5'-O-monomethoxytrityl-2'-O-(o-nitrobenzyl)ribothymidine | 86872-15-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-monomethoxytrityl-2'-O-(o-nitrobenzyl)ribothymidine
• CAS: 86872-15-3
• 化学式: C₃₇H₃₅N₃O₉
• 分子量: 665.7
• InChiKey: YCXWVSSTVVOUGQ-DYICDNQCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.61
• 重原子数：
  49.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  155.15
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-chlorophenyl phosphate 、 5'-O-monomethoxytrityl-2'-O-(o-nitrobenzyl)ribothymidine 在 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 30.0h， 以91%的产率得到Phosphoric acid 4-chloro-phenyl ester (2R,3R,4R,5R)-2-[(4-methoxy-phenyl)-diphenyl-methoxymethyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-4-(2-nitro-benzyloxy)-tetrahydro-furan-3-yl ester
  参考文献：
  名称：

  转移核糖核酸及其相关化合物的研究。XLI。含有修饰核苷的tRNA片段的合成。

  摘要：

  含有修饰核苷的 tRNA 片段是通过缩合含有修饰碱基的核苷酸或修饰寡核苷酸合成的。3'- 磷酸核苷酸是通过硅烷化碱基与受保护的 D-核糖缩合，然后进行磷酸化而制备的。含核糖胸苷的三聚体 T-Ψ-C 是用磷酸二酯法合成的。用磷酸二酯法合成了含核糖胸苷的六聚体 T-U-C-A-A-A 和含 2'-O- 甲基胞苷的六聚体 C-G-G-G-Cm-Up。通过还原和甲基化修饰三聚体，分别得到了含二氢尿苷的三聚体 D-A-G 和含 7-甲基鸟苷的三聚体 m7G-U-C。

  DOI：

  10.1248/cpb.31.513
• 作为产物：
  描述：

  5-甲基尿甙 在 N,N-二甲基甲酰胺 、 tin(ll) chloride 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 40.0h， 生成 5'-O-monomethoxytrityl-2'-O-(o-nitrobenzyl)ribothymidine
  参考文献：
  名称：

  转移核糖核酸及其相关化合物的研究。XLI。含有修饰核苷的tRNA片段的合成。

  摘要：

  含有修饰核苷的 tRNA 片段是通过缩合含有修饰碱基的核苷酸或修饰寡核苷酸合成的。3'- 磷酸核苷酸是通过硅烷化碱基与受保护的 D-核糖缩合，然后进行磷酸化而制备的。含核糖胸苷的三聚体 T-Ψ-C 是用磷酸二酯法合成的。用磷酸二酯法合成了含核糖胸苷的六聚体 T-U-C-A-A-A 和含 2'-O- 甲基胞苷的六聚体 C-G-G-G-Cm-Up。通过还原和甲基化修饰三聚体，分别得到了含二氢尿苷的三聚体 D-A-G 和含 7-甲基鸟苷的三聚体 m7G-U-C。

  DOI：

  10.1248/cpb.31.513