1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-[methoxy(oxido)phosphaniumyl]oxyoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-[methoxy(oxido)phosphaniumyl]oxyoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• 化学式: C₃₇H₄₇N₂O₁₀PSi
• 分子量: 738.847
• InChiKey: OFFIPXXKSWLCDQ-DWNQJFHRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.2
• 重原子数：
  51
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  137
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridin-3'-yl H-phosphonate 在 2,6-二甲基吡啶 、 三甲基乙酰氯 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-[methoxy(oxido)phosphaniumyl]oxyoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  通过H-膦酸酯方法形成核苷酸间键的立体化学。第3部分：不对称感应机制的研究

  摘要：

  使用31 P NMR光谱研究了以核糖核苷H-膦酸酯为底物的H-膦酸酯二酯键形成（包括核苷酸间键）的立体化学。发现所研究的反应归因于它们的立体选择性，这归因于动态动力学不对称转化。根据它们的31 P NMR化学位移，初步确定了参与反应路径的化合物的绝对构型，并验证了H-膦酸酯-新戊酸酯混合酸酐和H-膦酸酯芳基酯的正确性。

  DOI：

  10.1016/j.tetasy.2007.09.017

文献信息

• The role of nucleophilic catalysis in chemistry and stereochemistry of ribonucleosideH-phosphonate condensation
  作者：Michal Sobkowski、Jacek Stawinski、Adam Kraszewski

  DOI：10.1039/b812780h

  日期：——

  The efficiency and stereoselectivity of condensation of ribonucleoside 3′-H-phosphonates with alcohols were investigated as a function of amines used for the reaction. It was found that irrespective of the presence or absence of nucleophilic catalysts, the Dynamic Kinetic Asymmetric Transformation (DYKAT) was the major factor responsible for the stereoselective formation of the DP(SP) isomers of the H-phosphonate diesters, and a mechanistic rationalization of this observation was proposed. In addition, studies on the reactions carried out in the presence of various bases led to the conclusion that certain sterically hindered pyridines, e.g.2,6-lutidine, may act as nucleophilic catalysts in the condensation of ribonucleoside 3′-H-phosphonates with alcohols.

  研究了核糖核苷3′-H-磷酸酯与醇的缩合反应的效率和立体选择性，作为反应中使用的胺的函数。结果发现，无论是否存在亲核催化剂，动态动力学不对称转化（DYKAT）是导致H-磷酸二酯DP(SP)异构体立体选择性形成的主要因素，并提出了对此观察结果的机制解释。此外，对在各种碱存在下进行的反应的研究得出结论，某些空间位阻较大的吡啶类化合物，例如2,6-路丁啶，可能在核糖核苷3′-H-磷酸酯与醇的缩合反应中起到亲核催化剂的作用。
• Chemistry and stereochemistry of internucleotide bond formation by the H-phosphonate method
  作者：Michal Sobkowski

  DOI：10.1039/b9nj00679f

  日期：——

  The appropriately protected ribonucleoside 3′-H-phosphonates react with nucleosides and alcohols in the presence of condensing agents under mild conditions, with notable stereoselectivity. The chemistry and stereochemistry of this reaction were investigated using 31P NMR spectroscopy. A plausible mechanism for the asymmetric induction observed was identified as Dynamic Kinetic Asymmetric Transformation

  适当保护的核糖核苷3'- H-膦酸酯在缩合剂存在下，在温和条件下，以明显的立体选择性与核苷和醇反应。使用31 P NMR光谱研究了该反应的化学和立体化学。观察到的不对称诱导的合理机制被确定为动态动力学不对称转化（DYKAT），其作用是由于反应性中间体的快速平衡P-表异构体的酯化速率不同。这种不同的反应性暂时归因于H的空间需求-膦酸部分位于2'-位的大保护基团附近。分析了亲核和碱催化的作用，并使用31 P NMR立体化学相关分析初步确定了参与反应途径的中间体的绝对构型。在最佳反应条件下，通常可以> 90:10的比例获得二核苷H-膦酸酯二酯的非对映异构体。