2-((6-(4-cyanophenyl)thieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)thio)acetic acid | 1337875-40-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 噻吩并嘧啶酮衍生物
• 英文名称: 2-((6-(4-cyanophenyl)thieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)thio)acetic acid
• 英文别名: 2-[6-(4-Cyanophenyl)thieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl]sulfanylacetic acid
• CAS: 1337875-40-7
• 化学式: C₁₅H₉N₃O₂S₂
• 分子量: 327.387
• InChiKey: TWQVHRFBPFODIM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.07
• 拓扑面积：
  140
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  4-氯噻吩并[3,2-d]嘧啶 在 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 potassium carbonate 、 三乙胺 、 lithium hydroxide 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 13.33h， 生成 2-((6-(4-cyanophenyl)thieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)thio)acetic acid
  参考文献：
  名称：

  暗激酶 STK17B 的化学探针通过独特的 P 环构象获得其效力和高选择性

  摘要：

  STK17B 是死亡相关蛋白激酶家族的成员，在遗传上与多种疾病的发展有关。然而，STK17B 在正常和疾病病理学中的作用尚不明确。在这里，我们展示了噻吩并 [3,2-d] 嘧啶SGC-STK17B-1 ( 11s ) 的发现，这是一种针对这种尚未研究的“暗”激酶的高质量化学探针。11s是一种 ATP 竞争性抑制剂，对包括密切相关的 STK17A 在内的其他激酶显示出显着的选择性。11s的X射线晶体学和相关的与 STK17B 结合的噻吩并 [3,2-d] 嘧啶揭示了一种独特的 P 环构象，其特征在于 R41 和抑制剂的羧酸之间的盐桥。STK17B 的分子动力学模拟揭示了 P 环的灵活性和可用于载脂蛋白的各种 R41 构象。异构噻吩并[2,3-d]嘧啶SGC-STK17B-1N ( 19g )被鉴定为阴性对照化合物。19g对 STK17B 的活性降低 100 倍以上归因于其嘧啶 N1 的碱性降低。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.0c01174

文献信息

• Identification and SAR of a new series of thieno[3,2-d]pyrimidines as Tpl2 kinase inhibitors
  作者：Yike Ni、Ariamala Gopalsamy、Derek Cole、Yonghan Hu、Rajiah Denny、Manus Ipek、Julie Liu、Julie Lee、J. Perry Hall、Michael Luong、Jean-Baptiste Telliez、Lih-Ling Lin

  DOI：10.1016/j.bmcl.2011.07.069

  日期：2011.10

  We report here the synthesis and SAR of a new series of thieno[3,2-d]pyrimidines as potent Tpl2 kinase inhibitors. The proposed binding mode suggests the potential flipped binding mode depending on the substitution. Biacore studies show evidence of binding of these molecules to the protein kinase. The kinome inhibition profile of these molecules suggests good selectivity. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• A Chemical Probe for Dark Kinase STK17B Derives Its Potency and High Selectivity through a Unique P-Loop Conformation
  作者：Alfredo Picado、Apirat Chaikuad、Carrow I. Wells、Safal Shrestha、William J. Zuercher、Julie E. Pickett、Frank E. Kwarcinski、Parvathi Sinha、Chandi S. de Silva、Reena Zutshi、Shubin Liu、Natarajan Kannan、Stefan Knapp、David H. Drewry、Timothy M. Willson

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.0c01174

  日期：2020.12.10

  remarkable selectivity over other kinases including the closely related STK17A. X-ray crystallography of 11s and related thieno[3,2-d]pyrimidines bound to STK17B revealed a unique P-loop conformation characterized by a salt bridge between R41 and the carboxylic acid of the inhibitor. Molecular dynamic simulations of STK17B revealed the flexibility of the P-loop and a wide range of R41 conformations available

  STK17B 是死亡相关蛋白激酶家族的成员，在遗传上与多种疾病的发展有关。然而，STK17B 在正常和疾病病理学中的作用尚不明确。在这里，我们展示了噻吩并 [3,2-d] 嘧啶SGC-STK17B-1 ( 11s ) 的发现，这是一种针对这种尚未研究的“暗”激酶的高质量化学探针。11s是一种 ATP 竞争性抑制剂，对包括密切相关的 STK17A 在内的其他激酶显示出显着的选择性。11s的X射线晶体学和相关的与 STK17B 结合的噻吩并 [3,2-d] 嘧啶揭示了一种独特的 P 环构象，其特征在于 R41 和抑制剂的羧酸之间的盐桥。STK17B 的分子动力学模拟揭示了 P 环的灵活性和可用于载脂蛋白的各种 R41 构象。异构噻吩并[2,3-d]嘧啶SGC-STK17B-1N ( 19g )被鉴定为阴性对照化合物。19g对 STK17B 的活性降低 100 倍以上归因于其嘧啶 N1 的碱性降低。