3'-O-(N,N-diisopropylamino-2-cyanoethoxyphosphinyl)-5-[1-(napth-1-yl)-1H-1,2,3-triazol-4-yl]-2'-deoxyuridine | 1407967-65-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3'-O-(N,N-diisopropylamino-2-cyanoethoxyphosphinyl)-5-[1-(napth-1-yl)-1H-1,2,3-triazol-4-yl]-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 3-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[5-(1-naphthalen-1-yltriazol-4-yl)-2,4-dioxopyrimidin-1-yl]oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
• CAS: 1407967-65-0
• 化学式: C₅₁H₅₄N₇O₈P
• 分子量: 924.006
• InChiKey: FBENAOIJGUERAW-MVAJTOPMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.6
• 重原子数：
  67
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  163
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-叠氮基萘 、 2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-ethynyluridine 在 copper(II) sulfate 、 sodium ascorbate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 7.5h， 生成 3'-O-(N,N-diisopropylamino-2-cyanoethoxyphosphinyl)-5-[1-(napth-1-yl)-1H-1,2,3-triazol-4-yl]-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  用修饰的寡核苷酸的合成和杂交性质5-（1-芳基1,2,3-三唑-4-基）-2'- deoxyuridines †往最‡

  摘要：

  连续掺入5-（1-芳基-1,2,3-三唑-4-基）-2'-脱氧尿苷单体X–Z修饰的寡核苷酸显示出很强的热亲和力和对RNA靶标的结合特异性，这是由于生色团的形成在主凹槽中排列。

  DOI：

  10.1039/c2ob26717a

文献信息

• Synthesis and hybridization properties of oligonucleotides modified with 5-(1-aryl-1,2,3-triazol-4-yl)-2′-deoxyuridines
  作者：Mamta Kaura、Pawan Kumar、Patrick J. Hrdlicka

  DOI：10.1039/c2ob26717a

  日期：——

  Oligonucleotides modified with consecutive incorporations of 5-(1-aryl-1,2,3-triazol-4-yl)-2′-deoxyuridine monomers X–Z display strong thermal affinity and binding specificity toward RNA targets, due to formation of chromophore arrays in the major groove.

  连续掺入5-（1-芳基-1,2,3-三唑-4-基）-2'-脱氧尿苷单体X–Z修饰的寡核苷酸显示出很强的热亲和力和对RNA靶标的结合特异性，这是由于生色团的形成在主凹槽中排列。