2'-O-(1,1-dioxo-1λ6-thiomorpholine-4-carbothioate)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N6-isobutyryl-adenosine-3'-O-(β-cyanoethyl)-N,N-diisopropyl-phosphoramidite | 1219089-86-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 2'-O-(1,1-dioxo-1λ6-thiomorpholine-4-carbothioate)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N6-isobutyryl-adenosine-3'-O-(β-cyanoethyl)-N,N-diisopropyl-phosphoramidite
• 英文别名: O-((2R,3R,4R,5R)-5-((Bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-(((2-cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphanyl)oxy)-2-(6-isobutyramido-9H-purin-9-yl)tetrahydrofuran-3-yl) thiomorpholine-4-carbothioate 1,1-dioxide；O-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxy-2-[6-(2-methylpropanoylamino)purin-9-yl]oxolan-3-yl] 1,1-dioxo-1,4-thiazinane-4-carbothioate
• CAS: 1219089-86-7
• 化学式: C₄₉H₆₁N₈O₁₀PS₂
• 分子量: 1017.18
• InChiKey: JDHHUACDFJOZGR-LCVXBTAASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.9
• 重原子数：
  70
• 可旋转键数：
  21
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  242
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  16

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  O-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxy-2-[6-(2-methylpropanoylamino)purin-9-yl]oxolan-3-yl] 1,1-dioxo-1,4-thiazinane-4-carbothioate 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N-甲基咪唑 、 2,4,6-三甲基吡啶 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 2'-O-(1,1-dioxo-1λ6-thiomorpholine-4-carbothioate)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N6-isobutyryl-adenosine-3'-O-(β-cyanoethyl)-N,N-diisopropyl-phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  PROTECTED MONOMER AND METHOD OF FINAL DEPROTECTION FOR RNA SYNTHESIS

  摘要：

  提供了一种由硫代氨基甲酸酯保护基保护的核苷单体，以及使用该核苷单体制备多核苷酸的方法。还提供了一种利用二胺去保护受保护多核苷酸的多核苷酸合成方法。

  公开号：

  US20100076183A1