5-甲基-2'-脱氧-6-氮杂尿苷 | 13410-30-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 三嗪类
• 中文名称: 5-甲基-2'-脱氧-6-氮杂尿苷
• 英文名称: 2-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-6-methyl-1,2,4-triazine-3,5(2H,4H)-dione
• 英文别名: 6-azathymidine；2'-deoxy-6-azathymidine；2-(β-D-erythro-2-deoxy-pentofuranosyl)-6-methyl-2H-[1,2,4]triazine-3,5-dione；2-(β-D-erythro-2-Desoxy-pentofuranosyl)-6-methyl-2H-[1,2,4]triazin-3,5-dion；6-Aza-thymidin；2-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-6-methyl-1,2,4-triazine-3,5-dione
• CAS: 13410-30-5
• 化学式: C₉H₁₃N₃O₅
• 分子量: 243.219
• InChiKey: LXHOFEUVCQUXRZ-RRKCRQDMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.3
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  112
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-甲基-2'-脱氧-6-氮杂尿苷 在 吡啶 作用下， 反应 21.0h， 生成 Methanesulfonic acid (2R,3S,5R)-5-(6-methyl-3,5-dioxo-4,5-dihydro-3H-[1,2,4]triazin-2-yl)-2-trityloxymethyl-tetrahydro-furan-3-yl ester
  参考文献：
  名称：

  嘧啶脱氧核糖核苷的各种3'-叠氮基类似物的合成及其抗人免疫缺陷病毒（HIV-1，HTLV-III / LAV）的抗病毒活性。

  摘要：

  已合成了嘧啶脱氧核糖核苷的各种3'-叠氮基类似物，并在人外周血单核细胞中针对人免疫缺陷病毒（HIV-1，HTLV-III / LAV）进行了测试。在这些化合物中，有胸苷（2），3-（3-氧代-1-丙烯基）胸苷（21），2'-脱氧尿苷（1），2'-脱氧-5-溴尿苷（5）的3'-叠氮基类似物），2'-脱氧-5-氟胞苷（19），2'-脱氧-5-碘尿苷（6），2'-脱氧胞苷（18），2'-脱氧-5-氟尿苷（4），2'-脱氧发现-5-thiocyoanatouridine（16），2'-脱氧-5-甲基胞苷（20），2'-脱氧-5-氨基尿苷（7）和2'-脱氧-5-羟基尿苷（10）具有显着的抗病毒作用活性，EC50值分别为0.002、0.01、0.2、1.0、1.0、1.1、1.2、4.8、5.1、5.1、6.2和10 microM。讨论了构效关系。

  DOI：

  10.1021/jm00397a011
• 作为产物：
  描述：

  2-[2-deoxy-3,5-bis-O-(4-methylbenzoyl)-β-D-erythro-pentofuranosyl]-6-methyl-1,2,4-triazine-3,5(2H,4H)-dione 在 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 6.0h， 以92%的产率得到5-甲基-2'-脱氧-6-氮杂尿苷
  参考文献：
  名称：

  6-Aza-2'-脱氧尿苷单磷酸类似物作为胸苷酸合成酶抑制剂以及结核分枝杆菌中胸苷单磷酸激酶的底物或抑制剂的合成和评价

  摘要：

  6-aza-2'-deoxyuridine 5'-monophosphate 的一系列 5-取代类似物 6-aza-dUMP 已被合成并评估为两种分枝杆菌胸苷酸合酶（即黄素依赖性胸苷酸合酶）的潜在抑制剂、ThyX 和经典的胸苷酸合酶 ThyA)。用 6-aza-dUMP 1a 中的 N 原子替换天然底物 dUMP 的 C(6) 导致衍生物具有弱的 ThyX 抑制活性（50 μM 时抑制率为 33%）。在 1a 的 C(5) 处引入烷基和芳基导致抑制活性完全丧失，而衍生物 3 中 3-(辛酰胺基)丙-1-炔基侧链的连接保留了对分枝杆菌 ThyX 的微弱抑制水平。 50 μM 时抑制 40%）。合成的衍生物均未显示出对分枝杆菌 ThyA 的任何显着抑制活性。这些化合物也被评估为分枝杆菌胸苷单磷酸激酶 (TMPKmt) 的潜在抑制剂。没有一种衍生物显示出任何显着的 TMPKmt 抑制。然而，用 N

  DOI：

  10.1002/cbdv.201100285

文献信息

• [EN] COMPOSITIONS AND METHODS FOR SYNTHESIS OF PHOSPHORYLATED MOLECULES<br/>[FR] COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS DE SYNTHÈSE DE MOLÉCULES PHOSPHORYLÉES
  申请人：UNIV CALIFORNIA

  公开号：WO2019195494A1

  公开（公告）日：2019-10-10

  The invention provides compositions and methods for synthesis of phosphorylated organic compounds, including nucleoside triphosphates.

  这项发明提供了合成磷酸化有机化合物的组合物和方法，包括核苷三磷酸。
• Nucleotide mimics and their prodrugs
  申请人：——

  公开号：US20040059104A1

  公开（公告）日：2004-03-25

  The present invention relates to nucleoside diphosphate mimics and nucleoside triphosphate mimics, which contain diphosphate or triphosphate moiety mimics and optionally sugar-modifications and/or base-modifications. The nucleotide mimics of the present invention, in a form of a pharmaceutically acceptable salt, a pharmaceutically acceptable prodrug, or a pharmaceutical formulation, are useful as antiviral, antimicrobial, and anticancer agents. The present invention provides a method for the treatment of viral infections, microbial infections, and proliferative disorders. The present invention also relates to pharmaceutical compositions comprising the compounds of the present invention optionally in combination with other pharmaceutically active agents.

  本发明涉及核苷二磷酸模拟物和核苷三磷酸模拟物，其中包含二磷酸或三磷酸基团模拟物，以及可选的糖修饰和/或碱基修饰。本发明的核苷酸模拟物，以药学上可接受的盐、药学上可接受的前药或药物配方的形式，可用作抗病毒、抗微生物和抗癌剂。本发明提供了一种治疗病毒感染、微生物感染和增生性疾病的方法。本发明还涉及包含本发明化合物的药物组合物，可选地与其他药理活性剂结合。
• Kinetic parameters and recognition of thymidine analogues with varying functional groups by thymidine phosphorylase
  作者：Akihiko Hatano、Aiko Harano、Yoshikatsu Takigawa、Yasuhiro Naramoto、Keisuke Toda、Yuuichi Nakagomi、Hideyuki Yamada

  DOI：10.1016/j.bmc.2008.01.038

  日期：2008.4.1

  The replacement of 3'-OH of thymidine markedly influenced its catalytic activity with TP. The conversion of pyrimidine nucleosides with modified base moieties to the corresponding 1-phosphate form was poor. The leaving group activity decreased with an increase in aromaticity of the pyrimidine base moiety, because of increased difficulty in polarizing the base by the amino acids local to the active site

  胸苷磷酸化酶（TP，EC 2.4.2.4）通过碱基和核糖基部分均以高特异性识别底物的结构。胸苷的3'-OH取代显着影响TP的催化活性。具有修饰的碱基部分的嘧啶核苷向相应的1-磷酸酯形式的转化很差。离开基团的活性随着嘧啶碱基部分的芳香性的增加而降低，这是因为增加了通过活性位点局部氨基酸使碱基极化的难度。3'和5'官能团的替换趋于降低反应速率和TP转化率。特别地，核糖基3'羟基在结构上对于酶与底物的结合是重要的。
• [EN] NOVEL PHOSPH(ON)ATE- AND SULF(ON)ATE-BASED PHOSPHATE MODIFIED NUCLEOSIDES USEFUL AS SUBSTRATES FOR POLYMERASES AND AS ANTIVIRAL AGENTS<br/>[FR] NOUVEAUX NUCLÉOSIDES MODIFIÉS AVEC UN PHOSPHATE, À BASE DE PHOSPH(ON)ATE ET DE SULF(ON)ATE, UTILES COMME SUBSTRATS POUR LES POLYMÉRASES ET COMME AGENTS ANTIVIRAUX
  申请人：UNIV LEUVEN KATH

  公开号：WO2011069688A1

  公开（公告）日：2011-06-16

  This invention provides phosphate-modified nucleosides represented by the structural formula ( I ): wherein W is O or S, and wherein B, R1; R3 and R2. are as defined herein. These compounds are useful as substrates for DNA/RNA polymerases, and as anti-viral agents in particular against HIV-1.

  这项发明提供了由结构式（I）表示的磷酸酯修饰核苷，其中W为O或S，B、R1、R3和R2的定义如本文所述。这些化合物可作为DNA/RNA聚合酶的底物使用，特别是作为抗HIV-1的抗病毒药物。
• NOVEL PHOSPH(ON)ATE- AND SULF(ON)ATE-BASED PHOSPHATE MODIFIED NUCLEOSIDES USEFUL AS SUBSTRATES FOR POLYMERASES AND AS ANTIVIRAL AGENTS
  申请人：Herdewijn Piet

  公开号：US20120245029A1

  公开（公告）日：2012-09-27

  This invention provides phosphate-modified nucleosides represented by the structural formula (I): wherein W is O or S, and wherein B, R 1 ; R 3 and R 2 . are as defined herein. These compounds are useful as substrates for DNA/RNA polymerases, and as anti-viral agents in particular against HIV-1.

  这项发明提供了由结构式(I)表示的磷酸修饰核苷酸，其中W为O或S，而B、R1、R2和R3如此处所定义。这些化合物可作为DNA/RNA聚合酶的底物，特别是在抗击HIV-1方面作为抗病毒剂。