5'-N-(9-fluorenylmethyloxycarbonyl)-5'-amino-5'-deoxythymidine | 98853-63-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 2 '，5'-二脱氧核苷
• 英文名称: 5'-N-(9-fluorenylmethyloxycarbonyl)-5'-amino-5'-deoxythymidine
• 英文别名: 9H-fluoren-9-ylmethyl N-[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl]carbamate
• CAS: 98853-63-5
• 化学式: C₂₅H₂₅N₃O₆
• 分子量: 463.49
• InChiKey: MVZNBURIUGBIDK-BHDDXSALSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  117
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  氯甲酸-9-芴基甲酯 、 5-氨基-5-脱氧胸腺嘧啶脱氧核苷 在 sodium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 生成 5'-N-(9-fluorenylmethyloxycarbonyl)-5'-amino-5'-deoxythymidine
  参考文献：
  名称：

  Solid-phase synthesis and evaluation of TAR RNA targeted β-carboline–nucleoside conjugates

  摘要：

  我们合成了四种δ-咔啉核苷共轭物。亲和毛细管电泳分析了这些δ-咔啉核苷共轭物 4â11、13 和 15 与 TAR RNA 的结合亲和力。与 TAR RNA 的结合亲和力数据显示，轭合物 9 和 13 的结合力强于母体化合物 MC3。计算机建模表明，δ-咔啉核苷共轭物 13 能与 TAR RNA 的 UCU 三核苷酸隆起区吻合。

  DOI：

  10.1039/b809598a

文献信息

• Deoxyribonucleoside phosphoramidites in which an aliphatic amino group
  申请人：California Institute of Technology

  公开号：US04849513A1

  公开（公告）日：1989-07-18

  The invention consists of compounds and methods for the synthesis of oligonucleotides which contain one or more free aliphatic amino groups attached to the sugar moieties of the nucleoside subunits. The synthetic method is versatile and general, permitting amino groups to be selectively placed at any position on oligonucleotides of any composition or length which is attainable by current DNA synthetic methods. Fluorescent dyes or other detectable moieties may be covalently attached to the amino groups to yield the corresponding modified oligonucleotide.

  该发明包括化合物和合成寡核苷酸的方法，其中这些寡核苷酸含有一个或多个连接到核苷苷基亚甲基氨基的自由脂肪族氨基。这种合成方法是多功能且通用的，允许氨基被选择性地放置在由当前DNA合成方法可实现的任何组成或长度的寡核苷酸的任何位置。荧光染料或其他可检测的基团可以共价连接到氨基上，从而得到相应的修饰寡核苷酸。
• Bausteine für DNA/PNA-Cooligomere
  申请人：BAYER AG

  公开号：EP0839828A1

  公开（公告）日：1998-05-06

  Die Erfindung betrifft Verbindungen der allgemeinen Formel (I) in welcher die Substituenten die in der Beschreibung angegebenen Bedeutungen haben. Die Verbindungen eingen sich zur Herstellung von bisher unbekannten streng alternierender PNA/DNA Cooligomere.

  本发明涉及通式 (I) 的化合物。 其中取代基的含义在描述中给出。 这些化合物适用于制备以前未知的严格交替的 PNA/DNA 冷却共聚物。
• US4849513A
  申请人：——

  公开号：US4849513A

  公开（公告）日：1989-07-18
• US5015733A
  申请人：——

  公开号：US5015733A

  公开（公告）日：1991-05-14
• US5118800A
  申请人：——

  公开号：US5118800A

  公开（公告）日：1992-06-02