5'-O-DMT-iodouracil | 351344-33-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-DMT-iodouracil
• 英文别名: 1-[(2S,4R,5S)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-iodopyrimidine-2,4-dione
• CAS: 351344-33-7
• 化学式: C₃₀H₂₉IN₂O₇
• 分子量: 656.474
• InChiKey: RLDUYGSOCGOJTP-PVHODMMVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.82
• 重原子数：
  40.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  112.01
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-DMT-iodouracil 、 叔丁基二甲基氯硅烷 在 N-甲基咪唑 、 碘 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.0h， 以100%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  WO2020081744A5

  摘要：

  公开号：

  WO2020081744A5

文献信息

• Supramolecular helical porphyrin arrays using DNA as a scaffold
  作者：Imenne Bouamaied、ThaoNguyen Nguyen、Thomas Rühl、Eugen Stulz

  DOI：10.1039/b813584c

  日期：——

  A diphenyl porphyrin substituted nucleotide was incorporated site specifically into DNA, leading to helical stacked porphyrin arrays in the major groove of the duplexes. The porphyrins show an electronic interaction which is significantly enhanced compared to the analogous tetraphenyl porphyrin (TPP) as shown in the large exciton coupling of the porphyrin B-band absorbance. Analogous to the TPP–DNA, an induced helical secondary structure is observed in the single strand porphyrin–DNA. The modified DNA can be hybridised to an immobilised complementary strand leading to fluorescent beads.

  二苯基卟啉取代的核苷酸被特异性地掺入 DNA 中，从而在双链体的主沟中形成螺旋堆叠的卟啉阵列。与类似的四苯基卟啉 (TPP) 相比，卟啉显示出显着增强的电子相互作用，如卟啉 B 波段吸光度的大激子耦合所示。与 TPP-DNA 类似，在单链卟啉-DNA 中观察到诱导螺旋二级结构。修饰后的 DNA 可以与固定的互补链杂交，形成荧光珠。