5'-O-dimethoxytritylthymidine-3'-N,N-dimethylaminomethylphosphine | 90814-43-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-dimethoxytritylthymidine-3'-N,N-dimethylaminomethylphosphine
• CAS: 90814-43-0
• 化学式: C₃₄H₄₀N₃O₇P
• 分子量: 633.681
• InChiKey: RLBAVHGXXHBFFV-GQXHNSCASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.05
• 重原子数：
  45.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  104.25
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷 、 5'-O-dimethoxytritylthymidine-3'-N,N-dimethylaminomethylphosphine 在 咪唑 、 碘 作用下， 生成 1-[(2R,4S,5R)-4-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-5-[[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-methylphosphoryl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  使用亚磷酰胺中间体合成寡脱氧核苷酸和寡脱氧核苷酸类似物

  摘要：

  据报道，合成了两个脱氧寡核苷酸d（GTGAGTTAGCTCAC）和d（GTGAGCTAACTCAC），它们对应于环状AMP受体蛋白的DNA结合位点。使用硅胶聚合物载体方法和单核苷酸亚磷酰胺可以完成毫克量的这些合成。还报道了合成二核苷甲基膦酸酯3亚磷酰胺的非对映异构体的方法。

  DOI：

  10.1016/0040-4020(84)85107-8
• 作为产物：
  描述：

  N,N-dimethylaminomethylchlorophosphine 、 保护胸苷 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以95%的产率得到5'-O-dimethoxytritylthymidine-3'-N,N-dimethylaminomethylphosphine
  参考文献：
  名称：

  使用亚磷酰胺中间体合成寡脱氧核苷酸和寡脱氧核苷酸类似物

  摘要：

  据报道，合成了两个脱氧寡核苷酸d（GTGAGTTAGCTCAC）和d（GTGAGCTAACTCAC），它们对应于环状AMP受体蛋白的DNA结合位点。使用硅胶聚合物载体方法和单核苷酸亚磷酰胺可以完成毫克量的这些合成。还报道了合成二核苷甲基膦酸酯3亚磷酰胺的非对映异构体的方法。

  DOI：

  10.1016/0040-4020(84)85107-8