5-[12-(adamantyl-1-oxyl)-(4,7,10-trioxadodec-1-ynyl)]-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine-3'-(cyanoethyl-N,N'-diisopropyl)phosphoramidite | 1345412-84-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5-[12-(adamantyl-1-oxyl)-(4,7,10-trioxadodec-1-ynyl)]-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine-3'-(cyanoethyl-N,N'-diisopropyl)phosphoramidite
• 英文别名: 3-[[(2R,3S,5R)-5-[5-[3-[2-[2-[2-(1-adamantyloxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]prop-1-ynyl]-2,4-dioxopyrimidin-1-yl]-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
• CAS: 1345412-84-1
• 化学式: C₅₈H₇₅N₄O₁₂P
• 分子量: 1051.23
• InChiKey: MZMPKNRJSRTPAH-VVXUPBJQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.6
• 重原子数：
  75
• 可旋转键数：
  29
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  169
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-溴金刚烷 在 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 5.33h， 生成 5-[12-(adamantyl-1-oxyl)-(4,7,10-trioxadodec-1-ynyl)]-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine-3'-(cyanoethyl-N,N'-diisopropyl)phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  Diamondoid-modified DNA

  摘要：

  我们准备了新型的C5改性三磷酸盐和磷酰胺，具有功能性连接到核苷碱基的金刚石结构。通过使用不同长度的模板进行引物延伸实验，我们研究了这些改性三磷酸盐是否能够被酶催化地纳入DNA中，以及是否可以进一步延伸。我们发现所有三种改性核苷酸都可以在单核苷酸纳入实验中被纳入DNA，但在需要多次纳入改性核苷酸的两个模板中仅部分纳入。改性磷酰胺通过DNA合成器技术引入到寡核苷酸中。所形成的寡核苷酸结构通过圆二色性（CD）和熔点温度（Tm）测量进行检查，发现它们与未改性对应物适应了相似的螺旋构象。

  DOI：

  10.1039/c1ob05929g