3'-(2'-deoxy)cytidilic acid mono[(2R)-2,3-dihydroxypropyl] ester | 500882-59-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核糖核苷3'-磷酸盐
• 英文名称: 3'-(2'-deoxy)cytidilic acid mono[(2R)-2,3-dihydroxypropyl] ester
• 英文别名: [(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] [(2R)-2,3-dihydroxypropyl] hydrogen phosphate
• CAS: 500882-59-7
• 化学式: C₁₂H₂₀N₃O₉P
• 分子量: 381.279
• InChiKey: KKGQSOBALKXJHO-PKIKSRDPSA-N

物化性质

• 沸点：
  687.2±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.86±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.8
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  184
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2,2,2-三氟乙基十六烷酸酯 、 3'-(2'-deoxy)cytidilic acid mono[(2R)-2,3-dihydroxypropyl] ester 在 Dowex-50 W (TBA+) 、 lipozyme 作用下， 以 叔丁醇 为溶剂， 反应 48.0h， 以40%的产率得到[(2R)-3-[[(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxypropyl] hexadecanoate
  参考文献：
  名称：

  3'(2')-O-溶血磷脂酰核苷的合成——化学酶促策略的进一步应用

  摘要：

  DNA 的四个 3'-核苷酸的单[(2R)-2,3-二氢丙基]酯，由受保护的核苷亚磷酰胺和 [(4S)-2,2-二甲基-1,3-二氧戊环-4-基] 制备甲醇，在甘油部分的 C-1 羟基处通过脂肪酶催化的转酰基作用与有机溶剂中的活化棕榈酸酯进行区域选择性酰化，得到相关的 3'-O-溶血磷脂酰-2'-脱氧核苷。该合成还适用于制备 5'-脱氧-5-氟尿苷和 5'-脱氧-5'-（甲硫基）腺苷的 3'-O-溶血磷脂酰衍生物，后者的 2'-O-异构体化合物也在制备中。与相关游离核苷的能力相比，还测试了溶血磷脂酰化合物与脂质单层相互作用的增强能力。(© Wiley-VCH Verlag GmbH, 69451 Weinheim, Germany, 2002)

  DOI：

  10.1002/1099-0690(200211)2002:21<3622::aid-ejoc3622>3.0.co;2-4
• 作为产物：
  描述：

  5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯基)-N4-苯甲酰基-2’-脱氧胞苷-3’-(2-氰乙基-N,N-二异丙基)亚磷酰胺 在 四氮唑 、 ammonium hydroxide 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 3'-(2'-deoxy)cytidilic acid mono[(2R)-2,3-dihydroxypropyl] ester
  参考文献：
  名称：

  3'(2')-O-溶血磷脂酰核苷的合成——化学酶促策略的进一步应用

  摘要：

  DNA 的四个 3'-核苷酸的单[(2R)-2,3-二氢丙基]酯，由受保护的核苷亚磷酰胺和 [(4S)-2,2-二甲基-1,3-二氧戊环-4-基] 制备甲醇，在甘油部分的 C-1 羟基处通过脂肪酶催化的转酰基作用与有机溶剂中的活化棕榈酸酯进行区域选择性酰化，得到相关的 3'-O-溶血磷脂酰-2'-脱氧核苷。该合成还适用于制备 5'-脱氧-5-氟尿苷和 5'-脱氧-5'-（甲硫基）腺苷的 3'-O-溶血磷脂酰衍生物，后者的 2'-O-异构体化合物也在制备中。与相关游离核苷的能力相比，还测试了溶血磷脂酰化合物与脂质单层相互作用的增强能力。(© Wiley-VCH Verlag GmbH, 69451 Weinheim, Germany, 2002)

  DOI：

  10.1002/1099-0690(200211)2002:21<3622::aid-ejoc3622>3.0.co;2-4