N-(1-{(1R,3R,4R,7S)-1-{[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]methyl}-7-hydroxy-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]hepta-3-yl}-5-methyl-2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-4-yl)benzamide | 1262529-27-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N-(1-{(1R,3R,4R,7S)-1-{[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]methyl}-7-hydroxy-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]hepta-3-yl}-5-methyl-2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-4-yl)benzamide
• 英文别名: N-[1-[(1R,3R,4R,7S)-1-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-7-hydroxy-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-3-yl]-5-methyl-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
• CAS: 1262529-27-0
• 化学式: C₃₉H₃₈N₄O₇
• 分子量: 674.753
• InChiKey: CAOITSDVFXLVAV-OSZGUBSQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  131
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(1-{(1R,3R,4R,7S)-1-{[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]methyl}-7-hydroxy-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]hepta-3-yl}-5-methyl-2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-4-yl)benzamide 在 二异丙基铵盐四氮唑 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙腈 为溶剂， 反应 14.0h， 生成 (1R,3R,4R,7S)-3-(4-benzamide-5-methyl-2-oxopyrimidin-1-yl)-1-[[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethoxy]methyl]-7-[2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphanyl]oxy-N-methyl-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane-5-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  2'-N-烷基氨基羰基-2'-氨基-LNA：合成、双链体稳定性、核酸酶抗性和体外抗 MicroRNA 活性

  摘要：

  2'-Amino-LNA 具有通过在 2'-氮原子上进行化学修饰而获得各种功能的潜力。本研究的重点是2'- N-烷基氨基羰基 2'-氨基-LNA，它是 2'-氨基-LNA 的衍生物。我们评估了它作为抗 miRNA 寡核苷酸的化学修饰的实际用途。带有胸腺嘧啶和 5-甲基胞嘧啶的 2'-N-烷基氨基羰基取代的 2'-氨基-LNA的亚磷酰胺的合成以良好的收率进行。将 2' - N -alkylaminocarbonyl-2'-amino-LNA 单体掺入寡核苷酸中可提高互补 RNA 链的双链体稳定性和强大的核酸酶抗性。此外，2'- N-alkylaminocarbonyl-2'-amino-LNA 是一种很有前途的支架，可显着提高抗 miRNA 寡核苷酸的效力。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2022.117148
• 作为产物：
  描述：

  N-(2,3-二氢-5-甲基-2-氧代-4-嘧啶基)-苯甲酰胺 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 1.25h， 生成 N-(1-{(1R,3R,4R,7S)-1-{[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]methyl}-7-hydroxy-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]hepta-3-yl}-5-methyl-2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-4-yl)benzamide
  参考文献：
  名称：

  GuNA 嘌呤/嘧啶核苷和寡核苷酸的合成和性质

  摘要：

  我们最近设计了胍桥核酸 (GuNA)，合成了带有胸腺嘧啶 (T) 核碱基的 GuNA，并成功地掺入了寡核苷酸中。GuNA-T 修饰的寡核苷酸对其互补的单链 RNA 具有高双链体形成能力，并且对 3'-外切核酸酶高度稳定。因此，GuNA 是一种很有前途的用于治疗性反义寡核苷酸的人工核酸。我们在此报告了带有腺嘌呤 (A)、鸟嘌呤 (G) 和 5-甲基胞嘧啶 ( m C) 核碱基的 GuNA 亚磷酰胺的简便合成方法，以及制备 GuNA 修饰寡核苷酸的稳健方法，即使序列具有酸敏感性嘌呤核碱基。用 GuNA-A、-G 或-m修饰的寡核苷酸C具有高双链形成能力，类似于用GuNA-T修饰的那些。此外，一些 GuNA 修饰的寡核苷酸显示出与其天然对应物相比具有较高的碱基识别能力。GuNA 核苷在细菌回复突变试验中没有表现出基因毒性。因此，所有 GuNA（GuNA-T、-A、-G 和-m C）现在都可以在治疗应用中进行检查。

  DOI：

  10.1039/d0ob01970d

文献信息

• CROSSLINKED ARTIFICIAL NUCLEIC ACID ALNA
  申请人：MITSUBISHI TANABE PHARMA CORPORATION

  公开号：US20220002336A1

  公开（公告）日：2022-01-06

  The present invention provides a novel bridged artificial nucleic acid and an oligomer containing the same as a monomer. The present invention provides specifically a compound represented by general formula (I) (wherein each symbol is the same as defined in the specification) or salts thereof; as well as an oligonucleotide compound represented by general formula (I′) (wherein each symbol is the same as defined in the specification) or salts thereof.

  本发明提供了一种新型的桥接人工核酸和含有该人工核酸作为单体的寡聚物。本发明具体提供了一种由通式（I）表示的化合物（其中每个符号与规范中定义的相同）或其盐；以及由通式（I'）表示的寡核苷酸化合物（其中每个符号与规范中定义的相同）或其盐。
• CROSSLINKED NUCLEIC ACID GUNA, METHOD FOR PRODUCING SAME, AND INTERMEDIATE COMPOUND
  申请人：MITSUBISHI TANABE PHARMA CORPORATION

  公开号：US20180251488A1

  公开（公告）日：2018-09-06

  The present invention provides a method for producing guanidine crosslinked artificial nucleic acid (abbreviated hereinafter as GuNA), and an intermediate compound for the production thereof. Specifically, the present invention provides a method for producing a compound represented by general formula I: (in the formula, R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 , R 6 , m and ring A are as defined in the specification) or a salt thereof wherein a reducing agent is reacted with a compound represented by general formula II: (in the formula, R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 , R 6 , m, and ring A′ are as defined in the specification).

  本发明提供了一种生产胍交联人工核酸（以下简称为GuNA）的方法，以及用于其生产的中间化合物。具体而言，本发明提供了一种生产由通式I表示的化合物的方法：（在该式中，R1、R2、R3、R4、R5、R6、m和环A如规范中定义）或其盐，其中还包括将还原剂与通式II表示的化合物发生反应的步骤：（在该式中，R1、R2、R3、R4、R5、R6、m和环A'如规范中定义）。
• Synthesis and properties of oligonucleotides modified with an <i>N</i>-methylguanidine-bridged nucleic acid (GuNA[Me]) bearing adenine, guanine, or 5-methylcytosine nucleobases
  作者：Naohiro Horie、Takao Yamaguchi、Shinji Kumagai、Satoshi Obika

  DOI：10.3762/bjoc.17.54

  日期：——

  Chemical modifications have been extensively used for therapeutic oligonucleotides because they strongly enhance the stability against nucleases, binding affinity to the targets, and efficacy. We previously reported that oligonucleotides modified with an N-methylguanidine-bridged nucleic acid (GuNA[Me]) bearing the thymine (T) nucleobase show excellent biophysical properties for applications in antisense

  化学修饰已广泛用于治疗性寡核苷酸，因为它们可以大大增强对核酸酶的稳定性，与靶标的结合亲和力和功效。我们以前曾报道过，用带有胸腺嘧啶（T）核碱基的N-甲基胍桥连核酸（GuNA [Me]）修饰的寡核苷酸显示出优异的生物物理特性，可用于反义技术。在本文中，我们描述了带有其他典型核碱基，包括腺嘌呤（A），鸟嘌呤（G）和5-甲基胞嘧啶（mC）。按照先前为GuNA [Me] -T-修饰的寡核苷酸开发的方法，将亚磷酰胺成功地掺入到寡核苷酸中。系统评价了用GuNA [Me] -A，-G或-m C修饰的寡核苷酸对互补单链DNA或RNA的结合亲和力。发现所有的GuNA [Me]修饰的寡核苷酸都对RNA具有很强的亲和力。这些数据表明，GuNA [Me]可能是治疗性反义寡核苷酸的有用修饰。
• Novel insights into the use of Glowing LNA as nucleic acid detection probes—Influence of labeling density and nucleobases
  作者：Michael E. Østergaard、Jyotirmoy Maity、B. Ravindra Babu、Jesper Wengel、Patrick J. Hrdlicka

  DOI：10.1016/j.bmcl.2010.10.089

  日期：2010.12

  nucleic acid) display large increases in fluorescence intensity and remarkably high quantum yields upon hybridization with nucleic acid targets. Thermal denaturation and fluorescence spectroscopy studies on ONs modified with known thymine monomer X and novel 5-methylcytosine monomer Y provide new insights into the design principles and mechanism of these Glowing LNA nucleic acid detection probes.

  适当设计的2' - N-（吡啶-1-基）羰基-2'-氨基-LNA（锁定核酸）与核酸靶标杂交后，荧光强度显着提高，量子产率显着提高。用已知的胸腺嘧啶单体X和新型的5-甲基胞嘧啶单体Y修饰的ON的热变性和荧光光谱研究为这些发光LNA核酸检测探针的设计原理和机理提供了新的见解。
• Parallel synthesis of oligonucleotides containing <i>N</i>-acyl amino-LNA and their therapeutic effects as anti-microRNAs
  作者：Tomo Takegawa-Araki、Kai Yasukawa、Norihiko Iwazaki、Hideto Maruyama、Hiroyuki Furukawa、Hiroaki Sawamoto、Satoshi Obika

  DOI：10.1039/d2ob01809h

  日期：——

  (ALNA), maintains excellent duplex stability, and the nitrogen at the 2′-position is an attractive scaffold for functionalization. Herein, a facile and efficient method for the synthesis of various 2′-N-acyl amino-LNA derivatives by direct acylation of the 2′-amino moiety contained in the synthesized oligonucleotides and its fundamental properties are described. The introduction of the acylated amino-LNA

  2'-氨基锁核酸 (ALNA)，保持出色的双链体稳定性，2'-位置的氮是功能化的有吸引力的支架。在此，描述了通过直接酰化合成的寡核苷酸中包含的 2'-氨基部分来合成各种 2' - N-酰基氨基-LNA 衍生物的简便有效的方法及其基本特性。酰化氨基-LNA 的引入增强了分子作为治疗性抗 microRNA 寡核苷酸的效力。