(3R-(3α,4α,5β))-O-3-phospho-O-5-(1S-1-carboxy-1-(phosphooxy)-ethyl)shikimic acid | 625091-49-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 有机磷酸及其衍生物
• 英文名称: (3R-(3α,4α,5β))-O-3-phospho-O-5-(1S-1-carboxy-1-(phosphooxy)-ethyl)shikimic acid
• 英文别名: 5-(1-Carboxy-1-phosphonooxy-ethoxyl)-4-hydroxy-3-phosphonooxy-cyclohex-1-enecarboxylic acid；(3R,4S,5R)-5-[(1S)-1-carboxy-1-phosphonooxyethoxy]-4-hydroxy-3-phosphonooxycyclohexene-1-carboxylic acid
• CAS: 625091-49-8
• 化学式: C₁₀H₁₆O₁₄P₂
• 分子量: 422.176
• InChiKey: QUQKBSPZUVNKIF-JQCUSGDOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.1
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  238
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3R-(3α,4α,5β))-O-3-phospho-O-5-(1S-1-carboxy-1-(phosphooxy)-ethyl)shikimic acid 在 聚甘氨酸 作用下， 生成 磷烯醇丙酮酸 、 莽草酸 、 5-enol-pyruvoylshikimate 3-phosphate (EPSP) 、
  参考文献：
  名称：

  MurA 和 AroA 的四面体（α-羧基缩酮磷酸盐）中间体的非酶促分解，两种羧乙烯基转移酶。不同官能团的质子化控制着分解的速度和命运

  摘要：

  检查了羧乙烯基转移酶 MurA 和 AroA 的四面体中间体 (THI) 的非酶促分解机制，以阐明 THI 的固有反应性与用于促进催化的酶促策略之间的相互作用。THI 降解是通过磷酸盐离开和 CO 键断裂。它是酸催化的，取决于 α-羧基缩酮磷酸盐官能团的羧基的质子化状态，MurA 和 AroA THI 的电离分别为 pK(a) = 3.2 +/- 0.1 和 4.3 +/- 0.1。在 pL 2.0 下 MurA THI 的溶剂氘动力学同位素效应为 1.3 +/- 0.4，与一般酸催化一致。pK(a) 表明通过磷酸桥氧的质子化进行分子内一般酸催化，尽管 H(3)O(+) 催化也是可能的。产物分布随pH变化。在所有 pH 值下，尤其是低 pH 值下，主要的分解产物是丙酮酸 + 磷酸盐 + R-OH（R-OH = UDP-GlcNAc 或莽草酸 3-磷酸盐）。在较高的 pH 值下，观察到缩酮比

  DOI：

  10.1021/ja0349655
• 作为产物：
  描述：

  methyl (3R-4aR-(4aβ,8α,8aα))-3-(di-(2-(4-nitrophenyl)ethoxy)phosphinyloxy)-3-(dibromomethyl)-8-hydroxy-2-oxo-2,3,4a,5,8,8a-hexahydro-1,4-benzodioxin-6-carboxylate 在 四氮唑 、 sodium hydroxide 、 十六烷基三甲基溴化铵 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 间氯过氧苯甲酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 12.67h， 生成 (3R-(3α,4α,5β))-O-3-phospho-O-5-(1S-1-carboxy-1-(phosphooxy)-ethyl)shikimic acid
  参考文献：
  名称：

  5-Enolpyruvylshikimate 3-磷酸合酶：四面体中间体的化学合成和酶促反应立体化学过程的分配

  摘要：

  参与 5-enolpyruvylshikimate 3-磷酸合酶 (EPSPS) 催化的四面体中间体的两种非对映异构体的化学合成已经完成。二溴丙酮酸甲酯与受保护的莽草酸衍生物的组合、磷酸化和内酯化得到中间体 (S)-15 和 (R)-15，其构型由 NMR 指定。在引入 3-磷酸基团和脱保护后，在表面活性剂的存在下，在混合水性溶剂中用三丁基氢化锡完成二溴类似物 (S)-5 和 (R)-5 的光引发自由基脱溴，得到丙酮酸缩酮磷酸盐（ R)-TI 和 (S)-TI，分别。这些化合物在高 pH 值下稳定，但在 pH 值 7 时分解，半衰期约为 10 分钟。(R)-TI 被证明对 EPSPS 是惰性的，而 (S)-TI 被酶转化为 5-烯醇丙酮酸莽草酸 3-磷酸、莽草酸 3-磷酸和磷酸烯醇丙酮酸的混合物。酶中间体在缩酮中心具有 S 构型的证明证实了作为反加成和顺式消除的机制。此外，似乎第二步的顺式

  DOI：

  10.1021/ja036627+

文献信息

• Nonenzymatic Breakdown of the Tetrahedral (α-Carboxyketal Phosphate) Intermediates of MurA and AroA, Two Carboxyvinyl Transferases. Protonation of Different Functional Groups Controls the Rate and Fate of Breakdown
  作者：Bartosz Byczynski、Shehadeh Mizyed、Paul J. Berti

  DOI：10.1021/ja0349655

  日期：2003.10.1

  alpha-carboxyketal phosphate functionality, with ionizations at pK(a) = 3.2 +/- 0.1 and 4.3 +/- 0.1 for MurA and AroA THIs, respectively. The solvent deuterium kinetic isotope effect for MurA THI at pL 2.0 was 1.3 +/- 0.4, consistent with general acid catalysis. The pK(a)'s suggested intramolecular general acid catalysis through protonation of the bridging oxygen of the phosphate, though H(3)O(+) catalysis was also

  检查了羧乙烯基转移酶 MurA 和 AroA 的四面体中间体 (THI) 的非酶促分解机制，以阐明 THI 的固有反应性与用于促进催化的酶促策略之间的相互作用。THI 降解是通过磷酸盐离开和 CO 键断裂。它是酸催化的，取决于 α-羧基缩酮磷酸盐官能团的羧基的质子化状态，MurA 和 AroA THI 的电离分别为 pK(a) = 3.2 +/- 0.1 和 4.3 +/- 0.1。在 pL 2.0 下 MurA THI 的溶剂氘动力学同位素效应为 1.3 +/- 0.4，与一般酸催化一致。pK(a) 表明通过磷酸桥氧的质子化进行分子内一般酸催化，尽管 H(3)O(+) 催化也是可能的。产物分布随pH变化。在所有 pH 值下，尤其是低 pH 值下，主要的分解产物是丙酮酸 + 磷酸盐 + R-OH（R-OH = UDP-GlcNAc 或莽草酸 3-磷酸盐）。在较高的 pH 值下，观察到缩酮比
• 5-Enolpyruvylshikimate 3-Phosphate Synthase:  Chemical Synthesis of the Tetrahedral Intermediate and Assignment of the Stereochemical Course of the Enzymatic Reaction
  作者：Ming An、Uday Maitra、Ulf Neidlein、Paul A. Bartlett

  DOI：10.1021/ja036627+

  日期：2003.10.1

  been accomplished. Combination of methyl dibromopyruvate with a protected shikimic acid derivative, phosphorylation, and lactonization afforded the intermediates (S)-15 and (R)-15, whose configurations were assigned by NMR. After introduction of the 3-phosphate group and deprotection, photoinitiated radical debromination of the dibromo analogues (S)-5 and (R)-5 was accomplished with tributyltin hydride

  参与 5-enolpyruvylshikimate 3-磷酸合酶 (EPSPS) 催化的四面体中间体的两种非对映异构体的化学合成已经完成。二溴丙酮酸甲酯与受保护的莽草酸衍生物的组合、磷酸化和内酯化得到中间体 (S)-15 和 (R)-15，其构型由 NMR 指定。在引入 3-磷酸基团和脱保护后，在表面活性剂的存在下，在混合水性溶剂中用三丁基氢化锡完成二溴类似物 (S)-5 和 (R)-5 的光引发自由基脱溴，得到丙酮酸缩酮磷酸盐（ R)-TI 和 (S)-TI，分别。这些化合物在高 pH 值下稳定，但在 pH 值 7 时分解，半衰期约为 10 分钟。(R)-TI 被证明对 EPSPS 是惰性的，而 (S)-TI 被酶转化为 5-烯醇丙酮酸莽草酸 3-磷酸、莽草酸 3-磷酸和磷酸烯醇丙酮酸的混合物。酶中间体在缩酮中心具有 S 构型的证明证实了作为反加成和顺式消除的机制。此外，似乎第二步的顺式