1,1',1'',1''',1'''',1'''''-{[5-(2-hydroxyethoxy)benzene-1,3-diyl]-bis(methanediyloxy-1,5,9-triazacyclododecane-3,1,5,9-tetrayl)}hexakis(trifluoroethanone) | 1426253-65-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 哌啶类
• 英文名称: 1,1',1'',1''',1'''',1'''''-{[5-(2-hydroxyethoxy)benzene-1,3-diyl]-bis(methanediyloxy-1,5,9-triazacyclododecane-3,1,5,9-tetrayl)}hexakis(trifluoroethanone)
• 英文别名: 3,3'-{{[5-(2-hydroxyethoxy)-1,3-phenylene]bis(methylene)}bis(oxy)}bis(1,5,9-triazacyclododecane-1,5,9-triyl)tris(2,2,2-trifluoroethanone)
• CAS: 1426253-65-7
• 化学式: C₄₀H₄₆F₁₈N₆O₁₀
• 分子量: 1112.81
• InChiKey: MOMMMBIFYQQHQL-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.76
• 重原子数：
  74.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  169.78
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,1',1'',1''',1'''',1'''''-{[5-(2-hydroxyethoxy)benzene-1,3-diyl]-bis(methanediyloxy-1,5,9-triazacyclododecane-3,1,5,9-tetrayl)}hexakis(trifluoroethanone) 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以85%的产率得到3,3'-{{{5-(2-[(2-cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphinooxy]ethoxy)-1,3-phenylene}bis(methylene)}bis(oxy)}bis(1,5,9-triazacyclododecane-1,5,9-triyl)tris(2,2,2-trifluoroethanone)
  参考文献：
  名称：

  3,5-双[（1,5,9-三氮杂环十二烷-3-基氧基）甲基]苯基缀合物作为人工RNase的Zn2 +配合物：寡核苷酸缀合物对裂解剂尿苷选择性的影响

  摘要：

  合成了2-（3,5-Bis {[1,5,9-三（三氟乙酰基）-1,5,9-三氮杂环十二烷-3-基氧基]甲基}苯氧基）乙醇并将其转化为O-（2-氰基乙基） ）-N，N-二异丙基亚磷酰胺结构单元12。2'- O-甲基寡核糖核苷酸，其中掺入了4-氧代戊酸2-[[（2 S，4 S，5 R）-4-羟基-5-（羟甲基）四氢呋喃-2-基）乙基或2- {2- [ 2 ‐（{[（2 R，4 S，5 R靠近3'-末端的4-羟基戊酸非核苷单元）-4-羟基-5-（羟基甲基）四氢呋喃-2-基]乙酰基}氨基}乙氧基]乙氧基}乙基通过在载体上用乙酸肼处理除去氧戊烷酰基保护基，并将其中的12个与暴露的OH官能团偶联。通过HPLC纯化去保护的缀合物，并且比较它们在潜在的裂解位点裂解包含尿苷或一些其他核苷的互补RNA的能力。出乎意料的是，缀合至寡核苷酸并没有增强Zn 2 + 双（氮杂row）络合物的催化活性，并且实际上消除了其对尿苷位点的选择性。

  DOI：

  10.1002/hlca.201200153
• 作为产物：
  描述：

  三氟乙酸甲酯 、 在 三乙胺 、 吡啶 、 三氟乙酸酐 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 5.0h， 以0.16 g的产率得到1,1',1'',1''',1'''',1'''''-{[5-(2-hydroxyethoxy)benzene-1,3-diyl]-bis(methanediyloxy-1,5,9-triazacyclododecane-3,1,5,9-tetrayl)}hexakis(trifluoroethanone)
  参考文献：
  名称：

  3,5-双[（1,5,9-三氮杂环十二烷-3-基氧基）甲基]苯基缀合物作为人工RNase的Zn2 +配合物：寡核苷酸缀合物对裂解剂尿苷选择性的影响

  摘要：

  合成了2-（3,5-Bis {[1,5,9-三（三氟乙酰基）-1,5,9-三氮杂环十二烷-3-基氧基]甲基}苯氧基）乙醇并将其转化为O-（2-氰基乙基） ）-N，N-二异丙基亚磷酰胺结构单元12。2'- O-甲基寡核糖核苷酸，其中掺入了4-氧代戊酸2-[[（2 S，4 S，5 R）-4-羟基-5-（羟甲基）四氢呋喃-2-基）乙基或2- {2- [ 2 ‐（{[（2 R，4 S，5 R靠近3'-末端的4-羟基戊酸非核苷单元）-4-羟基-5-（羟基甲基）四氢呋喃-2-基]乙酰基}氨基}乙氧基]乙氧基}乙基通过在载体上用乙酸肼处理除去氧戊烷酰基保护基，并将其中的12个与暴露的OH官能团偶联。通过HPLC纯化去保护的缀合物，并且比较它们在潜在的裂解位点裂解包含尿苷或一些其他核苷的互补RNA的能力。出乎意料的是，缀合至寡核苷酸并没有增强Zn 2 + 双（氮杂row）络合物的催化活性，并且实际上消除了其对尿苷位点的选择性。

  DOI：

  10.1002/hlca.201200153