2-((1E,3E,5Z)-5-{1-[6-({6-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]-5-hydroxyhexyl}amino)-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-1,3-dihydro-2H-indol-2-ylidene}penta-1,3-dien-1-yl)-1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indolium-5-sulfonate | 1186301-42-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 2-((1E,3E,5Z)-5-{1-[6-({6-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]-5-hydroxyhexyl}amino)-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-1,3-dihydro-2H-indol-2-ylidene}penta-1,3-dien-1-yl)-1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indolium-5-sulfonate
• CAS: 1186301-42-7
• 化学式: C₆₀H₇₁N₃O₈S
• 分子量: 994.305
• InChiKey: WGACYZOUAZRNDT-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  11.01
• 重原子数：
  72.0
• 可旋转键数：
  24.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  140.47
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-((1E,3E,5Z)-5-{1-[6-({6-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]-5-hydroxyhexyl}amino)-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-1,3-dihydro-2H-indol-2-ylidene}penta-1,3-dien-1-yl)-1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indolium-5-sulfonate 、 双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 在 四氮唑 作用下， 以 吡啶 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.75h， 以80%的产率得到2-((1E,3E)-5-((Z)-1-(6-((6-(bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)-5-(((2-cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphaneyl)oxy)hexyl)amino)-6-oxohexyl)-3,3-dimethylindolin-2-ylidene)penta-1,3-dien-1-yl)-1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium-5-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  New Indocyanine Derivatives for the Synthesis of Fluorescently Labeled Oligonucleotides

  摘要：

  新型磺化的Cy3和Cy5磷酸酰胺体以及固相支持物被合成。这些构建块用于合成末端或内部标签的寡脱氧核苷酸。对硫氰酸酯标记的寡核苷酸采用了温和的去保护方案。

  DOI：

  10.2174/157017809787003160
• 作为产物：
  描述：

  6-amino-1-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]hexane-2-ol 、 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.33h， 以130 mg的产率得到2-((1E,3E,5Z)-5-{1-[6-({6-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]-5-hydroxyhexyl}amino)-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-1,3-dihydro-2H-indol-2-ylidene}penta-1,3-dien-1-yl)-1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indolium-5-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  New Indocyanine Derivatives for the Synthesis of Fluorescently Labeled Oligonucleotides

  摘要：

  新型磺化的Cy3和Cy5磷酸酰胺体以及固相支持物被合成。这些构建块用于合成末端或内部标签的寡脱氧核苷酸。对硫氰酸酯标记的寡核苷酸采用了温和的去保护方案。

  DOI：

  10.2174/157017809787003160