5’-O-DMT-3’-O-[methyl-(N,N-diisopropyl)]-phosphoramidite-2’-O-dimethylhydroxylaminothionocarbamate uridine | 1082068-94-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5’-O-DMT-3’-O-[methyl-(N,N-diisopropyl)]-phosphoramidite-2’-O-dimethylhydroxylaminothionocarbamate uridine
• 英文别名: 2'-O-(N,O-dimethylhydroxylamino-carbothioate)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-uridine-3'-O-[methyl-(N,N-diisopropyl)]-phosphoramidite；O-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-[[di(propan-2-yl)amino]-methoxyphosphanyl]oxyoxolan-3-yl] N-methoxy-N-methylcarbamothioate
• CAS: 1082068-94-7
• 化学式: C₄₀H₅₁N₄O₁₀PS
• 分子量: 810.905
• InChiKey: GTYUOJKFJVGNDJ-GJBNTKBYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.8
• 重原子数：
  56
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  162
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5',3'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-1-imidazole thionocarbamate 在 吡啶 、 2,4,6-三甲基吡啶 、 pyridine hydrofluoride 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙腈 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 5’-O-DMT-3’-O-[methyl-(N,N-diisopropyl)]-phosphoramidite-2’-O-dimethylhydroxylaminothionocarbamate uridine
  参考文献：
  名称：

  Thiocarbon-protecting groups for RNA synthesis

  摘要：

  公开号：

  EP2476689B1

文献信息

• PROTECTED MONOMER AND METHOD OF FINAL DEPROTECTION FOR RNA SYNTHESIS
  申请人：Dellinger Douglas J.

  公开号：US20100076183A1

  公开（公告）日：2010-03-25

  A nucleoside monomer that is protected by a thionocarbamate protecting group is provided, as well as a method for making a polynucleotide that uses the same. Also provided is a polynucleotide synthesis method that employs a diamine to deprotect a protected polynucleotide.

  提供了一种由硫代氨基甲酸酯保护基保护的核苷单体，以及使用该核苷单体制备多核苷酸的方法。还提供了一种利用二胺去保护受保护多核苷酸的多核苷酸合成方法。
• Thiocarbon-protecting groups for RNA synthesis
  申请人：Agilent Technologies, Inc.

  公开号：EP2476689B1

  公开（公告）日：2015-10-21