1-(2-amino-2-N-(6-N-benzoyladenin-9-ylacetyl)-2-deoxy-5-O-4,4'-dimethoxytrityl-2-N,4-C-methylene-β-D-ribofuranosyl)thymine | 1159764-41-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-(2-amino-2-N-(6-N-benzoyladenin-9-ylacetyl)-2-deoxy-5-O-4,4'-dimethoxytrityl-2-N,4-C-methylene-β-D-ribofuranosyl)thymine
• 英文别名: N-[9-[2-[(1R,3R,4R,7S)-1-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-7-hydroxy-3-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-5-yl]-2-oxoethyl]purin-6-yl]benzamide
• CAS: 1159764-41-6
• 化学式: C₄₆H₄₂N₈O₉
• 分子量: 850.888
• InChiKey: BZRHWSNVWLLFKV-WSVJZRDVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.6
• 重原子数：
  63
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  200
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(2-amino-2-N-(6-N-benzoyladenin-9-ylacetyl)-2-deoxy-5-O-4,4'-dimethoxytrityl-2-N,4-C-methylene-β-D-ribofuranosyl)thymine 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以85%的产率得到1-(2-amino-2-N-(6-N-benzoyladenin-9-ylacetyl)-3-O-(2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphinoxy)-2-deoxy-5-O-4,4'-dimethoxytrityl-2-N,4-C-methylene-β-D-ribofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  Functionalization of 2′-amino-LNA with additional nucleobases

  摘要：

  胸腺嘧啶-1-基乙酸和腺嘌呤-9-基乙酸已与2'-氨基-LNA胸腺核苷的N2'-原子结合，这些“双头”LNA单体已通过其相应的磷酰胺衍生物被纳入寡脱氧核糖核酸中。含有这些修饰核苷的寡核苷酸在与互补DNA形成双链时，通常显示出更高的热稳定性，甚至允许多次纳入。在两条链中都纳入“双头”LNA单体也导致了稳定的双链形成，但未能发现额外核苷碱基之间的沃森–克里克配对的迹象。

  DOI：

  10.1039/b901028a
• 作为产物：
  描述：

  9H-嘌呤-9-乙酸,6-(苯甲酰氨基)- 、 [(1R,3R,4R,7S)-1-(4,4′-dimethoxytrityloxymethyl)-7-hydroxy-3-(thymin-1-yl)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane] 在 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 以99%的产率得到1-(2-amino-2-N-(6-N-benzoyladenin-9-ylacetyl)-2-deoxy-5-O-4,4'-dimethoxytrityl-2-N,4-C-methylene-β-D-ribofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  Functionalization of 2′-amino-LNA with additional nucleobases

  摘要：

  胸腺嘧啶-1-基乙酸和腺嘌呤-9-基乙酸已与2'-氨基-LNA胸腺核苷的N2'-原子结合，这些“双头”LNA单体已通过其相应的磷酰胺衍生物被纳入寡脱氧核糖核酸中。含有这些修饰核苷的寡核苷酸在与互补DNA形成双链时，通常显示出更高的热稳定性，甚至允许多次纳入。在两条链中都纳入“双头”LNA单体也导致了稳定的双链形成，但未能发现额外核苷碱基之间的沃森–克里克配对的迹象。

  DOI：

  10.1039/b901028a