N⁶-(1-naphthalenemethyl)-5'-deoxy-5'-aminoadenosine | 350234-06-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: N⁶-(1-naphthalenemethyl)-5'-deoxy-5'-aminoadenosine
• 英文别名: (2R,3S,4R,5R)-2-(aminomethyl)-5-[6-(naphthalen-1-ylmethylamino)purin-9-yl]oxolane-3,4-diol
• CAS: 350234-06-9
• 化学式: C₂₁H₂₂N₆O₃
• 分子量: 406.444
• InChiKey: YRGCTERXMMCGNH-QTQZEZTPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.1
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  131
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2,2-二苯基乙酸 、 N⁶-(1-naphthalenemethyl)-5'-deoxy-5'-aminoadenosine 在 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以90%的产率得到N⁶-(1-naphthalenemethyl)-5'-deoxy-5'-(diphenylacetamido)adenosine
  参考文献：
  名称：

  腺苷类似物通过基于结构的药物设计作为锥虫科甘油3-磷酸脱氢酶的选择性抑制剂。

  摘要：

  在我们继续进行基于抗锥虫病药物的结构设计时，寄生虫选择性腺苷类似物被确定为低甘油三磷酸甘油醛脱氢酶（GAPDH）的抑制剂。布鲁氏锥虫，克氏锥虫，墨西哥利什曼原虫和人类GAPDH的晶体结构提供了NAD（+）的腺苷部分如何与蛋白质相互作用的详细信息，这有助于理解一系列腺苷类似物对各种氨基酸的亲和力。 GAPDH。从对铅化合物的萘甲基和苯甲酰胺取代基进行修饰的探索中，N（6）-（1-萘甲基）-2'-脱氧-2'-（3-甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（6e），N（6）-（研究了取代的萘甲基）-2'-脱氧-2'-（取代的苯甲酰胺基）腺苷类似物。N（6）-（1-萘甲基）-2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（6m），N（6）-[1-（3-羟基萘）甲基] -2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（7m），N（6）-[1-（3-甲氧基萘）甲基] -2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（

  DOI：

  10.1021/jm000472o
• 作为产物：
  描述：

  N⁶-(1-naphthalenemethyl)-5'-deoxy-5'-(phthalimido)adenosine 在 一水合肼 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 N⁶-(1-naphthalenemethyl)-5'-deoxy-5'-aminoadenosine
  参考文献：
  名称：

  腺苷类似物通过基于结构的药物设计作为锥虫科甘油3-磷酸脱氢酶的选择性抑制剂。

  摘要：

  在我们继续进行基于抗锥虫病药物的结构设计时，寄生虫选择性腺苷类似物被确定为低甘油三磷酸甘油醛脱氢酶（GAPDH）的抑制剂。布鲁氏锥虫，克氏锥虫，墨西哥利什曼原虫和人类GAPDH的晶体结构提供了NAD（+）的腺苷部分如何与蛋白质相互作用的详细信息，这有助于理解一系列腺苷类似物对各种氨基酸的亲和力。 GAPDH。从对铅化合物的萘甲基和苯甲酰胺取代基进行修饰的探索中，N（6）-（1-萘甲基）-2'-脱氧-2'-（3-甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（6e），N（6）-（研究了取代的萘甲基）-2'-脱氧-2'-（取代的苯甲酰胺基）腺苷类似物。N（6）-（1-萘甲基）-2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（6m），N（6）-[1-（3-羟基萘）甲基] -2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（7m），N（6）-[1-（3-甲氧基萘）甲基] -2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（

  DOI：

  10.1021/jm000472o

文献信息

• Biotin labelling of amines by polymer-assisted solution-phase synthesis
  作者：Abolfasl Golisade、Claudia Herforth、Karen Wieking、Conrad Kunick、Andreas Link

  DOI：10.1016/s0960-894x(01)00296-7

  日期：2001.7

  multifunctional compounds bearing an amino functionality. Biotin was immobilized on aminomethylated polystyrene via the Kenner safety catch linker, activated and subsequently transferred to the amino function of the target compounds chemoselectively, thus avoiding protecting group operations. This approach holds potential for the introduction of spacer-modified biotin derivatives.

  已经开发出一种有效且简单的聚合物辅助方法来生物素化带有氨基官能团的多功能化合物。生物素通过Kenner安全捕捉连接器固定在氨基甲基化的聚苯乙烯上，被激活并随后通过化学选择性转移至目标化合物的氨基官能团，从而避免了保护基团的作用。这种方法具有引入间隔物修饰的生物素衍生物的潜力。
• Polymer-bound reagents for the introduction of spacer-modified biotin labels
  作者：Claudia Herforth、Philipp Heidler、Stephan Franke、Andreas Link

  DOI：10.1016/j.bmc.2004.03.038

  日期：2004.6

  We have developed a method for the chemoselective introduction of spacer modified biotin labels into unprotected multifunctional amines. A range of novel biotin spacer conjugates attached to a polymer-bound sulfonamide anchor was prepared using established amide bond forming procedures. After chemical transformation of the attachment site by alkylation, the resulting reactive species were utilized as N-selective polymer-supported biotinylation reagents. The labeled compounds, obtained in good to excellent yield and purity, are free of residual biotin and possess a custom tailored distance from the immobilization site being especially suited for the immobilization on streptavidin-functionalized dextran layers of surface plasmon resonance detector chips. In addition, derivatives displaying a phenyl group were synthesized in order to demonstrate the versatility of the procedure for the simultaneous introduction of spacer-modified biotin and a UV-light absorbing moiety. The formation of biotin sulfoxides in the presence of in situ generated peroxides was investigated and is discussed. Our results suggest that this derivatization technique is a useful addition to the existing biotin labeling protocols. (C) 2004 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Adenosine Analogues as Selective Inhibitors of Glyceraldehyde-3-phosphate Dehydrogenase of <i>Trypanosomatidae</i> via Structure-Based Drug Design
  作者：Jerome C. Bressi、Christophe L. M. J. Verlinde、Alex M. Aronov、My Le Shaw、Sam S. Shin、Lisa N. Nguyen、Stephen Suresh、Frederick S. Buckner、Wesley C. Van Voorhis、Irwin D. Kuntz、Wim G. J. Hol、Michael H. Gelb

  DOI：10.1021/jm000472o

  日期：2001.6.1

  N(6)-[1-(3-hydroxynaphthalene)methyl]-2'-deoxy-2'-(3,5-dimethoxybenzamido)adenosine (7m), N(6)-[1-(3-methoxynaphthalene)methyl]-2'-deoxy-2'-(3,5-dimethoxybenzamido)adenosine (9m), N(6)-(2-naphthalenemethyl)-2'-deoxy-2'-(3-methoxybenzamido)adenosine (11e), and N(6)-(2-naphthalenemethyl)-2'-deoxy-2'-(3,5-dimethoxybenzamido)adenosine (11m) demonstrated a 2- to 3-fold improvement over 6e and a 7100- to 25000-fold improvement

  在我们继续进行基于抗锥虫病药物的结构设计时，寄生虫选择性腺苷类似物被确定为低甘油三磷酸甘油醛脱氢酶（GAPDH）的抑制剂。布鲁氏锥虫，克氏锥虫，墨西哥利什曼原虫和人类GAPDH的晶体结构提供了NAD（+）的腺苷部分如何与蛋白质相互作用的详细信息，这有助于理解一系列腺苷类似物对各种氨基酸的亲和力。 GAPDH。从对铅化合物的萘甲基和苯甲酰胺取代基进行修饰的探索中，N（6）-（1-萘甲基）-2'-脱氧-2'-（3-甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（6e），N（6）-（研究了取代的萘甲基）-2'-脱氧-2'-（取代的苯甲酰胺基）腺苷类似物。N（6）-（1-萘甲基）-2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（6m），N（6）-[1-（3-羟基萘）甲基] -2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（7m），N（6）-[1-（3-甲氧基萘）甲基] -2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（