5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(6-trifluoroacetamido)hexyluridine | 912641-74-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(6-trifluoroacetamido)hexyluridine
• CAS: 912641-74-8
• 化学式: C₃₈H₄₂F₃N₃O₉
• 分子量: 741.761
• InChiKey: TVXNKAGCCMGMTN-DWNQJFHRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.44
• 重原子数：
  53.0
• 可旋转键数：
  17.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  150.34
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(6-trifluoroacetamido)hexyluridine 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以98%的产率得到5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(6-trifluoroacetamido)hexyluridine-3'-O-(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylphosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  DELIVERY OF OLIGONUCLEOTIDES TO THE STRIATUM

  摘要：

  本发明的一个方面涉及双链iRNA剂，包括一个与目标基因互补的反义链;一个与该反义链互补的正义链;以及一个或多个脂溶性基团，通过连接物或载体与至少一条链上的一个或多个内部位置结合，从而实现对中枢神经系统组织和细胞，特别是纹状体的靶向和摄取。本发明的另一个方面涉及一种在中枢神经系统组织和细胞，特别是纹状体中基因沉默的方法，包括向需要治疗的组织/细胞或受试者中注射足够疗效量的脂溶性基团结合的双链iRNA。

  公开号：

  US20220307024A1
• 作为产物：
  描述：

  N-trifluoroacetyl-(6-aminohexyl)-1-tosylate 在 potassium iodide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， 反应 23.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(6-trifluoroacetamido)hexyluridine
  参考文献：
  名称：

  Zwitterionic Oligonucleotides: A Study on Binding Properties of 2′-O-Aminohexyl Modifications

  摘要：

  2'-O-Aminohexyl side chains provide excellent conditions for zwitterionic interstrand and intrastrand interactions of oligonucleolides. 2'-O-Aminoalkylatedphosphoramidites of adenosine and uridine were synthesized and incorporated in increasing number into homo adenosine and homo uridine/thymidine dodecamers, respectively. CD spectra of these dodecamers with complementary sense DNA exhibited a B-DNA type structure. While duplex stability values of all tested oligonucleotides were lower than those Of the native oligonucleotides, they were significantly higher than those of 2'-O-heptyl modified oligonucleotides. The destabilization amounted to 0.9, 1.5, and 2.7 degrees C per modification for 2'-O-aminohexyl adenosine, 2'-O-aminohexyl uridine, and 2'-O-heptyl adenosine substitutions. These findings are pointing to a duplex stabilizing effect of the interaction of side chain amino groups with backbone phosphoric acid.

  DOI：

  10.1081/ncn-200067400

文献信息

• EXTRAHEPATIC DELIVERY
  申请人：ALNYLAM PHARMACEUTICALS, INC.

  公开号：US20220125823A1

  公开（公告）日：2022-04-28

  The invention relates to a method of gene silencing, comprising administering to a cell or a subject in need thereof a therapeutically effective amount of the lipophilic moieties-conjugated double-stranded iRNAs at one or more internal positions on at least one strand, optionally via a linker or carrier.

  本发明涉及一种基因沉默方法，包括向细胞或需要治疗的受体中给予脂溶性基团偶联的双链iRNA，在至少一条链的一个或多个内部位置上给予治疗有效量，可选地通过连接剂或载体给予。
• [EN] EXTRAHEPATIC DELIVERY<br/>[FR] ADMINISTRATION EXTRA-HÉPATIQUE
  申请人：ALNYLAM PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2021092371A3

  公开（公告）日：2021-06-17
• [EN] TRANSTHYRETIN (TTR) IRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF FOR TREATING OR PREVENTING TTR-ASSOCIATED OCULAR DISEASES<br/>[FR] COMPOSITION D'ARNI DE LA TRANSTHYRÉTINE (TTR) ET SES PROCÉDÉS D'UTILISATION POUR LE TRAITEMENT OU LA PRÉVENTION DE MALADIES OCULAIRES ASSOCIÉES À TTR
  申请人：ALNYLAM PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2021092145A8

  公开（公告）日：2021-07-08