β-cyanoethyl chlorocarbonate | 30436-27-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 有机碳酸及其衍生物
• 英文名称: β-cyanoethyl chlorocarbonate
• 英文别名: 2-cyanoethyl carbonochloridate；2-cyanoethyl chloroformate；β-cyanoethylchloroformate；β-Cyanoaethylchloroformiat；β-Cyanoethyl-chlorcarbonat；α-Cyanoethylchlorformiat；Carbonochloridic acid, 2-cyanoethyl ester
• CAS: 30436-27-2
• 化学式: C₄H₄ClNO₂
• 分子量: 133.534
• InChiKey: UOVYYGAZYYVWHT-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  227.4±23.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.298±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.9
• 重原子数：
  8
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  50.1
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  β-cyanoethyl chlorocarbonate 、 苯胺 以 苯 为溶剂， 生成 3-phenylcarbamoyloxy-propionitrile
  参考文献：
  名称：

  Kondratenko,V.I.; Khaskin,I.G., Journal of Organic Chemistry USSR (English Translation), 1970, vol. 6, p. 2231 - 2232

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  三光气 、 3-羟基丙腈 以 吡啶 、 甲苯 为溶剂， 生成 β-cyanoethyl chlorocarbonate
  参考文献：
  名称：

  通过硫连接的，对碱基不稳定的保护基团合成硫代磷酸二氢盐DNA（1）。

  摘要：

  磷酸二硫代磷酸酯DNA，具有脱氧核苷-OPS（2）O-脱氧核苷核苷间键合的一种新的且可能有用的DNA类似物，是由具有多种硫酯和硫代碳酸酯作为对碱基不稳定的磷保护基的脱氧核苷3'-磷酸硫代酰胺合成的。合成这种DNA类似物的主要挑战是要建立一个反应途径，在使Arbuzov重排，交换反应，硫代磷酸不必要的氧化以及其他一些副反应最小化的条件下，脱氧核苷3'-磷硫代酰胺的活化迅速且高收率地发生。 。在为此目的检查的各种磷保护基中，对这些参数的透彻评估得出结论，β-（苯甲酰基巯基）乙基是优选的。二硫代磷酸酯DNA的合成开始于通过一瓶合成程序，从适当保护的脱氧核苷，三（吡咯烷基）膦和乙二硫醇单苯甲酸酯制备脱氧核苷3'-磷硫代酰胺。这些合成子用四唑活化，并与聚合物载体上的脱氧核苷缩合，得到脱氧核苷硫代亚磷酸酯。随后的步骤包括用硫氧化以生成完全保护的二硫代磷酸三酯，未反应的脱氧核苷的酰化作用以及5'-保护基的去除。通过（31）P

  DOI：

  10.1021/jo960274y

文献信息

• Nucleotides, Part LXVII, The 2-Cyanoethyl and (2-Cyanoethoxy)carbonyl Group for Base Protection in Nucleoside and Nucleotide Chemistry
  作者：Claudia Merk、Tilman Reiner、Evgeny Kvasyuk、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1002/1522-2675(20001220)83:12<3198::aid-hlca3198>3.0.co;2-q

  日期：2000.12.20

  The amino functions of the common 2′-deoxyribo- and ribonucleosides were blocked by the (2-cyanoethoxy)carbonyl group on treatment with 2-cyanoethyl carbonochloridate (5) or 1-[(2-cyanoethoxy)carbonyl]-3-methyl-1H-imidazolium chloride (6) leading to 7, 18, 8, 19, 9, and 20. In 2′-deoxyguanosine, the amide group was additionally blocked at the O6 position by the 2-cyanoethyl (27) and 2-(4-nitrophenyl)ethyl

  在用 2-氰基乙基碳氯酸酯 (5) 或 1-[(2-氰基乙氧基)羰基]-3-甲基-处理时，常见的 2'-脱氧核糖和核糖核苷的氨基官能团被 (2-氰基乙氧基)羰基封闭。 1H-咪唑氯化物 (6) 产生 7, 18, 8, 19, 9 和 20。在 2'-脱氧鸟苷中，酰胺基团在 O6 位被 2-氰乙基 (27) 和 2-( 4-硝基苯基)乙基(31, 32)。关于通过 β-消除裂解 ce/ceoc 和 npe/npeoc 基团的比较动力学研究揭示了有关核碱基不同位点的各种封闭基团的容易性和顺序脱保护的有价值的信息。
• Phosphodiesterase inhibitors
  申请人：LES LABORATOIRES BEECHAM S.A.

  公开号：EP0381374A1

  公开（公告）日：1990-08-08

  A compound of formula (I), or a pharmaceutically acceptable salt thereof: in which, R₁ is hydrogen, C₁₋₆ alkyl or CH₂OR₆; R₂ is hydrogen or C₁₋₆ alkyl; R₃ is hydrogen or C₁₋₆ alkyl; each of W and Z, which are different, represents -CR₄R₅- or -(CRxRy)n-, in which, R₄ is hydrogen, C₁₋₃ alkyl, C₁₋₃ alkylthio, C₁₋₃ alkoxy or C₁₋₆ alkyl phenyl; R₅ is C₁₋₃ alkyl, C₁₋₃ alkylthio, C₁₋₃ alkoxy, phenyl, substituted phenyl, C₃₋₆ cycloalkyl, phenylthio, C₁₋₆ alkyl phenyl, halo-substituted benzyl, or heteroaryl; or together R₄ and R₅ form a 3 to 6 membered carbocyclic ring, or a heterocyclic ring containing one or two ring oxygen, nitrogen or sulphur atoms, or R₄ and R₅ together form an oxo or methylene group; each of Rx and Ry is hydrogen or C₁₋₃ alkyl; n is zero or 1; R₆ is phenyl substituted aminocarbonyl, C₁₋₆ alkoxy carbonyl-C₁₋₆ alkyl, phenyl-C₁₋₆ alkyl, phenyl, C₃₋₆ cycloalkylcarbonyl, C₃₋₆ cycloalkylcarbonyl-C₁₋₆ alkyl, C₃₋₆ cycloalkyl C₁₋₆ alkyl; C₁₋₆ alkylthiocarbonyl; halo-substituted C₁₋₆ alkoxycarbonyl; C₁₋₆ alkoxy C₁₋₆ alkyleneoxycarbonyl; C₁₋₆ alkylthio C₁₋₆ alkyleneoxycarbonyl; C₁₋₆ alkoxythiocarbonyl; C₃₋₆ cycloalkyloxycarbonyl; cyano substituted C₁₋₆ alkoxycarbonyl; di-C₁₋₆ alkylphosphonate; C₁₋₆ alkenyloxycarbonyl; or R₆ is hydrogen when R₅ is phenyl, C₃₋₆ cycloalkyl, phenylthio, C₁₋₆ alkylphenyl or halo-substituted benzyl; R₆ is benzoyl or aminobenzoyl when R₄ and R₅ form a C₃₋₆ cycloalkyl ring; R₇ is hydrogen, C₁₋₆ alkyl or halogen; X is oxygen or sulphur; and A is sulphur, oxygen or -NH-, is useful for the treatment of heart disease.

  式（I）的化合物，或其药学上可接受的盐：其中，R₁为氢，C₁₋₆烷基或CH₂OR₆；R₂为氢或C₁₋₆烷基；R₃为氢或C₁₋₆烷基；W和Z中的每一个，它们不同，代表-CR₄R₅-或-(CRxRy)n-，其中，R₄为氢，C₁₋₃烷基，C₁₋₃烷基硫，C₁₋₃烷氧基或C₁₋₆烷基苯基；R₅为C₁₋₃烷基，C₁₋₃烷基硫，C₁₋₃烷氧基，苯基，取代苯基，C₃₋₆环烷基，苯硫基，C₁₋₆烷基苯基，卤代苄基或杂环烷基；或者R₄和R₅一起形成3到6成员的碳环，或者含有一个或两个环氧原子、氮原子或硫原子的杂环；或者R₄和R₅一起形成氧或亚甲基基团；Rx和Ry中的每一个为氢或C₁₋₃烷基；n为零或1；R₆为苯基取代氨基甲酰基，C₁₋₆烷氧基甲酰基-C₁₋₆烷基，苯基-C₁₋₆烷基，苯基，C₃₋₆环烷基甲酰基，C₃₋₆环烷基甲酰基-C₁₋₆烷基，C₃₋₆环烷基C₁₋₆烷基；C₁₋₆烷基硫代甲酰基；卤代C₁₋₆烷氧基甲酰基；C₁₋₆烷氧基-C₁₋₆烷基氧基甲酰基；C₁₋₆烷基硫基-C₁₋₆烷基氧基甲酰基；C₁₋₆烷氧基硫代甲酰基；C₃₋₆环烷氧基甲酰基；氰基取代C₁₋₆烷氧基甲酰基；二C₁₋₆烷基膦酸酯；C₁₋₆烯氧基甲酰基；或者当R₅为苯基，C₃₋₆环烷基，苯硫基，C₁₋₆烷基苯基或卤代苄基时，R₆为氢；当R₄和R₅形成C₃₋₆环烷基环时，R₆为苯甲酰基或氨基苯甲酰基；R₇为氢，C₁₋₆烷基或卤素；X为氧或硫；A为硫，氧或-NH-，用于治疗心脏病。
• Synthesis and Biochemical Evaluation of Phosphonoformate Oligodeoxyribonucleotides
  作者：Christina M. Yamada、Douglas J. Dellinger、Marvin H. Caruthers

  DOI：10.1021/ja060112b

  日期：2006.4.1

  acid linker. Synthons were sequentially added to this support using tetrazole as an activator, oxidized to phosphonoformate, and the transient 5'-protecting group was removed with acid. Following total synthesis of an oligomer, protecting groups were removed with TEMED.HF and products purified by HPLC. These analogues were resistant to nucleases, formed duplexes with complementary RNA (A-form), and,

  膦甲酸寡脱氧核糖核苷酸是通过固相合成策略制备的。制备合适的合成子的第一步是在金属钠存在下将双（N，N-二异丙基氨基）膦和氯甲酸二苯基甲基甲硅烷基乙酯缩合，得到甲酸，[双（N，N-二异丙基氨基）膦基]-β-（二苯基甲基甲硅烷基乙基）酯。然后使用4,5-二氰基咪唑将该反应的产物与适当保护的2'-脱氧核苷缩合以产生3'-O-亚膦酰胺反应性单体。胞嘧啶、腺嘌呤和鸟嘌呤的环外胺用 9-芴基甲氧羰基保护，并使用氢醌-O，O'-二乙酸接头在受控孔玻璃上合成寡脱氧核糖核苷酸。使用四唑作为活化剂，将合成子依次添加到该载体中，氧化成膦甲酸酯，并用酸去除瞬时 5'-保护基团。在低聚物全合成后，用TEMED.HF去除保护基团并通过HPLC纯化产物。这些类似物对核酸酶具有抗性，与互补 RNA（A 型）形成双链体，并且作为在选定位点含有磷酸盐的嵌合寡聚体，刺激了 RNase H1 活性。
• Synthesis of Phosphorodithioate DNA via Sulfur-Linked, Base-Labile Protecting Groups¹
  作者：William T. Wiesler、Marvin H. Caruthers

  DOI：10.1021/jo960274y

  日期：1996.1.1

  deoxynucleoside thiophosphite. Subsequent steps involved oxidation with sulfur to generate the completely protected phosphorodithioate triester, acylation of unreacted deoxynucleoside, and removal of the 5'-protecting group. Yields per cycle were usually 97-98% with 2-5% phosphorothioate contamination as determined by (31)P NMR. By using deoxynucleoside 3'-phosphorothioamidites and deoxynucleoside 3'-phosphoroamidites

  磷酸二硫代磷酸酯DNA，具有脱氧核苷-OPS（2）O-脱氧核苷核苷间键合的一种新的且可能有用的DNA类似物，是由具有多种硫酯和硫代碳酸酯作为对碱基不稳定的磷保护基的脱氧核苷3'-磷酸硫代酰胺合成的。合成这种DNA类似物的主要挑战是要建立一个反应途径，在使Arbuzov重排，交换反应，硫代磷酸不必要的氧化以及其他一些副反应最小化的条件下，脱氧核苷3'-磷硫代酰胺的活化迅速且高收率地发生。 。在为此目的检查的各种磷保护基中，对这些参数的透彻评估得出结论，β-（苯甲酰基巯基）乙基是优选的。二硫代磷酸酯DNA的合成开始于通过一瓶合成程序，从适当保护的脱氧核苷，三（吡咯烷基）膦和乙二硫醇单苯甲酸酯制备脱氧核苷3'-磷硫代酰胺。这些合成子用四唑活化，并与聚合物载体上的脱氧核苷缩合，得到脱氧核苷硫代亚磷酸酯。随后的步骤包括用硫氧化以生成完全保护的二硫代磷酸三酯，未反应的脱氧核苷的酰化作用以及5'-保护基的去除。通过（31）P
• Site-Specific Synthesis of <i>N</i>⁴-Acetylcytidine in RNA Reveals Physiological Duplex Stabilization
  作者：David Bartee、Kellie D. Nance、Jordan L. Meier

  DOI：10.1021/jacs.1c11985

  日期：2022.3.2

  post-transcriptional modification of RNA that is conserved across all domains of life. All characterized sites of ac4C in eukaryotic RNA occur in the central nucleotide of a 5′-CCG-3′ consensus sequence. However, the thermodynamic consequences of cytidine acetylation in this context have never been assessed due to its challenging synthesis. Here, we report the synthesis and biophysical characterization

  N4-乙酰胞苷 （ac4C） 是 RNA 的转录后修饰，在生命的所有领域中都是保守的。真核 RNA 中 ac4C 的所有特征位点都发生在 5'-CCG-3' 共有序列的中心核苷酸中。然而，由于其具有挑战性的合成，在这种情况下胞苷乙酰化的热力学后果从未被评估过。在这里，我们报道了 ac4C 在其内源性真核序列背景下的合成和生物物理表征。首先，我们开发了一种合成路线，用于含有亲电乙酰基团的均相 RNA。接下来，我们使用热变性来研究 ac4C 对人类 rRNA 中发现的天然序列中双链体稳定性和错配鉴别的生化影响。最后，我们证明了这种化学方法能够将 ac4C 整合到人类 tRNA 的复杂修饰景观中，并使用双链体熔解来强调 ac4C 在这种独特序列背景下的强制作用。通过在生理序列背景下对核酸乙酰化进行离体生物物理分析，这些研究为理解普遍保守的核碱基在生物学和疾病中的功能奠定了化学基础。