5'(S)-C-acetoxymethyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)thymidine | 189307-35-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'(S)-C-acetoxymethyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)thymidine
• 英文别名: DMT(-5)2-deoxy-L-lyxHexf6Ac(a)-thymin-1-yl；[(2S)-2-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-2-[(2S,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]ethyl] acetate
• CAS: 189307-35-5
• 化学式: C₃₄H₃₆N₂O₉
• 分子量: 616.668
• InChiKey: IXCLFPPRHFQYNK-MBEDZMRZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  45
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  133
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'(S)-C-acetoxymethyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)thymidine 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 5.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 5′-C-Branched Thymidines and Conversion to Phosphoramidites

  摘要：

  Thymidine was converted to its 5'-epoxy derivative, which was reacted with nucleophiles to give 5'-C-aminomethyl-, 5'-C-bromomethyl-, 5'-C-cyanomethyl, and 5'-C-methoxymethylthymidine derivatives with defined stereochemistry. 5'-C-ally-, 5'-C-hydroxymethyl-, 5'-C-hydroxypropyl-, and 5'-C-(imidazole-4-acetamido)metbylthymidine derivatives were also prepared. The 5'-C-branched thymidines were converted to the corresponding phosphoramidites.

  DOI：

  10.1080/07328319808004219
• 作为产物：
  描述：

  在 四丁基氟化铵 、 silver trifluoromethanesulfonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 136.0h， 生成 5'(S)-C-acetoxymethyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)thymidine
  参考文献：
  名称：

  5'- C-羟基烷基胸苷的合成及其掺入寡脱氧核苷酸

  摘要：

  5'- Ç羟基甲基，5'- Ç羟乙基，和5'- Ç -hydroxypropylthymidine衍生物通过四个合成路线，其构成在胸苷的C5'引入不同长度的羟烷基的方法制备。将5'- C-羟甲基-胸苷和5'- C-羟丙基胸苷转化为相应的亚磷酰胺，并掺入寡脱氧核苷酸中。©1997爱思唯尔科学有限公司。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(97)00386-9