A Chemical Probe for Dark Kinase STK17B Derives Its Potency and High Selectivity through a Unique P-Loop Conformation
作者:Alfredo Picado、Apirat Chaikuad、Carrow I. Wells、Safal Shrestha、William J. Zuercher、Julie E. Pickett、Frank E. Kwarcinski、Parvathi Sinha、Chandi S. de Silva、Reena Zutshi、Shubin Liu、Natarajan Kannan、Stefan Knapp、David H. Drewry、Timothy M. Willson
DOI:10.1021/acs.jmedchem.0c01174
日期:2020.12.10
remarkable selectivity over other kinases including the closely related STK17A. X-ray crystallography of 11s and related thieno[3,2-d]pyrimidines bound to STK17B revealed a unique P-loop conformation characterized by a salt bridge between R41 and the carboxylic acid of the inhibitor. Molecular dynamic simulations of STK17B revealed the flexibility of the P-loop and a wide range of R41 conformations available
STK17B 是死亡相关蛋白激酶家族的成员,在遗传上与多种疾病的发展有关。然而,STK17B 在正常和疾病病理学中的作用尚不明确。在这里,我们展示了噻吩并 [3,2-d] 嘧啶SGC-STK17B-1 ( 11s ) 的发现,这是一种针对这种尚未研究的“暗”激酶的高质量化学探针。11s是一种 ATP 竞争性抑制剂,对包括密切相关的 STK17A 在内的其他激酶显示出显着的选择性。11s的X射线晶体学和相关的与 STK17B 结合的噻吩并 [3,2-d] 嘧啶揭示了一种独特的 P 环构象,其特征在于 R41 和抑制剂的羧酸之间的盐桥。STK17B 的分子动力学模拟揭示了 P 环的灵活性和可用于载脂蛋白的各种 R41 构象。异构噻吩并[2,3-d]嘧啶SGC-STK17B-1N ( 19g )被鉴定为阴性对照化合物。19g对 STK17B 的活性降低 100 倍以上归因于其嘧啶 N1 的碱性降低。