(6R,10S,11S,14R,15R)-15-[(2R,3R,4R,5R,6R)-4,5-dihydroxy-6-methyl-3-(methylamino)oxan-2-yl]oxy-6-hydroxy-7'-methoxy-5'-methyl-6-[(4R)-2-oxo-1,3-dioxolan-4-yl]spiro[13-oxatetracyclo[7.6.0.03,7.010,14]pentadeca-1(9),2,4,7-tetraene-11,1'-naphthalene]-2',12-dione

• 分子结构分类: 有机化合物 - 木脂素、新木脂素和相关化合物 - 木脂素苷
• 英文名称: (6R,10S,11S,14R,15R)-15-[(2R,3R,4R,5R,6R)-4,5-dihydroxy-6-methyl-3-(methylamino)oxan-2-yl]oxy-6-hydroxy-7'-methoxy-5'-methyl-6-[(4R)-2-oxo-1,3-dioxolan-4-yl]spiro[13-oxatetracyclo[7.6.0.03,7.010,14]pentadeca-1(9),2,4,7-tetraene-11,1'-naphthalene]-2',12-dione
• 化学式: C₃₅H₃₅NO₁₂
• 分子量: 661.662
• InChiKey: OBDNPHCYNBAIOJ-KDIFMUJMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.5
• 重原子数：
  48
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.46
• 拓扑面积：
  179
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  新制癌菌素载色体 在 Tris-HCl buffer 作用下， 以 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 (6R,10S,11S,14R,15R)-15-[(2R,3R,4R,5R,6R)-4,5-dihydroxy-6-methyl-3-(methylamino)oxan-2-yl]oxy-6-hydroxy-7'-methoxy-5'-methyl-6-[(4R)-2-oxo-1,3-dioxolan-4-yl]spiro[13-oxatetracyclo[7.6.0.03,7.010,14]pentadeca-1(9),2,4,7-tetraene-11,1'-naphthalene]-2',12-dione
  参考文献：
  名称：

  新卡他汀类药物产品通过诱导拟合机制识别凸起的DNA。

  摘要：

  抗肿瘤抗生素新carcarinostatin的荧光团的双自由基种类的楔形同构类似物与序列特异性凸起的DNA的结合导致DNA椭圆度的改变。圆二色性（CD）光谱结果表明，该药物通过构象选择和诱导拟合的组合而不是通过结合预先组织的位点来特异性识别DNA凸起。圆二色性光谱的分析表明，观察到的感应配合程度主要是优化范德华与凸腔壁接触的结果。有效识别双链体DNA上的凸起位点很大程度上取决于弯曲的凹槽空间是否足够柔韧性，以使其能够采用与楔形药物分子兼容的几何最佳构象，而不是涉及“锁和钥匙”的认可。光谱结果表明DNA构象的变化，与变构结合模型一致。用各种凸起的DNA进行的光谱研究还表明，结合强度与凸起结构的稳定性直接相关。

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(01)00432-1

文献信息

• Recognition of Bulged DNA by a Neocarzinostatin Product via an Induced Fit Mechanism
  作者：Catherine F. Yang、Patricia J. Jackson、Zhen Xi、Irving H. Goldberg

  DOI：10.1016/s0968-0896(01)00432-1

  日期：2002.5

  The binding of the wedge-shaped isostructural analogue of the biradical species of the chromphore of antitumor antibiotic neocarzinostatin to sequence-specific bulged DNAs results in alterations in ellipticity of the DNAs. Circular dichroism (CD) spectroscopic results suggest that the drug specifically recognizes bulges of DNA via a combination of conformational selection and induced fit, not by binding

  抗肿瘤抗生素新carcarinostatin的荧光团的双自由基种类的楔形同构类似物与序列特异性凸起的DNA的结合导致DNA椭圆度的改变。圆二色性（CD）光谱结果表明，该药物通过构象选择和诱导拟合的组合而不是通过结合预先组织的位点来特异性识别DNA凸起。圆二色性光谱的分析表明，观察到的感应配合程度主要是优化范德华与凸腔壁接触的结果。有效识别双链体DNA上的凸起位点很大程度上取决于弯曲的凹槽空间是否足够柔韧性，以使其能够采用与楔形药物分子兼容的几何最佳构象，而不是涉及“锁和钥匙”的认可。光谱结果表明DNA构象的变化，与变构结合模型一致。用各种凸起的DNA进行的光谱研究还表明，结合强度与凸起结构的稳定性直接相关。