N⁶-Benzoyl-3'-O-<(tert-butyl)dimethylsilyl>-5'-O-(monomethoxytrityl)adenosine 2'-<2-(4-Nitrophenyl)ethyl N,N-Octamethylenephosphoramidite> | 121409-41-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N⁶-Benzoyl-3'-O-<(tert-butyl)dimethylsilyl>-5'-O-(monomethoxytrityl)adenosine 2'-<2-(4-Nitrophenyl)ethyl N,N-Octamethylenephosphoramidite>
• 英文别名: N⁶-Benzoyl-3'-O-[(tert-butyl)dimethylsilyl]-5'-O-(monomethoxytrityl)adenosine 2'-[2-(4-Nitrophenyl)ethyl N,N-Octamethylenephosphoramidite]；N-[9-[(2R,3R,4R,5R)-3-[azonan-1-yl-[2-(4-nitrophenyl)ethoxy]phosphanyl]oxy-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethoxy]methyl]oxolan-2-yl]purin-6-yl]benzamide
• CAS: 121409-41-4
• 化学式: C₅₉H₇₀N₇O₉PSi
• 分子量: 1080.31
• InChiKey: RBGZYXHWBLCXBQ-QQSMEBDGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  12.82
• 重原子数：
  77.0
• 可旋转键数：
  20.0
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  174.46
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  14.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁶-Benzoyl-2',3'-bis-(O-tert-butyldimethylsilyl)adenosin 、 N⁶-Benzoyl-3'-O-<(tert-butyl)dimethylsilyl>-5'-O-(monomethoxytrityl)adenosine 2'-<2-(4-Nitrophenyl)ethyl N,N-Octamethylenephosphoramidite> 在 吡啶 、 sulfur 、 3-硝基-1,2,4-三氮唑 作用下， 生成 (PS)-N⁶-benzoyl-3'-O-<(tert-butyl)dimethylsilyl>-5'-O-(monomethoxytrityl)-P-thioadenylyl<2'-P-<2-(4-nitrophenyl)ethyl>>->5'>-N⁶-benzoyl-2',3'-bis-O-<(tert-butyl)dimethylsilyl>adenosine 、 (PR)-N⁶-benzoyl-3'-O-<(tert-butyl)dimethylsilyl>-5'-O-(monomethoxytrityl)-P-thioadenylyl<2'-P-<2-(4-nitrophenyl)ethyl>>->5'>-N⁶-benzoyl-2',3'-bis-O-<(tert-butyl)dimethylsilyl>adenosine
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。部分三十八..合成和（2'-5'）腺苷酸二聚体和三聚体和他们的5'-硫代磷酸酯类似物的表征Ø -monophosphates † ‡

  摘要：

  （2'-5'）腺苷酸二聚体（参见6a，6b）和三聚体（参见11a，11b，12a，12b）的硫代磷酸酯及其5'-单磷酸酯（参见15a，15b，16a）的化学合成图16b）描述了使用亚磷酰胺方法。通过色谱方法将得到的非对映异构体混合物分离成纯组分。所有合成中间体均通过TLC，元素分析，UV和1 H-NMR光谱进行表征。

  DOI：

  10.1002/hlca.19920750206
• 作为产物：
  描述：

  N⁶-benzoyl-3'-O-<(tert-butyl)dimethylsilyl>-5'-O-(monomethoxytrityl)adenosine 、 chloro<2-(4-nitrophenyl)ethoxy>(octahydro-1H-azonin-1-yl)phosphane 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 以97%的产率得到N⁶-Benzoyl-3'-O-<(tert-butyl)dimethylsilyl>-5'-O-(monomethoxytrityl)adenosine 2'-<2-(4-Nitrophenyl)ethyl N,N-Octamethylenephosphoramidite>
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。部分三十八..合成和（2'-5'）腺苷酸二聚体和三聚体和他们的5'-硫代磷酸酯类似物的表征Ø -monophosphates † ‡

  摘要：

  （2'-5'）腺苷酸二聚体（参见6a，6b）和三聚体（参见11a，11b，12a，12b）的硫代磷酸酯及其5'-单磷酸酯（参见15a，15b，16a）的化学合成图16b）描述了使用亚磷酰胺方法。通过色谱方法将得到的非对映异构体混合物分离成纯组分。所有合成中间体均通过TLC，元素分析，UV和1 H-NMR光谱进行表征。

  DOI：

  10.1002/hlca.19920750206