P¹-5'-O-adenosine,P³-5'-O-uridine triphosphate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - （5'->5'）-二核苷酸
• 英文名称: P¹-5'-O-adenosine,P³-5'-O-uridine triphosphate
• 英文别名: Ap3U；[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] [[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] hydrogen phosphate
• 化学式: C₁₉H₂₆N₇O₁₈P₃
• 分子量: 733.373
• InChiKey: GEWWNAPEQBFWLF-KPKSGTNCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -7.6
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  367
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  22

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  P¹-5'-O-adenosine,P³-5'-O-uridine triphosphate 在 resin (Na⁺ form) 作用下， 生成 P(1)-adenosine-P(3)-uridine-5'-triphosphate trisodium salt
  参考文献：
  名称：

  溶液中具有生理活性的二核苷多磷酸盐的构象是什么？NMR和分子动力学模拟对游离二核苷多磷酸的构象分析†

  摘要：

  二核苷多磷酸盐或二核苷酸（Np n N'； N，N'= A，U，G，C；n = 2-7）是天然存在的生理活性化合物。尽管对二核苷酸的兴趣以及它们的构象与其生物学功能的相关性，但是对二核苷酸的构象的研究还不够充分。因此，在这里，我们通过各种NMR技术对一系列Np n N'Na +盐（N = A，G，U，C； N'= A，G，U，C；n = 2–5）进行了构象分析。。如NMR所示，除Up 4/5 U外，所有研究的二核苷酸均在水溶液中形成分子内碱基堆积相互作用。Np n中糖苷角周围的构象发现N's是抗/高抗性，并且发现C4'-C5'，C5'-O5'键周围的优选构象是gauche – gauche（gg）。Np n N's中的核糖部分显示出对S构象的偏爱，但是当连接到胞嘧啶时，核糖环则优先选择N构象。然而，在任何二核苷酸中均未观察到核糖部分的主要构象。Ap 2 A和Ap 4 A Na +盐的分子动力学模拟支持了实验结果。此外，针对Ap

  DOI：

  10.1039/c005122e
• 作为产物：
  描述：

  5'-腺嘌呤核苷酸 在 亚磷酸三苯酯 、 2,2'-二硫二吡啶 、 H₉₆F-Fhit 、 magnesium chloride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 P¹-5'-O-adenosine,P³-5'-O-uridine triphosphate
  参考文献：
  名称：

  将人类 Fhit（一种二腺苷三磷酸水解酶）改造为高效的二核苷多磷酸合酶

  摘要：

  假定的人类肿瘤抑制基因 FHIT 编码 Fhit，即脆弱的组氨酸三联体蛋白。Fhit 被认为参与涉及双核苷多磷酸的信号转导途径。Fhit 催化 P1-5'-O-腺苷-P3-5'-O-三磷酸腺苷 (Ap3A) 依赖 Mg2+ 水解为 AMP 和 MgADP。His96 突变为甘氨酸会使 Fhit 作为磷酸酐（如 Ap3A）水解的催化剂失效。然而，突变酶 H96G-Fhit 在核苷 5'-磷咪唑化物与核苷二磷酸和三磷酸的反应中有效催化磷酸酐键的合成。H96G-Fhit 可用于合成多种二核苷三磷酸和四磷酸。我们在此描述了使用 H96G-Fhit 催化 Ap3A、Ap3C、Ap3G、Ap3T、Ap3U、Cp3U、Tp3U、dAp3U、Ap4A、

  DOI：

  10.1021/ja0400640

文献信息

• What is the conformation of physiologically-active dinucleoside polyphosphates in solution? Conformational analysis of free dinucleoside polyphosphates by NMR and molecular dynamics simulations
  作者：Noa Stern、Dan Thomas Major、Hugo Emilio Gottlieb、Daniel Weizman、Bilha Fischer

  DOI：10.1039/c005122e

  日期：——

  indicated by NMR. The conformation around the glycosidic angle in NpnN′s was found to be anti/high anti and the preferred conformation around the C4′–C5′, C5′–O5′ bonds was found to be gauche–gauche (gg). The ribose moiety in NpnN′s showed a small preference for the S conformation, but when attached to cytosine the ribose ring preferred the N conformation. However, no predominant conformation was observed

  二核苷多磷酸盐或二核苷酸（Np n N'； N，N'= A，U，G，C；n = 2-7）是天然存在的生理活性化合物。尽管对二核苷酸的兴趣以及它们的构象与其生物学功能的相关性，但是对二核苷酸的构象的研究还不够充分。因此，在这里，我们通过各种NMR技术对一系列Np n N'Na +盐（N = A，G，U，C； N'= A，G，U，C；n = 2–5）进行了构象分析。。如NMR所示，除Up 4/5 U外，所有研究的二核苷酸均在水溶液中形成分子内碱基堆积相互作用。Np n中糖苷角周围的构象发现N's是抗/高抗性，并且发现C4'-C5'，C5'-O5'键周围的优选构象是gauche – gauche（gg）。Np n N's中的核糖部分显示出对S构象的偏爱，但是当连接到胞嘧啶时，核糖环则优先选择N构象。然而，在任何二核苷酸中均未观察到核糖部分的主要构象。Ap 2 A和Ap 4 A Na +盐的分子动力学模拟支持了实验结果。此外，针对Ap
• Engineering Human Fhit, a Diadenosine Triphosphate Hydrolase, into an Efficient Dinucleoside Polyphosphate Synthase
  作者：Kaisheng Huang、Perry A. Frey

  DOI：10.1021/ja0400640

  日期：2004.8.1

  dinucleoside polyphosphates. Fhit catalyzes the Mg2+-dependent hydrolysis of P1-5'-O-adenosine-P3-5'-O-adenosine triphosphate (Ap3A) to AMP and MgADP. Mutation of His96 to glycine disables Fhit as a catalyst for the hydrolysis of phosphoanhydrides such as Ap3A. However, the mutated enzyme H96G-Fhit efficiently catalyzes the synthesis of phosphoanhydride bonds in reactions of nucleoside-5'-phosphimidazolides

  假定的人类肿瘤抑制基因 FHIT 编码 Fhit，即脆弱的组氨酸三联体蛋白。Fhit 被认为参与涉及双核苷多磷酸的信号转导途径。Fhit 催化 P1-5'-O-腺苷-P3-5'-O-三磷酸腺苷 (Ap3A) 依赖 Mg2+ 水解为 AMP 和 MgADP。His96 突变为甘氨酸会使 Fhit 作为磷酸酐（如 Ap3A）水解的催化剂失效。然而，突变酶 H96G-Fhit 在核苷 5'-磷咪唑化物与核苷二磷酸和三磷酸的反应中有效催化磷酸酐键的合成。H96G-Fhit 可用于合成多种二核苷三磷酸和四磷酸。我们在此描述了使用 H96G-Fhit 催化 Ap3A、Ap3C、Ap3G、Ap3T、Ap3U、Cp3U、Tp3U、dAp3U、Ap4A、