',5'-尿苷的类似物。通过 RP HPLC 在很宽的 pH 范围内。在碱性条件下（pH > 9）发生的唯一反应是氢氧根离子催化水解（在 [OH(-)] 中的一级）生成 3'-氨基-3'-脱氧尿苷 3'-氨基磷酸酯的混合物 (7 ) 和尿苷 (4)。反应进行时没有可检测到的任何中间体的积累。在 pH 6-8 时，3'-氨基-3'-脱氧尿苷 2'-磷酸 (3) 的形成与 pH 无关，与碱催化裂解竞争。然而，3 和特别是 7 在这些条件下都相当迅速地去磷酸化为 3'-氨基-3'-脱氧尿苷 (5)。在所有的可能性，3 和 7 都是通过 2'-羟基官能团对磷原子的分子内亲核攻击形成的，产生类似正膦的中间态或过渡态。在中等酸性条件下（pH 2-6），主要反应是酸催化的

  DOI：

  10.1021/ja027499c
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-deoxy-3'-azidouridine 在 三苯基膦 、 ammonium hydroxide 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 22.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-amino-3'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  Diribonucleoside 3',5'-(3'-N-Phosphoramidates) 的水解反应：3'-Amino-3'-deoxyuridylyl-3',5'- P-O 和 P-N 键断裂的动力学和机制尿苷

  摘要：

  3'-amino-3'-deoxyuridylyl-3',5'-uridine (2a) 的水解反应是 3'-桥接氧被氮取代的 uridylyl-3',5'-尿苷的类似物。通过 RP HPLC 在很宽的 pH 范围内。在碱性条件下（pH > 9）发生的唯一反应是氢氧根离子催化水解（在 [OH(-)] 中的一级）生成 3'-氨基-3'-脱氧尿苷 3'-氨基磷酸酯的混合物 (7 ) 和尿苷 (4)。反应进行时没有可检测到的任何中间体的积累。在 pH 6-8 时，3'-氨基-3'-脱氧尿苷 2'-磷酸 (3) 的形成与 pH 无关，与碱催化裂解竞争。然而，3 和特别是 7 在这些条件下都相当迅速地去磷酸化为 3'-氨基-3'-脱氧尿苷 (5)。在所有的可能性，3 和 7 都是通过 2'-羟基官能团对磷原子的分子内亲核攻击形成的，产生类似正膦的中间态或过渡态。在中等酸性条件下（pH 2-6），主要反应是酸催化的

  DOI：

  10.1021/ja027499c