Phenoxy-acetic acid 2-{3-[(2R,4S,5R)-5-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxy)-tetrahydro-furan-2-yl]-5-methyl-2,6-dioxo-3,6-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl}-ethyl ester | 749254-11-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: Phenoxy-acetic acid 2-{3-[(2R,4S,5R)-5-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxy)-tetrahydro-furan-2-yl]-5-methyl-2,6-dioxo-3,6-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl}-ethyl ester
• CAS: 749254-11-3
• 化学式: C₄₇H₅₆N₂O₁₀Si
• 分子量: 837.055
• InChiKey: STSCJMTYHJRMNJ-FEWNNGCESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.64
• 重原子数：
  60.0
• 可旋转键数：
  17.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  125.68
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Phenoxy-acetic acid 2-{3-[(2R,4S,5R)-5-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxy)-tetrahydro-furan-2-yl]-5-methyl-2,6-dioxo-3,6-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl}-ethyl ester 在 咪唑 、 正丙胺 、 碘 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 51.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  错配对齐的 N3T-烷基-N3T 链间交联 DNA：具有可变长度链间交联的双链体的合成和表征

  摘要：

  治疗性双功能烷化剂在双链 DNA 中产生链间交联。作为我们对包含烷基链间交联的 DNA 双链体的持续研究的一部分，我们合成了一种交联，该交联可以连接错配胸苷碱基对的 N(3) 位置。这种交联类似于在错配的胞嘧啶碱基对之间观察到的 N(3)C-烷基-N(3)C 交联，是通过首先在 5 '-寡核苷酸链的末端。然后使用正交方法合成完全交联的双链体以选择性去除保护基团，从而允许通过常规固相寡核苷酸合成构建交联的双链体。具有不同长度（二、四、和七个亚甲基单元），并通过紫外热变性和圆二色光谱研究了它们的物理性质。发现这些链接器相对于非交联双链体，分别将双链体稳定在 37、31 和 16 摄氏度的两碳、四碳和七碳链接器中。圆二色光谱表明，相对于非交联双链 DNA 对照，这些病变在整体结构中引起的偏差非常小。分子模型表明，两碳交联跨越了 TT 错配的 N(3) 原子之间的距离，而不会扰乱螺旋结构，而较长的

  DOI：

  10.1021/ja0498540
• 作为产物：
  描述：

  2-iodoethyl phenoxyacetate 、 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-(t-butyldimethylsilyl)-2'-deoxythymidine 在 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 24.0h， 以87.5%的产率得到Phenoxy-acetic acid 2-{3-[(2R,4S,5R)-5-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxy)-tetrahydro-furan-2-yl]-5-methyl-2,6-dioxo-3,6-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl}-ethyl ester
  参考文献：
  名称：

  错配对齐的 N3T-烷基-N3T 链间交联 DNA：具有可变长度链间交联的双链体的合成和表征

  摘要：

  治疗性双功能烷化剂在双链 DNA 中产生链间交联。作为我们对包含烷基链间交联的 DNA 双链体的持续研究的一部分，我们合成了一种交联，该交联可以连接错配胸苷碱基对的 N(3) 位置。这种交联类似于在错配的胞嘧啶碱基对之间观察到的 N(3)C-烷基-N(3)C 交联，是通过首先在 5 '-寡核苷酸链的末端。然后使用正交方法合成完全交联的双链体以选择性去除保护基团，从而允许通过常规固相寡核苷酸合成构建交联的双链体。具有不同长度（二、四、和七个亚甲基单元），并通过紫外热变性和圆二色光谱研究了它们的物理性质。发现这些链接器相对于非交联双链体，分别将双链体稳定在 37、31 和 16 摄氏度的两碳、四碳和七碳链接器中。圆二色光谱表明，相对于非交联双链 DNA 对照，这些病变在整体结构中引起的偏差非常小。分子模型表明，两碳交联跨越了 TT 错配的 N(3) 原子之间的距离，而不会扰乱螺旋结构，而较长的

  DOI：

  10.1021/ja0498540