5-{3-[3-(7,8-didehydro-1,2:5,6-dibenzocyclooctynyl)oxyamido]propynyl}-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine | 1412707-75-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5-{3-[3-(7,8-didehydro-1,2:5,6-dibenzocyclooctynyl)oxyamido]propynyl}-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine
• CAS: 1412707-75-5
• 化学式: C₅₀H₄₃N₃O₉
• 分子量: 829.906
• InChiKey: AOLSKLQHYFGHQH-JAOKWPPASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.99
• 重原子数：
  62.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  150.34
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-{3-[3-(7,8-didehydro-1,2:5,6-dibenzocyclooctynyl)oxyamido]propynyl}-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以72%的产率得到5-{3-[3-(7,8-didehydro-1,2:5,6-dibenzocyclooctynyl)oxyamido]propynyl}-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine-3'-O-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  OLIGONUCLEOTIDE LIGATION

  摘要：

  一种连接寡核苷酸的方法。该方法包括通过将连接到寡核苷酸的炔基与连接到寡核苷酸的叠氮基反应以形成三唑键来连接一个或多个寡核苷酸。炔基是一种受应力的炔基。该方法可以包括连接一个或多个寡核苷酸的末端或交联寡核苷酸双链的链。所描述的方法允许寡核苷酸链在无需连接酶的情况下连接在一起。

  公开号：

  US20130231473A1
• 作为产物：
  描述：

  碘苷 在 吡啶 、 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 11.42h， 生成 5-{3-[3-(7,8-didehydro-1,2:5,6-dibenzocyclooctynyl)oxyamido]propynyl}-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  OLIGONUCLEOTIDE LIGATION

  摘要：

  一种连接寡核苷酸的方法。该方法包括通过将连接到寡核苷酸的炔基与连接到寡核苷酸的叠氮基反应以形成三唑键来连接一个或多个寡核苷酸。炔基是一种受应力的炔基。该方法可以包括连接一个或多个寡核苷酸的末端或交联寡核苷酸双链的链。所描述的方法允许寡核苷酸链在无需连接酶的情况下连接在一起。

  公开号：

  US20130231473A1