5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-[4-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylphosphoramidothioyl]but-1-oxy]-(N,N-diisopropylamino)phosphinyl-2'-deoxythymidine | 1233482-88-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-[4-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylphosphoramidothioyl]but-1-oxy]-(N,N-diisopropylamino)phosphinyl-2'-deoxythymidine
• CAS: 1233482-88-6
• 化学式: C₅₀H₇₁N₅O₁₀P₂S
• 分子量: 996.155
• InChiKey: CMAZCCXVNUEVDU-VQSMBDGYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.98
• 重原子数：
  68.0
• 可旋转键数：
  27.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  158.97
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  14.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  、 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-[4-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylphosphoramidothioyl]but-1-oxy]-(N,N-diisopropylamino)phosphinyl-2'-deoxythymidine 在 四氮唑 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 0.08h， 生成 methyl (1R,4S,7aR)-1-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-4-methyl-7a-prop-2-enyl-2,7-dihydro-1H-indene-5-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Hydroxyalkylated phosphoramidate, phosphoramidothioate and phosphorodiamidothioate derivatives as thiophosphate protecting groups in the development of thermolytic DNA prodrugs

  摘要：

  羟基烷基磷酰胺盐（4a）、磷酰胺硫酸酯（4b、4e–j）和磷酸二酰胺硫酸酯（4c和4d）被确定为在热解免疫调节DNA前药开发中一种新的热敏硫酸酯保护基。这些醇类转化为其脱氧核糖核苷磷酰胺酸酯衍生物（6a–j），然后用于制备热敏的二核苷酸磷硫酸酯（7a–j）。7a-b和7e-j的带负电荷的硫酸酯保护基在基本中性条件下的高温下，可能经历热解环酯化。7e和7f的硫酸酯保护基在37 °C下显示出相对快速的去保护动力学（半衰期分别为20小时和42小时），因此适合于保护免疫调节DNA序列中CpG基序两侧的磷酸二酯功能，而7g–j的硫酸酯保护基在37 °C下的热解去保护半衰期为94–265小时，更适合用于CpG基序的硫酸酯保护。此外，7a中保护硫酸酯功能的保护基在90 °C下的热稳定性（半衰期为82分钟）应能有效保护DNA前药的5′和/或3′端磷酸二酯功能，免受普遍存在的细胞外和细胞内外切酶的影响。

  DOI：

  10.1039/b9nj00692c
• 作为产物：
  描述：

  2-cyanoethyl-N,N’-diisopropylchlorophosphoramidite 在 四氮唑 、 1,2,3,4,5,6,7,8-八硫杂环辛烷 、 溶剂黄146 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-[4-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylphosphoramidothioyl]but-1-oxy]-(N,N-diisopropylamino)phosphinyl-2'-deoxythymidine
  参考文献：
  名称：

  Hydroxyalkylated phosphoramidate, phosphoramidothioate and phosphorodiamidothioate derivatives as thiophosphate protecting groups in the development of thermolytic DNA prodrugs

  摘要：

  羟基烷基磷酰胺盐（4a）、磷酰胺硫酸酯（4b、4e–j）和磷酸二酰胺硫酸酯（4c和4d）被确定为在热解免疫调节DNA前药开发中一种新的热敏硫酸酯保护基。这些醇类转化为其脱氧核糖核苷磷酰胺酸酯衍生物（6a–j），然后用于制备热敏的二核苷酸磷硫酸酯（7a–j）。7a-b和7e-j的带负电荷的硫酸酯保护基在基本中性条件下的高温下，可能经历热解环酯化。7e和7f的硫酸酯保护基在37 °C下显示出相对快速的去保护动力学（半衰期分别为20小时和42小时），因此适合于保护免疫调节DNA序列中CpG基序两侧的磷酸二酯功能，而7g–j的硫酸酯保护基在37 °C下的热解去保护半衰期为94–265小时，更适合用于CpG基序的硫酸酯保护。此外，7a中保护硫酸酯功能的保护基在90 °C下的热稳定性（半衰期为82分钟）应能有效保护DNA前药的5′和/或3′端磷酸二酯功能，免受普遍存在的细胞外和细胞内外切酶的影响。

  DOI：

  10.1039/b9nj00692c