Mapping the S1 and S1’ subsites of cysteine proteases with new dipeptidyl nitrile inhibitors as trypanocidal agents
作者:Lorenzo Cianni、Carina Lemke、Erik Gilberg、Christian Feldmann、Fabiana Rosini、Fernanda dos Reis Rocho、Jean F. R. Ribeiro、Daiane Y. Tezuka、Carla D. Lopes、Sérgio de Albuquerque、Jürgen Bajorath、Stefan Laufer、Andrei Leitão、Michael Gütschow、Carlos A. Montanari
DOI:10.1371/journal.pntd.0007755
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treatment of cutaneous leishmaniasis. The synthesized compounds are dipeptidyl nitriles designed based on the most promising combinations of different moieties in P1 (ten), P2 (six), and P3 (four different building blocks). Eight compounds exhibited a Ki smaller than 20.0 nM for Cz, whereas three compounds met these criteria for LmCPB. Three inhibitors had an EC50 value of ca. 4.0 μM, thus being equipotent
半胱氨酸蛋白酶Cruzipain被认为是治疗南美锥虫病的有效治疗靶标。设计,合成了一系列26种新化合物,并针对重组Cruzain(Cz)进行了测试,以绘制其S1 / S1´子位图。在一组四个人类半胱氨酸蛋白酶(CatB,CatK,CatL,CatS)和墨西哥利什曼原虫CPB(一组可能是治疗皮肤利什曼病的潜在靶标)上对同一系列进行了评估。合成的化合物是基于P1(十个),P2(六个)和P3(四个不同的结构单元)中不同部分最有希望的组合而设计的二肽基腈。八个化合物的Cz的Ki小于20.0 nM,而三个化合物的LmCPB符合这些标准。三种抑制剂的EC50值为ca。4.0微米 因此,根据其抗胰锥作用,与苯硝唑相当。我们的作图方法和各自的结构活性关系为治疗相关的半胱氨酸蛋白酶的特定配体-靶标相互作用提供了见识。