methyl 5-(tritylthio)pentanoate | 1205666-83-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: methyl 5-(tritylthio)pentanoate
• 英文别名: Methyl 5-tritylsulfanylpentanoate；methyl 5-tritylsulfanylpentanoate
• CAS: 1205666-83-6
• 化学式: C₂₅H₂₆O₂S
• 分子量: 390.546
• InChiKey: AUPGOZDLGCHLBN-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  486.2±33.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.118±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.1
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  51.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 5-(tritylthio)pentanoate 在 三乙基硅烷 、 二异丁基氢化铝 、 sodium cyanoborohydride 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 乙醚 、 正己烷 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 18.03h， 生成
  参考文献：
  名称：

  烷硫醇修饰的萘啶氨基甲酸酯二聚体（NCD）衍生物的合成及其与G–G错配DNA的结合特性

  摘要：

  据报道，一系列新的DNA结合分子NCD–C n –SH（n = 3、4、5和6），具有NCD（萘啶氨基甲酸酯氨基甲酸酯二聚体）结构域，选择性结合5'中的G–G错配-CGG-3'/ 5'-CGG-3'序列和一个巯基部分，在好氧条件下被氧化后会自发二聚为（NCD–C n –S）2。S–S二聚体（NCD–C n –S）2产生了1：1的结合复合物，具有改善的热稳定性。与CGG / CGG DNA结合的二聚体显示出比单体和先前合成的NCTn衍生物的结合更高的正协同性。二聚体NCD–C n –SH在CGG重复DNA上被选择性地加速，而在CAG重复DNA上没有被选择性地加速。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.7b01632
• 作为产物：
  描述：

  5-溴戊酸甲酯 、 三苯甲硫醇 在 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 2.17h， 以98%的产率得到methyl 5-(tritylthio)pentanoate
  参考文献：
  名称：

  烷硫醇修饰的萘啶氨基甲酸酯二聚体（NCD）衍生物的合成及其与G–G错配DNA的结合特性

  摘要：

  据报道，一系列新的DNA结合分子NCD–C n –SH（n = 3、4、5和6），具有NCD（萘啶氨基甲酸酯氨基甲酸酯二聚体）结构域，选择性结合5'中的G–G错配-CGG-3'/ 5'-CGG-3'序列和一个巯基部分，在好氧条件下被氧化后会自发二聚为（NCD–C n –S）2。S–S二聚体（NCD–C n –S）2产生了1：1的结合复合物，具有改善的热稳定性。与CGG / CGG DNA结合的二聚体显示出比单体和先前合成的NCTn衍生物的结合更高的正协同性。二聚体NCD–C n –SH在CGG重复DNA上被选择性地加速，而在CAG重复DNA上没有被选择性地加速。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.7b01632

文献信息

• Method for preparing largazole analogs and uses thereof
  申请人：Williams Robert M.

  公开号：US20100029731A1

  公开（公告）日：2010-02-04

  Analogs of largazole are described herein. Methods of treating cancer and blood disorders using largazole and largazole analogs and pharmaceutical compositions comprising the same are additionally described herein. Methods for preparing largazole analogs are likewise described.

  本文描述了类似largazole的类似物。此外，还描述了使用largazole和largazole类似物治疗癌症和血液疾病的方法，以及包含它们的药物组合物。同样描述了制备largazole类似物的方法。
• NUCLEOSIDE ANALOGUE, PREPARATION METHOD AND APPLICATION
  申请人：GENEMIND BIOSCIENCES COMPANY LIMITED

  公开号：US20200283467A1

  公开（公告）日：2020-09-10

  Nucleoside or nucleotide analog compounds having the structure shown below, a method for preparing them, and applications in nucleic acid sequencing are disclosed. The compounds have formula (I): wherein L 1 , L 2 , and L 3 are each independently a covalent bond or a covalently linked group; B is a base or a base derivative selected from purines, pyrimidines, or analogs thereof; R 1 is —OH, a phosphate group, or a nucleotide; R 2 as H or a cleavable group; R 3 is a detectable group or a targeting group; R 5 is an inhibitory group; R 4 is H, —NH 2 , or —OR 6 , wherein R 6 is H or a cleavable group; and C is a cleavable group or a cleavable bond.

  揭示了具有下面所示结构的核苷酸或核苷酸类似化合物，其制备方法以及在核酸测序中的应用。这些化合物具有公式（I）：其中L1、L2和L3分别独立地是共价键或共价连接的基团；B是从嘌呤、嘧啶或其类似物中选择的碱基或碱基衍生物；R1是—OH、磷酸基团或核苷酸；R2是H或可裂解基团；R3是可检测基团或靶向基团；R5是抑制基团；R4是H、—NH2或—OR6，其中R6是H或可裂解基团；C是可裂解基团或可裂解键。
• Nucleoside analogue, preparation method and application
  申请人：GENEMIND BIOSCIENCES COMPANY LIMITED

  公开号：US11512106B2

  公开（公告）日：2022-11-29

  Nucleoside or nucleotide analog compounds having the structure shown below, a method for preparing them, and applications in nucleic acid sequencing are disclosed. The compounds have formula (I): wherein L 1 , L 2 , and L 3 are each independently a covalent bond or a covalently linked group; B is a base or a base derivative selected from purines, pyrimidines, or analogs thereof; R 1 is —OH, a phosphate group, or a nucleotide; R 2 as H or a cleavable group; R 3 is a detectable group or a targeting group; R 5 is an inhibitory group; R 4 is H, —NH 2 , or —OR 6 , wherein R 6 is H or a cleavable group; and C is a cleavable group or a cleavable bond.

  本发明公开了具有下图所示结构的核苷或核苷酸类似物化合物、其制备方法以及在核酸测序中的应用。这些化合物具有式（I）： 其中 L 1 , L 2 和 L 3 各自独立地为共价键或共价连接基团； B 是碱或碱衍生物，选自嘌呤、嘧啶或其类似物； R 1 是-OH、磷酸基团或核苷酸；R 2 为 H 或可裂解基团；R 3 是可检测基团或靶向基团；R 5 是抑制基团 4 是 H、-NH 2 或-OR 6 其中 R 6 是 H 或可裂解基团；C 是可裂解基团或可裂解键。
• Method for Preparing Largazole Analogs and Uses Thereof
  申请人：Williams Robert M.

  公开号：US20120264794A1

  公开（公告）日：2012-10-18

  Analogs of largazole are described herein. Methods of treating cancer and blood disorders using largazole and largazole analogs and pharmaceutical compositions comprising the same are additionally described herein. Methods for preparing largazole analogs are likewise described.
• Synthesis of Naphthyridine Carbamate Dimer (NCD) Derivatives Modified with Alkanethiol and Binding Properties of G–G Mismatch DNA
  作者：Takeshi Yamada、Shouta Miki、Anisa Ul’Husna、Akiko Michikawa、Kazuhiko Nakatani

  DOI：10.1021/acs.orglett.7b01632

  日期：2017.8.18

  A series of new DNA binding molecules NCD–Cn–SH (n = 3, 4, 5, and 6) is reported, which possesses the NCD (naphthyridine carbamate dimer) domain selectively binding to the G–G mismatch in the 5′-CGG-3′/5′-CGG-3′ sequence and a thiol moiety, which undergoes spontaneous dimerization to (NCD–Cn–S)2 upon oxidation under aerobic conditions. The S–S dimer (NCD–Cn–S)2 produced the 1:1 binding complex with

  据报道，一系列新的DNA结合分子NCD–C n –SH（n = 3、4、5和6），具有NCD（萘啶氨基甲酸酯氨基甲酸酯二聚体）结构域，选择性结合5'中的G–G错配-CGG-3'/ 5'-CGG-3'序列和一个巯基部分，在好氧条件下被氧化后会自发二聚为（NCD–C n –S）2。S–S二聚体（NCD–C n –S）2产生了1：1的结合复合物，具有改善的热稳定性。与CGG / CGG DNA结合的二聚体显示出比单体和先前合成的NCTn衍生物的结合更高的正协同性。二聚体NCD–C n –SH在CGG重复DNA上被选择性地加速，而在CAG重复DNA上没有被选择性地加速。