2-[(4-Phenyldiazenylphenyl)methylsulfanyl]ethyl 6-aminohexanoate | 184006-74-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 偶氮苯
• 英文名称: 2-[(4-Phenyldiazenylphenyl)methylsulfanyl]ethyl 6-aminohexanoate
• CAS: 184006-74-4
• 化学式: C₂₁H₂₇N₃O₂S
• 分子量: 385.53
• InChiKey: LJFIIOHLTJMVFY-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.1
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  102
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-[(4-Phenyldiazenylphenyl)methylsulfanyl]ethyl 6-aminohexanoate 在 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.08h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Sinyakov; Ryabinin; Seregin, Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 1997, vol. 23, # 7, p. 502 - 510

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  叔丁氧羰酰基6-氨基己酸 在 4-二甲氨基吡啶 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.33h， 生成 2-[(4-Phenyldiazenylphenyl)methylsulfanyl]ethyl 6-aminohexanoate
  参考文献：
  名称：

  Sinyakov; Ryabinin; Seregin, Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 1997, vol. 23, # 7, p. 502 - 510

  摘要：

  DOI：

文献信息

• HYBRIDIZATION AND MISMATCH DISCRIMINATION USING OLIGONUCLEOTIDES CONJUGATED TO MINOR GROOVE BINDERS
  申请人：HEDGPETH JOEL

  公开号：US20090048427A1

  公开（公告）日：2009-02-19

  Conjugates between a minor groove binding molecule, such as the trimer of 1,2-dihydro-(3H)-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylate (CDPI 3 ), and an oligonucleotide form unusually stable hybrids with complementary target sequences, in which the tethered CDPI 3 group resides in the minor groove of the duplex. These conjugates can be used as probes and primers. Due to their unusually high binding affinity, conjugates as short as 8-mers can be used as amplification primers with high specificity and efficiency. MGB conjugation also increases the discriminatory power of short oligonucleotides, providing enhanced detection of nucleotide sequence mismatches by short oligonucleotides. The MGB-conjugated probes and primers described herein facilitate various analytic and diagnostic procedures, such as amplification reactions, PCR, detection of single-nucleotide polymorphisms, gene hunting, differential display, fluorescence energy transfer, hydrolyzable probe assays and others; by allowing the use of shorter oligonucleotides, which have higher specificity and better discriminatory power.

  一种小沟结合分子（例如1,2-二氢-（3H）-吡咯并[3,2-e]吲哚-7-羧酸三聚体（CDPI3））与寡核苷酸之间的共轭体形成与互补靶序列异常稳定的杂交体，在其中，被拴在一起的CDPI3基团位于双链的小沟中。这些共轭体可用作探针和引物。由于它们的结合亲和力异常高，因此即使是长度为8个碱基的共轭体也可用作具有高特异性和效率的扩增引物。MGB共轭还增加了短寡核苷酸的鉴别能力，通过短寡核苷酸提供了更好的核苷酸序列不匹配检测。所述的MGB共轭探针和引物可促进各种分析和诊断过程，例如扩增反应，PCR，单核苷酸多态性检测，基因寻找，差异显示，荧光能量转移，可水解探针测定等；通过使用更短的寡核苷酸，从而具有更高的特异性和更好的鉴别能力。
• US7794945B2
  申请人：——

  公开号：US7794945B2

  公开（公告）日：2010-09-14
• US8465921B2
  申请人：——

  公开号：US8465921B2

  公开（公告）日：2013-06-18
• Sinyakov; Ryabinin; Seregin, Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 1997, vol. 23, # 7, p. 502 - 510
  作者：Sinyakov、Ryabinin、Seregin、Lokhov、Kutyavin、Gamper、Mayer

  DOI：——

  日期：——