N³-ethyl-5′-O-DMT-N⁴-Bz-2′-deoxycytidine-3′-N,N-diisopropyl cyanoethyl phosphoramidite | 1620233-30-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N³-ethyl-5′-O-DMT-N⁴-Bz-2′-deoxycytidine-3′-N,N-diisopropyl cyanoethyl phosphoramidite
• CAS: 1620233-30-8
• 化学式: C₄₈H₅₆N₅O₈P
• 分子量: 861.975
• InChiKey: ZKLJQXJZFGUXOT-YYRMAPRKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.39
• 重原子数：
  62.0
• 可旋转键数：
  19.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  138.77
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N4-苯甲酰基-5′-O-(4,4′-二甲氧基三苯基)-2′-脱氧胞苷 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基乙酰胺 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 N³-ethyl-5′-O-DMT-N⁴-Bz-2′-deoxycytidine-3′-N,N-diisopropyl cyanoethyl phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  Nucleosides and oligonucleotides for studies on reversal of cytotoxic and mutagenic damage of DNA potential diagnostics tools

  摘要：

  该发明涉及高度区域特异性纯度和稳定性的n-烷基化合成核苷酸和磷酰胺酯，以及用于选择性去保护寡核苷酸中保护基的目的，以合成高纯度选择性n-烷基化序列特异性DNA和RNA的方法。这种寡核苷酸对于研究细胞毒性和致突变性DNA损伤的机制、检测和逆转由于甲基化核苷酸、相应的磷酸盐和三磷酸盐及它们的前体在de novo DNA合成过程中导致的细胞毒性和致突变性损伤非常有用。这些试剂可能作为诊断和致突变逆转试剂非常有价值。本发明描述了具有适当核碱基氨基保护的N-1氮烷基化嘌呤和N-3氮烷基化嘧啶，这些化合物在所需条件下选择性去保护，且烷基取代物的迁移最小，用于合成高纯度区域特异性N-1和N-3氮烷基化寡核苷酸。已开发出一种新的过程用于合成N-3氮烷基化胞嘧啶。

  公开号：

  US08785619B1