5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-C-trifluoroacetamidomethylthymidine | 179178-36-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-C-trifluoroacetamidomethylthymidine
• 英文别名: N-[[(2R,3R,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]methyl]-2,2,2-trifluoroacetamide
• CAS: 179178-36-0
• 化学式: C₃₄H₃₄F₃N₃O₈
• 分子量: 669.654
• InChiKey: XWSOQOVFCASPPU-DMBDEWFESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  48
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  136
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-C-trifluoroacetamidomethylthymidine 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 以60%的产率得到5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-C-trifluoroacetamidomethylthymidine 3'-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphoramidite)
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and Evaluation of Oligodeoxynucleotides Containing 3′-C-Aminomethyl-and 3′-C-Amethylthymidine

  摘要：

  3'-C-Aminomethyl- and 3'-C-methylthymidine were synthesized and incorporated into oligodeoxynucleotides. Hybridization and enzyme stability of the modified oligonucleotides containing the 3'-C-branched thymidines are discussed.

  DOI：

  10.1080/07328319708001361
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-C-(hydroxymethyl)thymidine 在 4-二甲氨基吡啶 、 氨 、 sodium hydride 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 甲醇 、 paraffin 为溶剂， 反应 27.5h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-C-trifluoroacetamidomethylthymidine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and Evaluation of Oligodeoxynucleotides Containing 3′-C-Aminomethyl-and 3′-C-Amethylthymidine

  摘要：

  3'-C-Aminomethyl- and 3'-C-methylthymidine were synthesized and incorporated into oligodeoxynucleotides. Hybridization and enzyme stability of the modified oligonucleotides containing the 3'-C-branched thymidines are discussed.

  DOI：

  10.1080/07328319708001361

文献信息

• US5712378A
  申请人：——

  公开号：US5712378A

  公开（公告）日：1998-01-27
• US6191266B1
  申请人：——

  公开号：US6191266B1

  公开（公告）日：2001-02-20
• US6743902B1
  申请人：——

  公开号：US6743902B1

  公开（公告）日：2004-06-01
• Synthesis and Evaluation of Oligodeoxynucleotides Containing 3′-<i>C</i>-Aminomethyl-and 3′-<i>C</i>-Amethylthymidine
  作者：Guangyi Wang、Patrick J. Middleton、Liyan He、Vesna Stoisavljevic、Wiliiied E. Seifert

  DOI：10.1080/07328319708001361

  日期：1997.4

  3'-C-Aminomethyl- and 3'-C-methylthymidine were synthesized and incorporated into oligodeoxynucleotides. Hybridization and enzyme stability of the modified oligonucleotides containing the 3'-C-branched thymidines are discussed.