5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-methoxyoxalylamido-3'-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropylamino)phosphinyl-2'-deoxyuridine | 177980-14-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-methoxyoxalylamido-3'-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropylamino)phosphinyl-2'-deoxyuridine
• 英文别名: methyl 2-[[(2R,3R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxy-2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]amino]-2-oxoacetate
• CAS: 177980-14-2
• 化学式: C₄₂H₅₀N₅O₁₁P
• 分子量: 831.86
• InChiKey: SJUVLMDMZHKSPZ-HFZIILSDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.78
• 重原子数：
  59.0
• 可旋转键数：
  18.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  192.67
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  14.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-methoxyoxalylamido-3'-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropylamino)phosphinyl-2'-deoxyuridine 在 四氮唑 、 lithium hydroxide 、 碘 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 0.58h， 生成
  参考文献：
  名称：

  从甲氧基草酰氨基前体合成功能修饰的寡核苷酸

  摘要：

  2'-甲氧基草酰氨基-2'-脱氧尿苷被掺入到寡核苷酸分子中，并且被证明是用于各种功能性添加剂的后合成引入的有用前体。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(96)00537-0
• 作为产物：
  描述：

  2'-TFA-NH-2'-脱氧尿苷 在 吡啶 、 二异丙基铵盐四氮唑 、 氨 、 三乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.5h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-methoxyoxalylamido-3'-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropylamino)phosphinyl-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  带有带有反应性残基的接头的用于寡核苷酸合成的单体：II。基于尿苷和胞嘧啶并在2'位含有甲氧基草酰胺基团的连接体合成亚磷酰胺

  摘要：

  开发了一种方便的 2'-氨基-2'-脱氧尿苷的制备合成方法。从 2'-氨基-2'-脱氧尿苷和 2'-氨基-2'-脱氧胞苷开始，获得了在 2' 位带有带有甲氧基草酰胺基团的接头的亚磷酰胺寡核苷酸合成单体。

  DOI：

  10.1023/b:rubi.0000030130.99454.ae