N⁴-(3-aminopropyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxycytidine | 807369-63-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N⁴-(3-aminopropyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxycytidine
• 英文别名: 4-(3-aminopropylamino)-1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 807369-63-7
• 化学式: C₃₃H₃₈N₄O₆
• 分子量: 586.688
• InChiKey: AUXZTVGIYFTSJN-ILJQZKEFSA-N

物化性质

• 沸点：
  750.2±70.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.27±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  128
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁴-(3-aminopropyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxycytidine 在 吡啶 、 二异丙基铵盐四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  [用于带有带有反应性残基的接头的寡核苷酸合成的单体：I。在杂环碱基中具有甲氧基草酰胺基的脱氧核苷衍生物的合成]。

  摘要：

  制备了用于标准亚磷酰胺寡脱氧核苷酸合成的许多单体，这些单体带有连接到胸苷，2'-脱氧胞苷和2'-脱氧腺苷杂环碱基上的反应性甲氧基草酰胺基。该论文的英文版：Russian Journal of Bioorganic Chemistry，2004年，第1卷。30号 3; 另请参见http://www.maik.ru。

  DOI：

  10.1023/b:rubi.0000030129.13466.18
• 作为产物：
  描述：

  N4-苯甲酰基-5′-O-(4,4′-二甲氧基三苯基)-2′-脱氧胞苷 、 1,3-丙二胺 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.0h， 以40%的产率得到N⁴-(3-aminopropyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  [用于带有带有反应性残基的接头的寡核苷酸合成的单体：I。在杂环碱基中具有甲氧基草酰胺基的脱氧核苷衍生物的合成]。

  摘要：

  制备了用于标准亚磷酰胺寡脱氧核苷酸合成的许多单体，这些单体带有连接到胸苷，2'-脱氧胞苷和2'-脱氧腺苷杂环碱基上的反应性甲氧基草酰胺基。该论文的英文版：Russian Journal of Bioorganic Chemistry，2004年，第1卷。30号 3; 另请参见http://www.maik.ru。

  DOI：

  10.1023/b:rubi.0000030129.13466.18

文献信息

• [EN] OLIGONUCLEOTIDE CONJUGATION<br/>[FR] CONJUGAISON D'OLIGONUCLEOTIDES
  申请人：LINK TECHNOLOGIES LIMITED

  公开号：WO2000031102A1

  公开（公告）日：2000-06-02

  The present invention provides a method for the conjugation of peptide molecules with oligonucleotide molecules by means of accessory molecules attached to the peptide or oligonucleotide molecules performing the Diels Alder reaction. Specifically, either a diene or dienophile moiety is attached to a peptide molecule, with the moiety which is not selected above being attached to an oligonucleotide, this attachement being facilitated by a number of possible ways. The pursuing Diels Alder reaction results in the diene and dienophile groups forming a sic membered cyclohexane ring structure which, due to the attachement of the diene and dienophile with the peptide and oligonucleotide molecules participating molecules in the reaction, serves to form a peptide oligonucleotide hybrid molecule.
• Monomers for Oligonucleotide Synthesis with Linkers Carrying Reactive Residues: I. The Synthesis of Deoxynucleoside Derivatives with Methoxyoxalamide Groups in Heterocyclic Bases
  作者：T. V. Abramova、S. V. Vasil'eva、T. M. Ivanova、G. V. Shishkin、V. N. Sil'nikov

  DOI：10.1023/b:rubi.0000030129.13466.18

  日期：2004.5

  A number of monomers for the standard phosphoamidite oligodeoxynucleotide synthesis that carry reactive methoxyoxalamide groups attached to the thymidine, 2'-deoxycytidine, and 2'-deoxyadenosine heterocyclic bases were prepared. The English version of the paper: Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 2004, vol. 30, no. 3; see also http://www.maik.ru.

  制备了用于标准亚磷酰胺寡脱氧核苷酸合成的许多单体，这些单体带有连接到胸苷，2'-脱氧胞苷和2'-脱氧腺苷杂环碱基上的反应性甲氧基草酰胺基。该论文的英文版：Russian Journal of Bioorganic Chemistry，2004年，第1卷。30号 3; 另请参见http://www.maik.ru。