5'-azido-2',5'-dideoxyuridine | 35959-37-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 2 '，5'-二脱氧核苷
• 英文名称: 5'-azido-2',5'-dideoxyuridine
• 英文别名: 5'-Azido-2',5'-dideoxyuridin；Uridine, 5'-azido-2',5'-dideoxy-；1-[(2R,4S,5R)-5-(azidomethyl)-4-hydroxyoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 35959-37-6
• 化学式: C₉H₁₁N₅O₄
• 分子量: 253.217
• InChiKey: VAGBIQTXMSHWJX-SHYZEUOFSA-N

物化性质

• 熔点：
  139-140 °C

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.6
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  93.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-azido-2',5'-dideoxyuridine 在 三苯基膦 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲苯 为溶剂， 反应 4.0h， 以63%的产率得到2,3'-anhydro-5'-azido-2',5'-dideoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  5'-异氰基-5'-脱氧胸苷，5'-异氰基-2'，5'-二脱氧尿苷，3'-叠氮基5'-异氰基-3'，5'-二脱氧胸苷和3'-的合成及抗逆转录病毒特性叠氮基5'-异氰基-2'，3'，5'-三苯氧尿苷。

  摘要：

  通过用TPP / DEAD / HN3处理胸苷和2'-脱氧尿苷获得5'-叠氮核苷3和4。将3'-O-甲硅烷基化的5'-叠氮基5'-脱氧胸苷5和相应的2'-脱氧尿苷衍生物6转化成甲酰胺（分别为7和8），并脱水成受保护的5'-异氰基衍生物9和10; 脱保护得到5′-异氰基-5′-脱氧胸苷（11）和5′-异氰基-2′，5′-二脱氧尿苷（12）。胸苷和2'-脱氧尿苷的2,3'-脱水-5'-甲酰胺衍生物（分别为19和20）是通过三种不同的方法制备的。在最直接的合成中，使用TPP / DEAD将3和4转化为2,3'-脱水-5'-叠氮核苷17和18。与TPP / HCO2COCH3反应后，得到19和20。与LiN3的亲核开放反应产生3'-叠氮基-5'-甲酰氨基衍生物21和22。脱水成3'-叠氮基-5'-异氰基-3'，5'-二脱氧胸苷（23）和3'-叠氮基-5用甲苯磺酰氯/吡啶获得“-异氰基-2”，3”，

  DOI：

  10.1021/jm00108a028
• 作为产物：
  描述：

  2-脱氧尿苷 在 吡啶 、 sodium azide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 5'-azido-2',5'-dideoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  含有1,2,3-三唑连接基的新型2'-脱氧尿苷二聚体的合成和生物学分析。第一部分

  摘要：

  摘要我们描述了一种简单的合成修饰的二核苷的方法，该修饰的二核苷含有嘧啶核苷类似物（2'-脱氧尿苷，胸苷和5-氟-2'-脱氧尿苷）。通过叠氮化物-炔烃1,3-偶极环加成反应（点击反应），从炔丙基化2'-脱氧尿苷和5'-叠氮基-核苷衍生物开始，获得了具有1,2,3-三唑键的六种不同的二聚体。在五种人类癌细胞系中测试了它们的细胞毒性活性：宫颈癌（HeLa），高级神经胶质瘤（U-118 MG，U-87 MG，T98G），肝脏（HepG2）和正常人类成纤维细胞系（MRC-5）使用磺基罗丹明B（SRB）分析。实验表明，所获得的具有1,2,3-三唑部分的二聚体是非常稳定的化合物，在生理样介质中也没有抗癌活性。

  DOI：

  10.1080/15257770.2018.1514122

文献信息

• Deoxyuridine Triphosphate Nucleotidohydrolase as a Potential Antiparasitic Drug Target
  作者：Corinne Nguyen、Ganasan Kasinathan、Isabel Leal-Cortijo、Alexander Musso-Buendia、Marcel Kaiser、Reto Brun、Luis M. Ruiz-Pérez、Nils G. Johansson、Dolores González-Pacanowska、Ian H. Gilbert

  DOI：10.1021/jm050111e

  日期：2005.9.1

  small-molecule inhibitors of the enzyme deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase (dUTPase) from parasitic protozoa. The successful synthesis of a variety of analogues of dUMP is described in which the substituents are introduced at the 3'- and 5'-positions, together with variation in the heteroatom at the 5'-position. The compounds were assayed against recombinant Plasmodium falciparum and Leishmania

  本文介绍了一项结构活性研究，旨在从寄生虫原生动物中鉴定出新型的小分子脱氧尿苷酶5'-三磷酸核苷酸水解酶（dUTPase）抑制剂。描述了dUMP的各种类似物的成功合成，其中在3'-和5'-位引入取代基，以及在5'-位杂原子的变化。对化合物进行了针对重组恶性疟原虫和利什曼原虫主要酶和人类酶的测定，以提供选择性的量度。还针对体外完整的寄生虫恶性疟原虫和多杀利什曼原虫对化合物进行了体外测试。已鉴定出许多恶性疟原虫dUTPase的有效和选择性抑制剂，这些抑制剂表现出类似药物的特性并代表了未来发展的良好线索。最好的抑制剂包括化合物5'-三苯甲基氨基-2'，5'-二脱氧尿苷（2j）（Ki = 0.2 microM）和5'-O-三苯基甲硅烷基-2'，3'-二氢氢化-2'，3'-二脱氧尿苷（5h）（Ki = 1.3 microM），与人类酶相比，选择性大于200倍。确定了对抗疟原虫活性重要的结构特征。在体外
• Synthesis of 2'-deoxyuridine and 5-fluoro-2'-deoxyuridine derivatives and evaluation in antibody targeting studies
  作者：Thomas F. G. Henn、Martin C. Garnett、Siri Ram Chhabra、Barrie W. Bycroft、Robert W. Baldwin

  DOI：10.1021/jm00063a007

  日期：1993.5

  Derivatives of 2'-deoxyuridine and of the anticancer agent 5-fluoro-2'-deoxyuridine (FdUR) were linked indirectly via a human serum albumin carrier (HSA) to the murine antiosteosarcoma monoclonal antibody 791T/36. Starting from the 2'-deoxyuridines 1a and 1b, the new nucleosides containing 5'-succinamic acid 7 and 5'-maleamic acid 8 spacers were synthesized from the key intermediate 5'-aminonucleoside

  2'-脱氧尿苷和抗癌剂5-氟-2'-脱氧尿苷（FdUR）的衍生物通过人血清白蛋白载体（HSA）与鼠类抗骨肉瘤单克隆抗体791T / 36间接连接。从2'-脱氧尿苷1a和1b开始，从关键中间体5'-氨基核苷4合成了含有5'-琥珀酰胺酸7和5'-马来酰胺酸8间隔区的新核苷，从核呋喃呋喃糖醛酸10合成了核呋喃酰胺基苯甲酸13。这些核苷通过其间隔子功能与HSA连接。对于这些衍生物-HSA缀合物，获得了25-40的高摩尔取代率（MSR：药物的摩尔/ HSA的摩尔）。所有衍生物对抗原阳性成骨肉瘤791T和抗原阴性膀胱癌T24细胞系的细胞毒性均低于母体药物。任何针对791T细胞的衍生物均未达到IC50。然后将氟脱氧尿苷-HSA缀合物通过稳定的硫醚键进一步连接至小鼠单克隆抗体791T / 36。最佳的氟化5'-琥珀酸免疫偶联物对791T和T24细胞的IC50为1 microM，略好于氟脱氧尿苷。未缀合的衍
• Synthesis and biological assay of new 2’-deoxyuridine dimers containing a 1,2,3-triazole linker. Part I
  作者：Lucyna Michalska、Dariusz Wawrzyniak、Agnieszka Szymańska-Michalak、Jan Barciszewski、Jerzy Boryski、Dagmara Baraniak

  DOI：10.1080/15257770.2018.1514122

  日期：2019.3.4

  Abstract We describe a simple method for the synthesis of modified dinucleosides containing pyrimidine nucleoside analogues (2’-deoxyuridine, thymidine and 5-fluoro-2’-deoxyuridine). Six different dimers with a 1,2,3-triazole linkage were obtained by azide–alkyne 1,3-dipolar cycloaddition (click reaction), starting from propargylated 2’-deoxyuridine and 5’-azido-nucleoside derivatives. Their cytotoxic

  摘要我们描述了一种简单的合成修饰的二核苷的方法，该修饰的二核苷含有嘧啶核苷类似物（2'-脱氧尿苷，胸苷和5-氟-2'-脱氧尿苷）。通过叠氮化物-炔烃1,3-偶极环加成反应（点击反应），从炔丙基化2'-脱氧尿苷和5'-叠氮基-核苷衍生物开始，获得了具有1,2,3-三唑键的六种不同的二聚体。在五种人类癌细胞系中测试了它们的细胞毒性活性：宫颈癌（HeLa），高级神经胶质瘤（U-118 MG，U-87 MG，T98G），肝脏（HepG2）和正常人类成纤维细胞系（MRC-5）使用磺基罗丹明B（SRB）分析。实验表明，所获得的具有1,2,3-三唑部分的二聚体是非常稳定的化合物，在生理样介质中也没有抗癌活性。
• Modified 5′-Trityl Nucleosides as Inhibitors of<i>Plasmodium falciparum</i>dUTPase
  作者：Gian Filippo Ruda、Corinne Nguyen、Przemysław Ziemkowski、Krzysztof Felczak、Ganasan Kasinathan、Alexander Musso-Buendia、Christian Sund、Xiao Xiong Zhou、Marcel Kaiser、Luis M. Ruiz-Pérez、Reto Brun、Tadeusz Kulikowski、Nils Gunnar Johansson、Dolores González-Pacanowska、Ian H. Gilbert

  DOI：10.1002/cmdc.201000445

  日期：2011.2.7

  2′‐Deoxyuridine triphosphate nucleotidohydrolase (dUTPase) is a potential drug target for the treatment of malaria. We previously reported the discovery of 5′‐tritylated analogues of deoxyuridine as selective inhibitors of this Plasmodium falciparum enzyme. Herein we report further structure–activity studies; in particular, variations of the 5′‐trityl group, the introduction of various substituents

  2'-脱氧尿苷三磷酸核苷酸水解酶（dUTPase）是治疗疟疾的潜在药物靶标。我们之前曾报道过发现脱氧尿苷的5'-三苯甲基化类似物可作为恶性疟原虫的选择性抑制剂酶。在这里，我们报告了进一步的结构活动研究；特别是5'-三苯甲基的变体，在脱氧尿苷的3'-位置引入了各种取代基以及修饰了碱基。测试了针对酶和寄生虫的化合物。5'-三苯甲基和3'-取代基的变异具有良好的耐受性，并产生了活性化合物。然而，由于尿嘧啶环的修饰导致酶抑制作用的丧失和抗血浆作用的显着降低，因此对尿嘧啶碱基的活性有明确的要求。
• [EN] TARGETED PROTEIN DEGRADATION<br/>[FR] DÉGRADATION CIBLÉE DE PROTÉINES
  申请人：C4 THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2020132561A1

  公开（公告）日：2020-06-25

  This invention provides pharmaceutical protein degraders and E3 ubiquitin ligase binders for therapeutic applications as described further herein.

  这项发明提供了用于治疗应用的药用蛋白质降解剂和E3泛素连接酶结合物。