N2-isobutyryl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-tertbutyl(dimethylsilyl)guanine-3'-O-[O-(2-cyanoethyl)-N,N-(diisopropyl)]phosphoramidite | 131316-87-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N2-isobutyryl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-tertbutyl(dimethylsilyl)guanine-3'-O-[O-(2-cyanoethyl)-N,N-(diisopropyl)]phosphoramidite
• 英文别名: N-isobutyryl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-TBDMS-guanosine-3'-O-[O-(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylphosphoramidite]；5'-O-dimethoxytrityl-2'-O-tert-butyldimethylsilyl-N2-isobutyryl guanosine 3'-O-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphoramidite)；I-bu-rG Phosphoramidite；N-[9-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-6-oxo-1H-purin-2-yl]-2-methylpropanamide
• CAS: 131316-87-5
• 化学式: C₅₀H₆₈N₇O₉PSi
• 分子量: 970.191
• InChiKey: PGJKESPHANLWME-FTZVBZPOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.69
• 重原子数：
  68
• 可旋转键数：
  22
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  180
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N2-isobutyryl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-tertbutyl(dimethylsilyl)guanine-3'-O-[O-(2-cyanoethyl)-N,N-(diisopropyl)]phosphoramidite 在 水 、 三氟乙酸吡啶 、 叔丁胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 0.33h， 生成 (2R,3R,4R,5R)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(2-isobutyramido-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)tetrahydrofuran-3-yl phosphonate
  参考文献：
  名称：

  含有三唑基 C-核苷的环状二核苷酸类似物的设计与合成

  摘要：

  天然环状二核苷酸 （CDN） 是参与细菌止血、人类先天免疫和细菌抗噬菌体免疫的次级信使。合成 CDN 及其类似物是关键的分子探针和潜在的免疫治疗剂。几种 CDN 类似物正在进行抗肿瘤免疫治疗的临床研究。已经开发并报道了无数用于制备 CDN 及其类似物的合成方法。但是，大多数协议需要多个步骤，并且一次只准备一个 CDN 或其类似物。在本研究中，设计并开发了一种基于含有 1'-炔基的大环磷酸核糖骨架的策略，通过点击化学制备含有三唑基 C-核苷的 CDN 类似物。点击化学和亚磺酰化级联反应到大环骨架的组合应用扩展了 CDN 类似物的多样性。这种大环骨架策略可快速有效地提供 CDN 类似物，以促进微生物学、免疫学和免疫疗法的研究。

  DOI：

  10.1021/acs.joc.4c01055
• 作为产物：
  描述：

  二异丙胺 在 N,N-二异丙基乙胺 、 三氯化磷 作用下， 反应 1.67h， 生成 N2-isobutyryl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-tertbutyl(dimethylsilyl)guanine-3'-O-[O-(2-cyanoethyl)-N,N-(diisopropyl)]phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  Overcoming hydrolytic sensitivity and low solubility of phosphitylation reagents by combining ionic liquids with mechanochemistry

  摘要：

  离子液体与球磨相结合，用于一系列氯代磷酰胺试剂，对核苷和 2-脱氧核苷进行磷酸化。离子液体介导的过程具有更高的稳定性，加上球磨产生的高效传质，即使使用小的二烷基氨基和更常用的二异丙基氨基保护，也能获得极高的产量。

  DOI：

  10.1039/c1cc11025j

文献信息

• [EN] BICYCLIC PEPTIDE LIGAND STING CONJUGATES AND USES THEREOF<br/>[FR] CONJUGUÉS LIGANDS PEPTIDIQUES BICYCLIQUES ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：BICYCLERD LTD

  公开号：WO2019034866A1

  公开（公告）日：2019-02-21

  The present invention provides compounds, compositions thereof, and methods of using the same.

  本发明提供了化合物、其组合物以及使用方法。
• LOCKED NUCLEIC ACID CYCLIC DINUCLEOTIDE COMPOUNDS AND USES THEREOF
  申请人：ADURO BIOTECH, INC.

  公开号：US20190185511A1

  公开（公告）日：2019-06-20

  The present invention provides highly active locked nucleic acid cyclic-dinucleotide (LNA-CDN) immune stimulators that activate DCs via the cytoplasmic receptor known as STING (Stimulator of Interferon Genes). In particular, the LNA-CDNs of the present invention are provided in the form of a composition comprising one or more cyclic dinucleotides that induce human STING-dependent type I interferon production, wherein the cyclic dinucleotides present in the composition have at least one 2′, 4′ locked nucleic acids within the cyclic dinucleotide.

  本发明提供了高活性的锁定核酸环二核苷酸（LNA-CDN）免疫刺激剂，通过细胞质受体STING（干扰素基因刺激剂）激活DCs。具体而言，本发明的LNA-CDNs以一种组合物的形式提供，该组合物包括一种或多种诱导人类STING依赖型I型干扰素产生的环二核苷酸，其中组合物中的环二核苷酸至少有一个2′, 4′锁定核酸。
• Microwave-assisted preparation of nucleoside-phosphoramidites
  作者：G. Meher、T. Efthymiou、M. Stoop、R. Krishnamurthy

  DOI：10.1039/c4cc03092c

  日期：——

  Microwave-assisted phosphitylation of nucleosides is an efficient method for the preparation of phosphoramidites.

  微波辅助核苷酸的磷酰化是制备磷酰胺酯的高效方法。
• Synthetic Method for Oligonucleotide Block by Using Alkyl-Chain-Soluble Support
  作者：Yuki Matsuno、Takao Shoji、Shokaku Kim、Kazuhiro Chiba

  DOI：10.1021/acs.orglett.6b00077

  日期：2016.2.19

  method for the synthesis of oligonucleotide blocks using a Cbz-type alkyl-chain-soluble support (Z-ACSS) attached to the 3′-OH group of 3′-terminal nucleosides was developed. The Z-ACSS allowed for the preparation of fully protected deoxyribo- and ribo-oligonucleotides without chromatographic purification and released dimer- to tetramer-size oligonucleotide blocks via hydrogenation using a Pd/C catalyst

  开发了使用连接到3'-末端核苷的3'-OH基团的Cbz-型烷基链可溶性载体（Z-ACSS）合成寡核苷酸嵌段的简单方法。Z-ACSS无需色谱纯化即可制备完全保护的脱氧核糖和核糖寡核苷酸，并通过使用Pd / C催化剂的氢化作用释放二聚体至四聚体大小的寡核苷酸嵌段，而保护基团（例如5'）没有明显损失或迁移-末端4,4'-二甲氧基三苯甲基，核苷酸间键上的2-氰基乙基或2'-TBS。
• Highly Efficient Cyclic Dinucleotide Based Artificial Metalloribozymes for Enantioselective Friedel–Crafts Reactions in Water
  作者：Changhao Wang、Min Hao、Qianqian Qi、Jingshuang Dang、Xingchen Dong、Shuting Lv、Ling Xiong、Huanhuan Gao、Guoqing Jia、Yashao Chen、Jörg S. Hartig、Can Li

  DOI：10.1002/anie.201912962

  日期：2020.2.24

  construct artificial metalloenzymes (ArMs) for enantioselective catalysis. DNA-based ArMs containing duplex and G-quadruplex scaffolds have been widely investigated, yet RNA-based ArMs are scarce. Here we report that a cyclic dinucleotide of c-di-AMP and Cu2+ ions assemble into an artificial metalloribozyme (c-di-AMP⋅Cu2+ ) that enables catalysis of enantioselective Friedel-Crafts reactions in aqueous

  核酸的各种二级结构正以吸引人的手性支架的形式出现，以构建用于对映选择性催化的人工金属酶（ArM）。包含双链体和G-四链体支架的基于DNA的ArM已被广泛研究，但基于RNA的ArM却很少。在这里，我们报道c-di-AMP和Cu2 +离子的环状二核苷酸组装成人工金属核酶（c-di-AMP⋅Cu2+），该催化金属能够在水介质中以高反应性和出色的对映选择性进行催化对映选择性Friedel-Crafts反应。到97％ee。与Cu2 +离子相比，c-di-AMP⋅Cu2+的组装产生了20倍的速率加速。基于各种生物物理技术和密度函数理论（DFT）计算，