3-[[(1S,3R,4S,7R)-1-[(1R)-1-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]ethyl]-3-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-7-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile | 1217483-35-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3-[[(1S,3R,4S,7R)-1-[(1R)-1-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]ethyl]-3-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-7-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
• CAS: 1217483-35-6
• 化学式: C₄₁H₄₉N₄O₉P
• 分子量: 772.835
• InChiKey: AXWRCASDYOEPHZ-AKUFFRQHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.9
• 重原子数：
  55
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  141
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-[(1S,3R,4S,7R)-7-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-1-[(1S)-1-hydroxyethyl]-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-3-yl]pyrimidine-2,4-dione 在 吡啶 、 四氮唑 、 甲醇 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 氨 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 三乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 3-[[(1S,3R,4S,7R)-1-[(1R)-1-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]ethyl]-3-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-7-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
  参考文献：
  名称：

  与β-d-LNA相比，α-1-LNA在5'-位杂交的结构要求不同

  摘要：

  报道了R和S -5' -Me-α- 1 - LNA核苷亚磷酰胺和修饰的oligo-2'-脱氧核糖核苷酸的合成和生物物理评价。从双丙酮葡萄糖开始，以克数计完成核苷亚磷酰胺的合成。通过使糖5'-醛与MeMgBr反应，引入S构型的5'-甲基。R -5'-Me异构体的合成是通过使用Mitsunobu条件从S -5'-Me核苷通过后期转化完成的。在热变性实验中对修饰寡核苷酸的评估表明，R -5'-Me-α- 1-LNA显示出与α- 1- LNA相似的RNA亲和力，而S -5' -Me类似物的稳定性较差。该结果与β- d系列相反，在β- d系列中，S -5' -Me异构体对RNA表现出LNA样的亲和力，而R -5'-Me基团完全逆转了对双链热稳定性的稳定作用。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2011.11.012

文献信息

• SUBSTITUTED ALPHA-L-BICYCLIC NUCLEOSIDES
  申请人：Isis Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：EP2356129B1

  公开（公告）日：2013-04-03
• US8501805B2
  申请人：——

  公开号：US8501805B2

  公开（公告）日：2013-08-06