4-[(2R,3S,5R)-5-(thymin-1-yl)-2-(trityloxymethyl)tetrahydrofuran-3-yloxy]-4-oxobutanoic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 4-[(2R,3S,5R)-5-(thymin-1-yl)-2-(trityloxymethyl)tetrahydrofuran-3-yloxy]-4-oxobutanoic acid
• 英文别名: 5'-O-tritylthymidine-3'-O-succinate；4-[(2R,3S,5R)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2-(trityloxymethyl)oxolan-3-yl]oxy-4-oxobutanoic acid
• 化学式: C₃₃H₃₂N₂O₈
• 分子量: 584.626
• InChiKey: LPHLSPRFHKFSKZ-UPRLRBBYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  132
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-[(2R,3S,5R)-5-(thymin-1-yl)-2-(trityloxymethyl)tetrahydrofuran-3-yloxy]-4-oxobutanoic acid 在 4-二甲氨基吡啶 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 (benzotriazo-1-yloxy)tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 1-O-[2-[(2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-methylbutanoyl]oxyethyl] 4-O-[(2R,3S,5R)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2-(trityloxymethyl)oxolan-3-yl] butanedioate
  参考文献：
  名称：

  5'-Trityl-取代的胸苷衍生物作为一类新型的抗利什曼病药物：婴儿利什曼原虫EndoG作为潜在靶标

  摘要：

  合成了两个5'-三苯甲基（三苯甲基）取代的胸腺嘧啶衍生物系列，并针对婴儿利什曼原虫的轴突前鞭毛体和变形虫进行了测试。这些化合物中的几种显示出显着的抗菌活性，IC 50值在低微摩尔范围内。其中，3'- O-（异亮环烯基）-5'- O-（3,3,3-三苯基丙酰基）胸苷对细胞内的变形虫表现出特别好的活性。在三苯甲基胸腺嘧啶脱氧核苷的存在下进行的表征寄生虫细胞死亡的性质的测定表明，在细胞死亡过程中，线粒体跨膜电位发生了显着变化，超氧化物浓度增加，DNA降解也显着减少。结果表明，线粒体核酸酶LiEndoG是该化合物家族作用的靶标。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201300129
• 作为产物：
  描述：

  丁二酸酐 、 5'-O-tritylthymidine 在 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 7.0h， 以82%的产率得到4-[(2R,3S,5R)-5-(thymin-1-yl)-2-(trityloxymethyl)tetrahydrofuran-3-yloxy]-4-oxobutanoic acid
  参考文献：
  名称：

  5'-Trityl-取代的胸苷衍生物作为一类新型的抗利什曼病药物：婴儿利什曼原虫EndoG作为潜在靶标

  摘要：

  合成了两个5'-三苯甲基（三苯甲基）取代的胸腺嘧啶衍生物系列，并针对婴儿利什曼原虫的轴突前鞭毛体和变形虫进行了测试。这些化合物中的几种显示出显着的抗菌活性，IC 50值在低微摩尔范围内。其中，3'- O-（异亮环烯基）-5'- O-（3,3,3-三苯基丙酰基）胸苷对细胞内的变形虫表现出特别好的活性。在三苯甲基胸腺嘧啶脱氧核苷的存在下进行的表征寄生虫细胞死亡的性质的测定表明，在细胞死亡过程中，线粒体跨膜电位发生了显着变化，超氧化物浓度增加，DNA降解也显着减少。结果表明，线粒体核酸酶LiEndoG是该化合物家族作用的靶标。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201300129

文献信息

• Polymer support oligonucleotide synthesis-XV
  作者：H. Köster、J. Biernat、J. McManus、A. Wolter、A. Stumpe、Ch.K. Narang、N.D. Sinha

  DOI：10.1016/0040-4020(84)85108-x

  日期：1984.1

  synthesize d(TTTATT) and d(CATCAGGAAGT) following the phosphate triester approach with 1-(mesitylene-2-sulfonyl)-3-nitro-1,2,4-triazole (MSNT) as condensing agent and ZnBr2; as detritylating agent. The efficiency of monomer and dimer additions is discussed. The nonamer d(AACCAGCAC) has been synthesized by a modified phosphite triester approach using suitably protected methyl deoxynucleoside-N-morp

  受控孔玻璃（CPG）已用适当保护的脱氧核苷进行了功能化，并按照磷酸三酯法与1-（均三甲苯-2-磺酰基）-3-硝基-1,2，用于合成d（TTTATT）和d（CATCAGGAAGT），以4-三唑（MSNT）为缩合剂和ZnBr 2；作为去三苯胺剂。讨论了单体和二聚体添加的效率。通过使用适当保护的甲基脱氧核苷-N-吗啉代-磷酰胺基作为新的活性磷酸化核苷酸，通过改良的亚磷酸三酯方法合成了九聚体d（AACCAGCAC）。该序列是通过在用四唑活化亚磷酰胺，用乙酸酐/ DMAP封端以及用ZnBr 2进行去三苯甲基化后添加单体来建立的; （嘌呤核苷酸）或三氯乙酸（嘧啶核苷酸）。通过用苯硫酚，浓氨水和叔胺处理进行脱保护。丁胺和九聚体的特征为反相hplc，聚丙烯酰胺凝胶电泳和序列测定。讨论了CPG作为寡核苷酸合成载体的有利性质。
• 5′-Trityl-Substituted Thymidine Derivatives as a Novel Class of Antileishmanial Agents:<i>Leishmania infantum</i>EndoG as a Potential Target
  作者：Elena Casanova、David Moreno、Alba Gigante、Eva Rico、Carlos Mario Genes、Cristina Oliva、María-José Camarasa、Federico Gago、Antonio Jiménez-Ruiz、María-Jesús Pérez-Pérez

  DOI：10.1002/cmdc.201300129

  日期：2013.7

  Two series of 5′‐triphenylmethyl (trityl)‐substituted thymidine derivatives were synthesized and tested against Leishmania infantum axenic promastigotes and amastigotes. Several of these compounds show significant antileishmanial activity, with IC50 values in the low micromolar range. Among these, 3′‐O‐(isoleucylisoleucyl)‐5′‐O‐(3,3,3‐triphenylpropanoyl)thymidine displays particularly good activity

  合成了两个5'-三苯甲基（三苯甲基）取代的胸腺嘧啶衍生物系列，并针对婴儿利什曼原虫的轴突前鞭毛体和变形虫进行了测试。这些化合物中的几种显示出显着的抗菌活性，IC 50值在低微摩尔范围内。其中，3'- O-（异亮环烯基）-5'- O-（3,3,3-三苯基丙酰基）胸苷对细胞内的变形虫表现出特别好的活性。在三苯甲基胸腺嘧啶脱氧核苷的存在下进行的表征寄生虫细胞死亡的性质的测定表明，在细胞死亡过程中，线粒体跨膜电位发生了显着变化，超氧化物浓度增加，DNA降解也显着减少。结果表明，线粒体核酸酶LiEndoG是该化合物家族作用的靶标。