N-benzoyl-5'-O-(bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl)-2'-deoxyadenosine 3'-benzoate | 93966-66-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N-benzoyl-5'-O-(bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl)-2'-deoxyadenosine 3'-benzoate
• 英文别名: [(2R,3S,5R)-5-(6-benzamidopurin-9-yl)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]oxolan-3-yl] benzoate
• CAS: 93966-66-6
• 化学式: C₄₅H₃₉N₅O₇
• 分子量: 761.834
• InChiKey: GTRKPUXTPRSUTL-LCKTVPPXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.1
• 重原子数：
  57
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  136
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-benzoyl-5'-O-(bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl)-2'-deoxyadenosine 3'-benzoate 在 二氯乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 N6,3'-O-二苯甲酰基-2'-脱氧腺苷
  参考文献：
  名称：

  核苷的化学选择性酰化

  摘要：

  双功能和多功能分子中氧原子与氮原子的化学选择性功能化是基础化学和复杂分子合成中长期存在的挑战。描述了允许高选择性衍生同时包含O和N官能团的复杂核苷的不同条件。还提出了特别有趣的案例，其中基于O和N的功能的反应性非常依赖于上下文，表现出模糊传统考虑的反应性，但也可以观察到选择性。

  DOI：

  10.1002/chem.202201661
• 作为产物：
  描述：

  苯甲酰氯 、 N6-苯甲酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯基)-2'-脱氧腺苷 以 吡啶 为溶剂， 反应 4.0h， 以62%的产率得到N-benzoyl-5'-O-(bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl)-2'-deoxyadenosine 3'-benzoate
  参考文献：
  名称：

  自互补四脱氧核糖核苷三磷酸在溶液中的便捷化学制备和光谱研究

  摘要：

  通过简化的方法制备了八种自互补的四脱氧核糖核苷三磷酸酯，这使我们能够省略合成中间体的纯化，并提供了非常快速和方便的四聚体。通过酶测定法表征四聚体，并通过在各种条件下使用UV和CD光谱法研究它们的构象。CD光谱的详细分析表明，四聚体双链体的构象取决于序列。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)87448-2

文献信息

• COMPOSITIONS AND METHODS FOR CHEMICAL CLEAVAGE AND DEPROTECTION OF SURFACE-BOUND OLIGONUCLEOTIDES
  申请人：Illumina, Inc.

  公开号：US20190352327A1

  公开（公告）日：2019-11-21

  Embodiments of the present disclosure relate to methods of preparation of templates for polynucleotide sequencing. In particular, the disclosure relates to linearization of clustered polynucleotides in preparation for sequencing by cleavage of one or more first strands of double-stranded polynucleotides immobilized on a solid support by a transition metal complex, for example, a palladium complex or a nickel complex. Further disclosure relate to linearization of clustered polynucleotides by cleaving one or more second strands of double double-stranded polynucleotides immobilized on a solid support comprising azobenzene linker by Na 2 S 2 O 4 . Nucleotides and oligonucleotides comprising a 3′ phosphate moiety blocking group, and methods of removing the same using a fluoride reagent are also disclosed.

  本公开的实施例涉及用于多核苷酸测序模板制备的方法。具体而言，本公开涉及通过过渡金属络合物（例如钯络合物或镍络合物）裂解固定在固体支持物上的双链多核苷酸的一条或多条第一链，以便为测序做准备。进一步公开涉及通过Na2S2O4裂解固定在含有偶氮苯联结剂的固体支持物上的双链多核苷酸的一条或多条第二链来线性化团簇化的多核苷酸。还公开了含有3'磷酸酯基团阻断基团的核苷酸和寡核苷酸，以及使用氟化试剂去除这些基团的方法。
• Self-complementary tetradeoxyribonucleoside triphosphates convenient chemical preparation and spectroscopic studies in solution
  作者：Jun-ichi Matsuzaki、Hitoshi Hotoda、Mitsuo Sekine、Tsujiaki Hata、Shigesada Higuchi、Yoshifumi Nishimura、Masamichi Tsuboi

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)87448-2

  日期：——

  self-complementary tetradeoxyribonucleoside triphosphates were prepared by a simplified method which enabled us to omit purification of synthetic intermediates and provided the tetramers very rapidly and conveniently. The tetramers were characterized by enzyme assay and their conformations were studied by the use of UV and CD spectroscopic methods under various conditions. The detailed analysis of the CD spectra

  通过简化的方法制备了八种自互补的四脱氧核糖核苷三磷酸酯，这使我们能够省略合成中间体的纯化，并提供了非常快速和方便的四聚体。通过酶测定法表征四聚体，并通过在各种条件下使用UV和CD光谱法研究它们的构象。CD光谱的详细分析表明，四聚体双链体的构象取决于序列。
• An efficient procedure for the solid phase tritylation of nucleosides and nucleotides
  作者：M.P Reddy、J.B Rampal、S.L Beaucage

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)95639-9

  日期：1987.1

  The interaction of tetra--butylammonium perchlorate with dimethoxytrityl chloride in the presence of 2,4,6-collidine in dichloromethane permitted a rapid and high yield tritylation of nucleosides or nucleotides covalently attached to a solid support.

  在二氯甲烷中存在2,4,6-可力丁的情况下，高氯酸四丁铵与二甲氧基三苯甲基氯的相互作用使得共价连接至固体支持物的核苷或核苷酸快速而高收率地进行三苯甲基化。
• Seliger, Hartmut; Bach, Trung-Chinh; Siewert, Gerhard, Liebigs Annalen der Chemie, 1984, # 5, p. 835 - 853
  作者：Seliger, Hartmut、Bach, Trung-Chinh、Siewert, Gerhard、Boidol, Werner、Toepert, Michael、et al.

  DOI：——

  日期：——
• Nucleotide libraries as a source of biologically relevant chemical diversity: solution-phase synthesis
  作者：Wenqiang Zhou、Sathya Upendran、Arlène Roland、Yi Jin、Radhakrishnan P. Iyer

  DOI：10.1016/s0960-894x(00)00210-9

  日期：2000.6

  Solution-phase parallel synthesis of nucleotide library I consisting of 150 members is reported. (C) 2000 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.