(1S,3R,4S,7R)-3-(6-N-benzoyladenin-9-yl)-5-(4,4′-dimethoxytrityl)-1-(4,4′-dimethoxytrityloxymethyl)-7-hydroxy-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane | 1513633-26-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: (1S,3R,4S,7R)-3-(6-N-benzoyladenin-9-yl)-5-(4,4′-dimethoxytrityl)-1-(4,4′-dimethoxytrityloxymethyl)-7-hydroxy-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane
• 英文别名: N-[9-[(1S,3R,4S,7R)-1-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethyl]-7-hydroxy-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-3-yl]purin-6-yl]benzamide
• CAS: 1513633-26-5
• 化学式: C₆₀H₅₄N₆O₈
• 分子量: 987.124
• InChiKey: SVQIOBXUONNBEE-OLOUJZPDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.1
• 重原子数：
  74
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  11.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  152
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1S,3R,4S,7R)-3-(6-N-benzoyladenin-9-yl)-5-(4,4′-dimethoxytrityl)-1-(4,4′-dimethoxytrityloxymethyl)-7-hydroxy-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane 以 甲醇 、 硝基甲烷 为溶剂， 反应 0.25h， 以96%的产率得到(1S,3R,4S,7R)-3-(6-N-benzoyladenin-9-yl)-7-hydroxy-1-hydroxymethyl-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  用 2'-氨基-α-l-LNA 腺嘌呤单体修饰的寡脱氧核糖核苷酸的合成和表征：单链 DNA 的高亲和力靶向

  摘要：

  由于在反义、反基因和其他基因靶向策略中的成功应用，构象受限核苷酸构建模块的开发继续吸引着相当大的兴趣。锁核酸 (LNA) 及其非对映异构体 α- 1- LNA 是其中两个有趣的例子。相对于未修饰的链，用这些单元修饰的寡核苷酸显示出对核酸靶标的极大增加的亲和力、改进的结合特异性和增强的酶稳定性。在这里，我们展示了用 2'-氨基-α - l - LNA 腺嘌呤单体W - Z修饰的寡脱氧核糖核苷酸 (ON) 的合成和生物物理表征。目标亚磷酰胺的合成1 –4从五呋喃糖5 开始，在 Vorbrüggen 糖基化、O2'-脱酰化、O2'-活化和 C2'-叠氮化物引入后产生核苷8。一锅串联施陶丁格/分子内亲核取代将8转化为 2'-氨基-α - l -LNA 腺嘌呤中间体9，经过一系列非平凡的保护基操作后提供关键中间体15。随后的化学选择性N2'官能化和O3'-亚磷酸化给予目标1 - 4在~1-3％的总收率从超过11个步骤5。用芘功能化的

  DOI：

  10.1021/jo4022937
• 作为产物：
  描述：

  (1S,3R,4S,7R)-3-(6-N-benzoyladenin-9-yl)-1-benzoyloxymethyl-7-hydroxy-5-trifluoroacetyl-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane 在 吡啶 、 sodium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 反应 25.0h， 生成 (1S,3R,4S,7R)-3-(6-N-benzoyladenin-9-yl)-5-(4,4′-dimethoxytrityl)-1-(4,4′-dimethoxytrityloxymethyl)-7-hydroxy-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  用 2'-氨基-α-l-LNA 腺嘌呤单体修饰的寡脱氧核糖核苷酸的合成和表征：单链 DNA 的高亲和力靶向

  摘要：

  由于在反义、反基因和其他基因靶向策略中的成功应用，构象受限核苷酸构建模块的开发继续吸引着相当大的兴趣。锁核酸 (LNA) 及其非对映异构体 α- 1- LNA 是其中两个有趣的例子。相对于未修饰的链，用这些单元修饰的寡核苷酸显示出对核酸靶标的极大增加的亲和力、改进的结合特异性和增强的酶稳定性。在这里，我们展示了用 2'-氨基-α - l - LNA 腺嘌呤单体W - Z修饰的寡脱氧核糖核苷酸 (ON) 的合成和生物物理表征。目标亚磷酰胺的合成1 –4从五呋喃糖5 开始，在 Vorbrüggen 糖基化、O2'-脱酰化、O2'-活化和 C2'-叠氮化物引入后产生核苷8。一锅串联施陶丁格/分子内亲核取代将8转化为 2'-氨基-α - l -LNA 腺嘌呤中间体9，经过一系列非平凡的保护基操作后提供关键中间体15。随后的化学选择性N2'官能化和O3'-亚磷酸化给予目标1 - 4在~1-3％的总收率从超过11个步骤5。用芘功能化的

  DOI：

  10.1021/jo4022937

文献信息

• Synthesis and Characterization of Oligodeoxyribonucleotides Modified with 2′-Amino-α-<scp>l</scp>-LNA Adenine Monomers: High-Affinity Targeting of Single-Stranded DNA
  作者：Nicolai K. Andersen、Brooke A. Anderson、Jesper Wengel、Patrick J. Hrdlicka

  DOI：10.1021/jo4022937

  日期：2013.12.20

  acid targets, improved binding specificity, and enhanced enzymatic stability relative to unmodified strands. Here we present the synthesis and biophysical characterization of oligodeoxyribonucleotides (ONs) modified with 2′-amino-α-l-LNA adenine monomers W–Z. The synthesis of the target phosphoramidites 1–4 is initiated from pentafuranose 5, which upon Vorbrüggen glycosylation, O2′-deacylation, O2′-activation

  由于在反义、反基因和其他基因靶向策略中的成功应用，构象受限核苷酸构建模块的开发继续吸引着相当大的兴趣。锁核酸 (LNA) 及其非对映异构体 α- 1- LNA 是其中两个有趣的例子。相对于未修饰的链，用这些单元修饰的寡核苷酸显示出对核酸靶标的极大增加的亲和力、改进的结合特异性和增强的酶稳定性。在这里，我们展示了用 2'-氨基-α - l - LNA 腺嘌呤单体W - Z修饰的寡脱氧核糖核苷酸 (ON) 的合成和生物物理表征。目标亚磷酰胺的合成1 –4从五呋喃糖5 开始，在 Vorbrüggen 糖基化、O2'-脱酰化、O2'-活化和 C2'-叠氮化物引入后产生核苷8。一锅串联施陶丁格/分子内亲核取代将8转化为 2'-氨基-α - l -LNA 腺嘌呤中间体9，经过一系列非平凡的保护基操作后提供关键中间体15。随后的化学选择性N2'官能化和O3'-亚磷酸化给予目标1 - 4在~1-3％的总收率从超过11个步骤5。用芘功能化的