2-[3-O-[2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphino]-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-O,4-C-methylene-β-D-ribofuranosyl]pyridine | 928312-65-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 2-[3-O-[2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphino]-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-O,4-C-methylene-β-D-ribofuranosyl]pyridine
• 英文别名: 3-[[(1R,3S,4S,7S)-1-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-pyridin-2-yl-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-7-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
• CAS: 928312-65-6
• 化学式: C₄₁H₄₈N₃O₇P
• 分子量: 725.822
• InChiKey: ZLZXZFXTFPDCDQ-RWQQKNSJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.8
• 重原子数：
  52
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  105
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-[5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-O,4-C-methylene-β-D-ribofuranosyl]pyridine 、 双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 在 二异丙基铵盐四氮唑 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙腈 为溶剂， 反应 5.0h， 以89%的产率得到2-[3-O-[2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphino]-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-O,4-C-methylene-β-D-ribofuranosyl]pyridine
  参考文献：
  名称：

  2'，4'-BNA轴承CGbase对识别的2-吡啶核碱基在并行基序三链DNA †

  摘要：

  我们成功合成了包含脱氧核糖核苷酸（y）带有2-吡啶核碱基或2'，4'-BNA同系物（PY乙）。通过紫外熔融实验，发现2-吡啶是一个非常有前途的核碱基，用于序列选择识别平行基序三元组中双链DNA（dsDNA）中的CG碱基对。而且，PY乙 在TFO中显示出比CG碱基对更强的亲和力 y随着选择性的进一步提高。使用TFO 包括多个 PY乙 单位，三链形成与dsDNA包含三个 CG 观察到碱基对。

  DOI：

  10.1039/c004895j