methyl N-{2-[N'⁴-(4-methoxytrityl)-cytosin-1-yl]-acetyl}-N-{2-[1-(4,4-dimethyl-2,6-dioxo-cyclohexyliden)ethylamino]ethyl}glycinate | 864776-35-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: methyl N-{2-[N'⁴-(4-methoxytrityl)-cytosin-1-yl]-acetyl}-N-{2-[1-(4,4-dimethyl-2,6-dioxo-cyclohexyliden)ethylamino]ethyl}glycinate
• 英文别名: methyl 2-[2-[1-(4,4-dimethyl-2,6-dioxocyclohexylidene)ethylamino]ethyl-[2-[4-[[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethyl]amino]-2-oxopyrimidin-1-yl]acetyl]amino]acetate
• CAS: 864776-35-2
• 化学式: C₄₁H₄₅N₅O₇
• 分子量: 719.838
• InChiKey: NWLGSTAVJOFXCM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.48
• 重原子数：
  53.0
• 可旋转键数：
  14.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  148.93
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl N-{2-[N'⁴-(4-methoxytrityl)-cytosin-1-yl]-acetyl}-N-{2-[1-(4,4-dimethyl-2,6-dioxo-cyclohexyliden)ethylamino]ethyl}glycinate 在 caesium carbonate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 1.5h， 以45%的产率得到N-{2-[N'⁴-(4-methoxytrityl)-cytosin-1-yl]-acetyl}-N-{2-[1-(4,4-dimethyl-2,6-dioxo-cyclohexyliden)ethylamino]ethyl}glycine
  参考文献：
  名称：

  与Fmoc正交的Dde保护的PNA单体，用于合成PNA-肽共轭物

  摘要：

  可以说，肽核酸已成为最有趣的DNA模拟物之一。本文报道了四种新型的1-（4,4-二甲基-2,6-二氧杂环己基）乙基/ 4-甲氧基三苯甲基（Dde / Mmt）保护的PNA单体的有效溶液相合成，然后将其用于通过温和的Dde脱保护策略，与Fmoc化学完全正交，可随意合成Fmoc肽和Dde-PNA。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2005.06.003
• 作为产物：
  描述：

  DDE-OH 在 N,N-diisopropyl-N-ethyl 、 N,N-二异丙基乙胺 、 bromo-tris(1-pyrrolidinyl)phosphonium hexafluorophosphate 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 methyl N-{2-[N'⁴-(4-methoxytrityl)-cytosin-1-yl]-acetyl}-N-{2-[1-(4,4-dimethyl-2,6-dioxo-cyclohexyliden)ethylamino]ethyl}glycinate
  参考文献：
  名称：

  与Fmoc正交的Dde保护的PNA单体，用于合成PNA-肽共轭物

  摘要：

  可以说，肽核酸已成为最有趣的DNA模拟物之一。本文报道了四种新型的1-（4,4-二甲基-2,6-二氧杂环己基）乙基/ 4-甲氧基三苯甲基（Dde / Mmt）保护的PNA单体的有效溶液相合成，然后将其用于通过温和的Dde脱保护策略，与Fmoc化学完全正交，可随意合成Fmoc肽和Dde-PNA。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2005.06.003

文献信息

• Full Orthogonality between Dde and Fmoc:  The Direct Synthesis of PNA−Peptide Conjugates
  作者：Juan Jose Díaz-Mochón、Laurent Bialy、Mark Bradley

  DOI：10.1021/ol049905y

  日期：2004.4.1

  New deprotection conditions for the Dde amine protecting group that are fully orthogonal to Fmoc are described and successfully applied to the dual synthesis of PNA-peptide conjugates.