N-(9-((2r,3r,4r,5r)-5-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3-甲氧基四氢呋喃-2-基)-6-氧代-6,9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺 | 114745-26-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 中文名称: N-(9-((2r,3r,4r,5r)-5-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3-甲氧基四氢呋喃-2-基)-6-氧代-6,9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺
• 中文别名: 5'-O-DMT-N2-异丁酰基-2'-O-甲基鸟苷
• 英文名称: N²-isobutyryl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-methylguanosine
• 英文别名: N-(9-((2R,3R,4R,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-hydroxy-3-methoxytetrahydrofuran-2-yl)-6-oxo-6,9-dihydro-1H-purin-2-yl)isobutyramide；N-isobutyryl-5'-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2'-O-methylguanosine；N2-isobutyryl-2'-O-methyl-5'-O-DMTr guanosine；N-(9-((2R,3R,4R,5R)-5-((Bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-hydroxy-3-methoxytetrahydrofuran-2-yl)-6-oxo-6,9-dihydro-1H-purin-2-yl)isobutyramide；N-[9-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxy-3-methoxyoxolan-2-yl]-6-oxo-1H-purin-2-yl]-2-methylpropanamide
• CAS: 114745-26-5
• 化学式: C₃₆H₃₉N₅O₈
• 分子量: 669.734
• InChiKey: ISQLJOGRNUQHJX-WIFIACMTSA-N

物化性质

• 密度：
  1.35±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  溶于乙腈

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.5
• 重原子数：
  49
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  155
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  10

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P280,P301+P312,P302+P352,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H320,H335

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(9-((2r,3r,4r,5r)-5-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3-甲氧基四氢呋喃-2-基)-6-氧代-6,9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺 在 盐酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 4,5-二氰基咪唑 、 一水合肼 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 22.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Saporin L3的寡核苷酸过渡态类似物

  摘要：

  核糖体失活蛋白（RIP）是已知的最具毒性的物质。使用改良的RIP开展了十几项针对难治性癌症的临床试验，取得了令人瞩目的结果。然而，由于血管渗漏综合征引起的剂量限制性毒性限制了治疗的成功。我们以前已经报道了Saporin L3的一些紧密结合的过渡态类似物，它们模仿小的寡核苷酸底物，其中易感的腺苷已被9-脱氮腺苷基羟基吡咯烷醇衍生物取代。它们提供了开发救援剂的第一步，以防止Saporin L3对非靶向细胞产生毒性。在这里，我们报告了使用溶液相化学方法合成这些化合物和大量过渡态类似物的方法。测试了它们对抑制Saporin L3产生K的抑制作用i值低至3.3 nM，表明抑制的结构要求。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2016.10.059
• 作为产物：
  描述：

  N2-异丁酰-2'-甲氧基鸟苷 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 在 吡啶 作用下， 反应 18.0h， 生成 N-(9-((2r,3r,4r,5r)-5-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3-甲氧基四氢呋喃-2-基)-6-氧代-6,9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺
  参考文献：
  名称：

  An Efficient Multigram Synthesis of Monomers for the Preparation of Novel Oligonucleotides Containing Isosteric Non-Phosphorous Backbones

  摘要：

  The facile preparation of two novel classes of nucleoside analogs for the inclusion as dimeric non-phosphorous containing subunits in chimeric backbones has been accomplished. The concise preparation of 3'-formylnucleosides and 5'-O-(N-methylhydroxylamino)-nucleosides is reported.

  DOI：

  10.1080/07328319708006242

文献信息

• PHOSPHORAMIDITE BUILDING BLOCKS FOR SUGAR-CONJUGATED OLIGONUCLEOTIDES
  申请人：AM CHEMICALS LLC

  公开号：US20160083414A1

  公开（公告）日：2016-03-24

  Novel nucleoside phosphoramidite building blocks for preparation of synthetic oligonucleotides containing at least one phosphotriester linkage conjugated to a monosaccharide and synthetic processes for making the same are disclosed. Furthermore, oligomeric compounds are prepared using said building blocks, preferably followed by removal of protecting groups to provide monosaccharide-conjugated oligonucleotides.

  揭示了用于制备含至少一种磷酸三酯键连接的寡核苷酸的合成寡核苷酸的新型核苷酸磷酰胺酯构建模块，其与单糖偶联，并公开了制备这些构建模块的合成过程。此外，使用这些构建模块制备寡聚合物化合物，最好是在去除保护基之后，以提供单糖偶联的寡核苷酸。
• Methods for synthesizing nucleosides, nucleoside derivatives and non-nucleoside derivatives
  申请人：——

  公开号：US20020120129A1

  公开（公告）日：2002-08-29

  The present invention provides methods for the chemical synthesis of nucleosides and derivatives thereof, including 2′-amino, 2′-N-phthaloyl, 2′-O-methyl, 2′-O-silyl, 2′OH nucleosides, C-nucleosides, nucleoside phosphoramidites, C-nucleoside phosphoramidites, and non-nucleoside derivatives.

  本发明提供了核苷及其衍生物的化学合成方法，包括2'-氨基、2'-N-邻苯二甲酰基、2'-O-甲基、2'-O-硅基、2'-OH 核苷、C-核苷、核苷磷酰胺酯、C-核苷磷酰胺酯和非核苷衍生物。
• Phosphoramidate Dinucleosides as Hepatitis C Virus Polymerase Inhibitors
  作者：Ivan Zlatev、Hélène Dutartre、Ivan Barvik、Johan Neyts、Bruno Canard、Jean-Jacques Vasseur、Karine Alvarez、François Morvan

  DOI：10.1021/jm800617c

  日期：2008.9.25

  GC dinucleosides exhibiting a phosphoramidate internucleosidic linkage with neutral, amphiphile, positively or negatively charged side chains were synthesized. Their potential inhibitory effect on the hepatitis C virus (HCV) NS5B polymerase was evaluated in vitro and in HCV replicon containing cells. Whereas the amphiphile and the positively charged analogues were found to be inactive, the neutral

  合成了表现出与中性、两亲性、带正电或带负电的侧链的氨基磷酸酯核苷间键合的GC二核苷。在体外和在含有 HCV 复制子的细胞中评估了它们对丙型肝炎病毒 (HCV) NS5B 聚合酶的潜在抑制作用。虽然发现两亲物和带正电的类似物是无活性的，但当作为非对映异构体混合物进行测试时，中性 (1) 和带负电 (4) 的类似物会抑制酶活性。最有效的抑制剂被证明是带有羧基侧链的 5'-硫代磷酸化二核苷酸的 Sp 异构体 (8)（体外 IC 50 为 25 microM，在 HCV 亚基因组复制子中 EC 50 为 9 microM）。
• 3′-Deoxy Phosphoramidate Dinucleosides as Improved Inhibitors of Hepatitis C Virus Subgenomic Replicon and NS5B Polymerase Activity
  作者：Stephane Priet、Ivan Zlatev、Ivan Barvik、Katrien Geerts、Pieter Leyssen、Johan Neyts、Helene Dutartre、Bruno Canard、Jean-Jacques Vasseur、François Morvan、Karine Alvarez

  DOI：10.1021/jm100102v

  日期：2010.9.23

  bis-negatively charged phosphoramidate side chains. Their inhibitory effect on HCV NS5B polymerase was evaluated in vitro and in HCV subgenomic replicon containing Huh-6 cells. As expected, 3′-H compounds are more potent than their 3′-OH counterparts to inhibit HCV polymerase activity. The most potent inhibitor, a 5′-phosphorylated dinucleotide bearing a bis-negatively charged amino side chain (7), exhibits an

  氨基磷酸酯双核苷命名为“GC 3'-OH”系列，携带各种氨基磷酸酯键，此前已报道为丙型肝炎病毒 (HCV) 抑制剂。为了提高这些二核苷酸的功效，我们合成了一种新的“GC 3'-H”系列作为潜在的链终止剂。我们表明，通过引入新的中性和双负电荷氨基磷酸酯侧链，它们的抑制效力大大提高。在体外和在含有 Huh-6 细胞的 HCV 亚基因组复制子中评估了它们对 HCV NS5B 聚合酶的抑制作用。正如预期的那样，3'-H 化合物比它们的 3'-OH 对应物更有效地抑制 HCV 聚合酶活性。最有效的抑制剂是一种带有双负电荷氨基侧链的 5'-磷酸化二核苷酸 ( 7 )，其 IC 值为50体外 8 μM 的值和 HCV 亚基因组复制子系统中的EC 50值为 2.6 μM。提出了一个分子结构模型来解释 3'-H-胞苷修饰所提供的增益。
• [EN] TRANSLATIONAL ENHANCERS AND RELATED METHODS<br/>[FR] AMPLIFICATEURS DE TRADUCTION ET PROCÉDÉS ASSOCIÉS
  申请人：EFFECTOR THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2021001739A1

  公开（公告）日：2021-01-07

  The present disclosure relates to novel translational enhancers comprising an eukaryotic initiation factor 4E (eIF4E) ligand attached to a dinucleotide. The present disclosure also relates to RNA molecules (e.g., mRNAs) comprising the novel translational enhancers, which imparts properties to the RNA molecules that are advantageous to therapeutic development, methods of using RNA molecules comprising such novel translational enhancers for therapeutic uses, as well as kits containing the translational enhancers.

  本公开涉及包含连接到二核苷酸的真核起始因子4E（eIF4E）配体的新型转译增强剂。本公开还涉及包含这些新型转译增强剂的RNA分子（例如mRNA），这些RNA分子赋予了对治疗开发有利的特性，以及使用包含这些新型转译增强剂的RNA分子进行治疗用途的方法，以及包含转译增强剂的试剂盒。