N6-benzoyl-8N-(4-methoxyphenyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyadenosin-3'-yl-β-cyanoethyl-N,N'-diisopropylphosphoramidite | 916595-38-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N6-benzoyl-8N-(4-methoxyphenyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyadenosin-3'-yl-β-cyanoethyl-N,N'-diisopropylphosphoramidite
• 英文别名: N-[9-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-8-(4-methoxyanilino)purin-6-yl]benzamide
• CAS: 916595-38-5
• 化学式: C₅₄H₅₉N₈O₈P
• 分子量: 979.085
• InChiKey: QQIIKRASBMGUBG-NSWKOVOXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9
• 重原子数：
  71
• 可旋转键数：
  22
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  176
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N6-benzoyl-8N-(4-methoxyphenyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyadenosine 、 双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 在 4,5-二氰基咪唑 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.5h， 以75%的产率得到N6-benzoyl-8N-(4-methoxyphenyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyadenosin-3'-yl-β-cyanoethyl-N,N'-diisopropylphosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  c8-芳基胺嘌呤加合物对DNA链位点特异性损伤的合成及其对各种DNA聚合酶的影响。

  摘要：

  使用钯交叉偶联化学已经制备了C8-芳胺-dG和C8-芳基胺-dA加合物。随后将这些加合物转化为相应的5'-O-DMTr-C8-芳基胺-3'-O-亚磷酰胺，然后用于自动合成不同的位点特异性修饰的寡核苷酸。这些“损坏”的寡核苷酸已通过ESI-MS，UV热稳定性测定和圆二色性进行了表征，它们已用于EcoRI测定以及使用各种DNA聚合酶的引物延伸研究中。

  DOI：

  10.1002/chem.200800979

文献信息

• Synthesis of DNA Strands Site-Specifically Damaged by C8-Arylamine Purine Adducts and Effects on Various DNA Polymerases
  作者：Nicolas Böge、Maike I. Jacobsen、Zita Szombati、Sabrina Baerns、Francesca Di Pasquale、Andreas Marx、Chris Meier

  DOI：10.1002/chem.200800979

  日期：2008.12.8

  C8-Arylamine-dG and C8-arylamine-dA adducts have been prepared using palladium cross-coupling chemistry. These adducts were subsequently converted into the corresponding 5'-O-DMTr-C8-arylamine-3'-O-phosphoramidites and then used for the automated synthesis of different site-specifically modified oligonucleotides. These "damaged" oligonucleotides have been characterized by ESI-MS, UV thermal stability

  使用钯交叉偶联化学已经制备了C8-芳胺-dG和C8-芳基胺-dA加合物。随后将这些加合物转化为相应的5'-O-DMTr-C8-芳基胺-3'-O-亚磷酰胺，然后用于自动合成不同的位点特异性修饰的寡核苷酸。这些“损坏”的寡核苷酸已通过ESI-MS，UV热稳定性测定和圆二色性进行了表征，它们已用于EcoRI测定以及使用各种DNA聚合酶的引物延伸研究中。