2-氨基-4,5,6,7,8,9-六氢环辛基[b]噻吩-3-羧酸甲酯 | 350996-90-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 噻吩类
• 中文名称: 2-氨基-4,5,6,7,8,9-六氢环辛基[b]噻吩-3-羧酸甲酯
• 英文名称: methyl 2-amino-4,5,6,7,8,9-hexahydrocycloocta[b]thiophene-3-carboxylate
• CAS: 350996-90-6
• 化学式: C₁₂H₁₇NO₂S
• mdl: MFCD01114974
• 分子量: 239.338
• InChiKey: KMQMOTGFHOYIBQ-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  421.9±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.188±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.583
• 拓扑面积：
  80.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

安全信息

• 危险等级：
  IRRITANT
• 危险品标志：
  Xi
• 海关编码：
  2934999090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氨基-4,5,6,7,8,9-六氢环辛基[b]噻吩-3-羧酸甲酯 在 硫酸 作用下， 反应 18.0h， 生成 methyl 2-[(1R,2R)-2-(methoxycarbonyl)cyclohexaneamido]-4H,5H,6H,7H,8H,9H-cycloocta[b]thiophene-3-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  发现针对 SARS-CoV-2 Mac1 并抑制冠状病毒复制的 2-酰胺-3-甲基酯噻吩，验证 Mac1 作为抗病毒靶点

  摘要：

  由严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 病毒引起的 COVID-19 大流行清楚地表明，需要进一步开发抗病毒疗法。在这里，我们描述了 SARS-CoV-2 Mac1 的小分子抑制剂，它可以对抗 ADP 核糖基化介导的先天免疫反应。三个高通量筛选命中具有相同的 2-酰胺-3-甲酯噻吩支架。我们使用 X 射线晶体学研究了化合物结合模式，使我们能够设计类似物。化合物27 (MDOLL-0229) 的 IC 50为 2.1 μM，在针对一组病毒和人类蛋白的活性进行分析后，对 CoV Mac1 蛋白具有选择性。改进后的效力可以测试其对病毒复制的影响，事实上， 27可以抑制鼠肝炎病毒 (MHV) 原型 CoV 和 SARS-CoV-2 的复制。对耐药 MHV 的测序鉴定出 Mac1 中的突变，进一步证明了27的特异性。化合物27是第一个被证明可以在细胞模型中抑制冠状病毒复制的 Mac1

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.3c02451
• 作为产物：
  描述：

  环辛酮 、 氰乙酸甲酯 在 吗啉 、 sulfur 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 18.0h， 以38%的产率得到2-氨基-4,5,6,7,8,9-六氢环辛基[b]噻吩-3-羧酸甲酯
  参考文献：
  名称：

  A new class of small molecule RNA polymerase inhibitors with activity against Rifampicin-resistant Staphylococcus aureus1

  摘要：

  The RNA polymerase holoenzyme is a proven target for antibacterial agents. A high-throughput screening program based on this enzyme from Staphylococcus aureus had previously identified a 2-ureidothiophene-3-carboxylate as a low micromolar inhibitor. An investigation of the relationships between the structures of this class of compounds and their inhibitory- and antibacterial activities is described here, leading to a set of potent RNA polymerase inhibitors with antibacterial activity. Characterization of this bioactivity, including studies of the mechanism of action, is provided, highlighting the power of the reverse chemical genetics approach in providing tools to inhibit the bacterial RNA polymerase. (c) 2006 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2006.05.035

文献信息

• A new class of small molecule RNA polymerase inhibitors with activity against Rifampicin-resistant Staphylococcus aureus1
  作者：Francis Arhin、Odette Bélanger、Stéphane Ciblat、Mohammed Dehbi、Daniel Delorme、Evelyne Dietrich、Dilip Dixit、Yanick Lafontaine、Dario Lehoux、Jing Liu、Geoffrey A. McKay、Greg Moeck、Ranga Reddy、Yannick Rose、Ramakrishnan Srikumar、Kelly S.E. Tanaka、Daniel M. Williams、Philippe Gros、Jerry Pelletier、Thomas R. Parr、Adel Rafai Far

  DOI：10.1016/j.bmc.2006.05.035

  日期：2006.9

  The RNA polymerase holoenzyme is a proven target for antibacterial agents. A high-throughput screening program based on this enzyme from Staphylococcus aureus had previously identified a 2-ureidothiophene-3-carboxylate as a low micromolar inhibitor. An investigation of the relationships between the structures of this class of compounds and their inhibitory- and antibacterial activities is described here, leading to a set of potent RNA polymerase inhibitors with antibacterial activity. Characterization of this bioactivity, including studies of the mechanism of action, is provided, highlighting the power of the reverse chemical genetics approach in providing tools to inhibit the bacterial RNA polymerase. (c) 2006 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Discovery of 2-Amide-3-methylester Thiophenes that Target SARS-CoV-2 Mac1 and Repress Coronavirus Replication, Validating Mac1 as an Antiviral Target
  作者：Sarah Wazir、Tomi A. O. Parviainen、Jessica J. Pfannenstiel、Men Thi Hoai Duong、Daniel Cluff、Sven T. Sowa、Albert Galera-Prat、Dana Ferraris、Mirko M. Maksimainen、Anthony R. Fehr、Juha P. Heiskanen、Lari Lehtiö

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.3c02451

  日期：2024.4.25

  by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) virus has made it clear that further development of antiviral therapies will be needed. Here, we describe small-molecule inhibitors for SARS-CoV-2 Mac1, which counters ADP-ribosylation-mediated innate immune responses. Three high-throughput screening hits had the same 2-amide-3-methylester thiophene scaffold. We studied the compound binding

  由严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 病毒引起的 COVID-19 大流行清楚地表明，需要进一步开发抗病毒疗法。在这里，我们描述了 SARS-CoV-2 Mac1 的小分子抑制剂，它可以对抗 ADP 核糖基化介导的先天免疫反应。三个高通量筛选命中具有相同的 2-酰胺-3-甲酯噻吩支架。我们使用 X 射线晶体学研究了化合物结合模式，使我们能够设计类似物。化合物27 (MDOLL-0229) 的 IC 50为 2.1 μM，在针对一组病毒和人类蛋白的活性进行分析后，对 CoV Mac1 蛋白具有选择性。改进后的效力可以测试其对病毒复制的影响，事实上， 27可以抑制鼠肝炎病毒 (MHV) 原型 CoV 和 SARS-CoV-2 的复制。对耐药 MHV 的测序鉴定出 Mac1 中的突变，进一步证明了27的特异性。化合物27是第一个被证明可以在细胞模型中抑制冠状病毒复制的 Mac1