1-[2-deoxy-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl]-2-diphenylcarbamoyloxyimidazole 2-cyanoethyl-N,N-diisopropylaminophosphoramidite

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-[2-deoxy-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl]-2-diphenylcarbamoyloxyimidazole 2-cyanoethyl-N,N-diisopropylaminophosphoramidite
• 英文别名: [1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]imidazol-2-yl] N,N-diphenylcarbamate
• 化学式: C₅₁H₅₆N₅O₈P
• 分子量: 898.008
• InChiKey: MYYHUXFJDJCCAD-PINGQOEPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.2
• 重原子数：
  65
• 可旋转键数：
  21
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  130
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  二苯氨基甲酰氯 在 吡啶 、 四丁基氟化铵 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 为溶剂， 反应 25.5h， 生成 1-[2-deoxy-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl]-2-diphenylcarbamoyloxyimidazole 2-cyanoethyl-N,N-diisopropylaminophosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  用于扩展遗传密码的两个非自然碱基对系统

  摘要：

  为了将氨基酸类似物定点掺入蛋白质中，开发了一种双非天然碱基对系统，用于具有扩展遗传密码的耦合转录-翻译系统。之前设计的 2-amino-6-(2-thienyl)purine（用 s 表示）和 pyridin-2-one（用 y 表示）之间的非天然碱基对用于将 yTP 位点特异性地掺入到与 s 相对的 RNA 中。 T7 RNA聚合酶模板。为了将 sTP 位点特异性地掺入 RNA，新开发的非天然碱基 imidazolin-2-one（由 z 表示）优于 y 作为模板碱基，用于与 T7 转录中的 s 配对。sy 和 sz 对的组合提供了一个强大的工具来制备含 y 的 mRNA 和含 s 的 tRNA，用于高效的偶联转录-翻译系统，其中遗传密码通过由 sy 对介导的密码子-反密码子相互作用进行扩展。此外，s 的核苷具有很强的荧光性，因此 sz 对能够对 RNA 分子进行位点特异性荧光标记。这些

  DOI：

  10.1021/ja047201d

文献信息

• A Two-Unnatural-Base-Pair System toward the Expansion of the Genetic Code
  作者：Ichiro Hirao、Yoko Harada、Michiko Kimoto、Tsuneo Mitsui、Tsuyoshi Fujiwara、Shigeyuki Yokoyama

  DOI：10.1021/ja047201d

  日期：2004.10.1

  Toward the site-specific incorporation of amino acid analogues into proteins, a two-unnatural-base-pair system was developed for coupled transcription-translation systems with the expanded genetic code. A previously designed unnatural base pair between 2-amino-6-(2-thienyl)purine (denoted by s) and pyridin-2-one (denoted by y) was used for the site-specific incorporation of yTP into RNA opposite s

  为了将氨基酸类似物定点掺入蛋白质中，开发了一种双非天然碱基对系统，用于具有扩展遗传密码的耦合转录-翻译系统。之前设计的 2-amino-6-(2-thienyl)purine（用 s 表示）和 pyridin-2-one（用 y 表示）之间的非天然碱基对用于将 yTP 位点特异性地掺入到与 s 相对的 RNA 中。 T7 RNA聚合酶模板。为了将 sTP 位点特异性地掺入 RNA，新开发的非天然碱基 imidazolin-2-one（由 z 表示）优于 y 作为模板碱基，用于与 T7 转录中的 s 配对。sy 和 sz 对的组合提供了一个强大的工具来制备含 y 的 mRNA 和含 s 的 tRNA，用于高效的偶联转录-翻译系统，其中遗传密码通过由 sy 对介导的密码子-反密码子相互作用进行扩展。此外，s 的核苷具有很强的荧光性，因此 sz 对能够对 RNA 分子进行位点特异性荧光标记。这些