摘要:
利用 "点击 "化学将尼罗蓝发色团加入寡核苷酸中,对寡核苷酸进行合成后修饰。这些寡核苷酸是用带有炔基的 DNA 构建块 3 合成的,并与叠氮化物 4 反应。(R)-3-氨基-1,2-丙二醇用作磷酸二酯桥之间的连接物。制备了两组 DNA 双链体。一组在 A-T 环境中携带发色团,另一组在 G-C 环境中携带发色团。这两组双链都通过光学光谱进行了表征。序列依赖性荧光淬灭是一种灵敏的工具,用于比较堆叠相互作用与无环连接体附件手性的关系。除了连接体的手性相反((S)-3-氨基-1,2-丙二醇)外,该结果与最近在顺序和结构相同的情况下携带尼罗蓝标记的双链体的结果进行了比较。观察到的差异微乎其微,可以忽略不计。熔融温度、紫外-可见吸收光谱以及荧光淬灭数据表明,无论尼罗蓝是通过 S 型还是 R 型连接体连接,它都能在相邻碱基对之间完美堆叠。这一结果得到了 DNA 几何优化模型的支持。